Název:
Identifikace vláknitého viru infikující jetel luční (\kur{Trifolium pratense})
Překlad názvu:
Identification of filamentous virus which infected red clover (\kur{Trifolium pratense})
Autoři:
BEČKOVÁ, Martina Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2007
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Vzorky jetele lučního, vyznačující se zakrslostí rostliny, byly prozkoumány pomocí transmisní elektronové mikroskopie. Nejčastěji se ve vzorcích vyskytovaly vláknité částice dlouhé 300 až 800 nm. Byla izolována nukleová kyselina, přepsána a amplifikována pomocí PCR s potexvirovými a potyvirovými specifickými primery 353G1, 353G2 (Petrzik, K., nepublikované údaje), P9502, P0502 (Revers et al., 1999) a Poty2/P4 (Gibbs and Mackenzie, 1997). Úspěšná amplifikace s potexvirovými specifickými primery, sekvenace a porovnání se sekvencemi v databázi GenBank odhalilo virus mozaiky jetele plazivého (WClMV, White clover mosaic virus). Amplifikací byl získán gen obalového proteinu toho viru a porovnán s kompletní sekvencí WClMV z GenBank. Virus byl identifikován jako kmen O.Samples of red clover plants characteristic with dwarf growth were investigated with transmission electron microscopy. Most frequent virus particles observed there were filamentous ones of 300 to 800 nm long. Nucleic acid was isolated, transcribed and amplified using PCR with potexvirus- and potyvirus-specific primers 353G1, 353G2 (Petrzik, K., unpublished data), P9502, P0502 (Revers et al., 1999) and Poty2/P4 (Gibbs and Mackenzie, 1997). Successful amplification with potexvirus-specific primers, sequencing and comparison with GenBank sequences revealed White clover mosaic virus (WClMV) there. Coat protein gene of this virus was obtained with amplification and compared with complete sequence of WClMV from GenBank. O-strain of WClMV was identified.
Klíčová slova:
jetel luční; potexvirus; potyvirus; virus; virus mozaiky jetele plazivého; WClMV; potexvirus; potyvirus; red clover; virus; WClMV; White clover mosaic virus Citace: BEČKOVÁ, Martina. Identifikace vláknitého viru infikující jetel luční (\kur{Trifolium pratense}). České Budějovice, 2007. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta
Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
(web)
Informace o dostupnosti dokumentu:
Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU. Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/3929