Original title:
Charakteristické aspekty populační genetiky živočichů s parazitickou životní strategií
Translated title:
Characteristic population genetics features of animals with parasitic life strategy
Authors:
Kodejš, Karel ; Straka, Jakub (advisor) ; Synek, Petr (referee) Document type: Bachelor's theses
Year:
2014
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Parazitické organismy se vyznačují velmi těsnou vazbou na své hostitele. Díky tomu může jejich populační historie, nebo obecně fylogeneze, odrážet historii těchto hostitelů. Zatímco za pomoci morfologických charakteristik lze výzkum koevoluce provést jen na vyšší, minimálně druhové úrovni, rozvoj molekulárních technik a především zavedení selekčně neutrálních markerů v současné době umožnil hlubší náhled do této problematiky. Tato práce popisuje genetické markery používané pro studium populační dynamiky, se zaměřením na parazitické živočichy a shrnuje jejich výhody a nevýhody při užití v populační genetice a jejich možné aplikace Dále se zabývá statistickým aparátem využívaným při studiu koevoluce hostitelsko-parazitických systémů, zvláště rekonstrukce koevoluční historie. Popisuje základní statistické algoritmy používané pro hodnocení míry strukturalizace populací a jejich aplikaci. V poslední části se zabývá faktory životního cyklu parazitů a jejich hostitelů, které ovlivňují charakter jejich koevoluce. Zabývá se dopadem různé míry hostitelské specifity, složitosti životního cyklu, mobilitě hostitele a životních stadií parazitů na výslednou strukturu koevoluční historie. Klíčová slova: parazitismus, populační genetika, genetické markery, koevoluce, biostatistika, mikrosatelityOrganisms with parasitic life strategy are characterized by strong bond to their hosts. Becouse of that can their population history, or more generaly their phylogeny, reflect evolutionary history of the hosts. While with morphological markers alone, coevolution can be examined only at higher, at least species level, the development of molecular techniques, especially usage of selectively neutral markers, provides deeper insight in this problematics. This thesis describes genetic markers used to investigate population dynamics, with emphasis to parasitic animals, and sumarises their advantages, limitations and possible applications. Further it describes statistical methods used in coevolutionary studies, mainly to reconstruct coevolutionary history. It describes basic statistical algorhytms to characterize rate of population subdivision. In the last part it describes parasite and host's life history features, which influence characteristics of coevolution, such as rate of host specificity, complexity of life cycle, host and parasite's mobility, which has impact to final coevolutionary pattern. Keywords: parasitism, population genetics, genetic markers, coevolution, biostatistics, microsatellites
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/72832