Název:
Strukturní a funkční analýza faktorů virulence mikroba Francisella tularensis.
Překlad názvu:
Structural and functional analysis of Francisella tularensis virulence factors
Autoři:
Šenitková, Iva ; Hernychová, Lenka (oponent) Typ dokumentu: Rigorózní práce
Rok:
2017
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Předkládaná dizertační práce je zaměřena na studium vztahu struktury a funkce lipoproteinu FTS_1067 gram-negativní bakterie Francisella tularensis subsp. holarctica kmen FSC200. Tento protein s unikátní strukturou tvořenou dvěma funkčními doménami se významně podílí na virulenci bakterie, nicméně role obou domén nebyla dříve objasněna. Ačkoli je tento protein běžně nazýván virulenčním faktorem, z nejnovějších studií vyplývá, že pravými faktory virulence jsou substráty tohoto proteinu a protein FTS_1067 je nezbytný pro jejich správnou funkci. Pomocí metod molekulární biologie se podařilo připravit nový mutantní kmen s delecí DSBA-like domény a tento mutantní kmen charakterizovat na in vivo a in vitro úrovni. Dále byl připraven rekombinantní protein se shodnou delecí a s tímto proteinem bylo provedeno několik funkčních testů. Následnou analýzou získaných výsledků a jejich srovnáním s některými předchozími studiemi jsme vypracovali první komplexní zprávu ukazující role obou domén v rámci celého proteinu. Pro doplnění informací o zapojení proteinu FTS_1067 do mechanizmů virulence bakterie jsme se pokusili ověřit vytipované vazebné partnery a potenciální substráty pomocí analýz využívajících bakteriální dvouhybridový systém.The presented thesis is focused on the relationship between the structure and the function of Francisella tularensis subsp. holarctica strain FSC200 FTS_1067 lipoprotein. This protein with unique structure constituted by two functional domains is involved in the virulence of bacteria, nevertheless the roles of both domains have not been previously clarified yet. Although this protein is usually denoted as a factor of virulence, the previous studies have shown that its substrates are the real virulence factors and that FTS_1067 protein is necessary for their proper function. We created and after that characterized in vivo and in vitro the new mutant strain with the deletion of DSBA-like domain. Afterwards we prepared the recombinant protein with the same deletion and made several tests focused on the understanding of the protein function. From the analyses of these results and their comparison with previous studies we elaborated the first comprehensive report about the roles of both domains in the context of the whole protein. To supplement the information about the involvement of the FTS_1067 protein in the mechanism of virulence we tried to verify its potencial substrates by using bacterial two hybrid assay.