Original title: Nekódující kontrolní oblast genomu lidských polyomavirů
Translated title: The noncoding control region of human polyomaviruses
Authors: Pešek, David ; Saláková, Martina (advisor) ; Váňová, Jana (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2021
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Genom lidských polyomavirů sestává přibližně z 5000pb kruhové dvouřetězcové DNA a je rozdělován na tři funkční oblasti - časnou oblast (early viral gene region, EVGR) kódující regulační T antigeny a virové miRNA, nekódující kontrolní oblast (noncoding control region, NCCR) obsahující minimální cis-působící regulační sekvence, které jsou potřebné pro správný průběh virové replikace a pozdní oblast (late viral gene region, LVGR), který je zodpovědný za produkci strukturních kapsidových proteinů. Nekódující kontrolní oblast obsahuje minimální počátek replikace, který se vzájemně překrývá s promotory pro časnou i pozdní transkripci. Sekvence nekódující kontrolní oblasti zahrnují velké množství vazebných míst pro buněčné transkripční faktory, které mají schopnost regulovat expresi z LVGR a EVGR. V této práci byla popsána organizace nejvariabilnější oblasti polyomavirového genomu, NCCR, u polyomavirů SV40, BKPyV a JCPyV. V nekódující kontrolní oblasti často dochází k přestavbám, delecím, a dokonce i k bodovým mutacím, které mají dopad na expresi polyomaviru. Klíčová slova: polyomaviry, nekódující kontrolní oblast, BKPyV , JCPyV , SV40, velký T antigen, buněčné transkripční faktory Genome of human polyomavirus consists of circular dsDNA around 5000 base and can be divided into three functional regions - the early viral gene region (EVGR), that encodes the regulatory T antigen and miRNAs, noncoding control region (NCCR) harboring the minimal cis- acting elements involved in viral replication and the late viral gene region (LVGR), that encodes the structural capsid proteins. Noncoding control region contains the origin of viral replication that overlaps the promoters that control expresion of early and late gene region. Noncoding control region sequences include a large number of various binding sites for cellular transcription factors involved in regulation expression from LVGR and EVGR. This thesis describes the organization of the most variable region of the PyV genome, NCCR, in chosen polyomaviruses SV40, BKPyV and JCPyV. This region often undergoes rearrangements, deletion and point mutations that affects exression of human polyomavirus. Key words: polyomavirus, noncoding control region, BKPyV virus, JCPyV virus, SV40, large T antigen, transcriptional factor
Keywords: BKPyV; JCPyV; large T antigen; noncoding control region; Polyomavirus; SV40; transcriptional factor; BKPyV; buněčné transkripční faktory; JCPyV; nekódující kontrolní oblast; Polyomavirus; SV40; velký T antigen

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/151099

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-452867


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses