Název: Analýza lokálních struktur v molekulách DNA
Překlad názvu: Analysis of local structures in DNA molecules
Autoři: Nyczová, Adéla ; Smetana, Jan (oponent) ; Brázda, Václav (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2021
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstrakt: [cze] [eng]
Lokální struktury DNA jsou alternativními konformacemi, které dokáže DNA zaujímat oproti nejběžnější konformaci B-DNA. Tyto struktury hrají často zásadní roli v regulaci základních biologických procesů, jako je replikace DNA, transkripce či vazba specifických ligandů. Díky tomuto biologickému významu jsou alternativní sekundární struktury DNA potenciálním cílem řady léčiv. V této diplomové práci jsou pomocí bioinformatických nástrojů analyzovány lokální struktury v genomech virů z čeledí Flaviviridae a Retroviridae a následně jsou tyto struktury zobrazeny pomocí atomové silové mikroskopie. Local DNA structures are alternative DNA conformations which can be formed aside from typical B-DNA conformation. These structures often play pivotal roles in regulation of basic biological processes, such as DNA replication, transcription or binding of specific ligands. This biological significance makes alternative DNA secondary structures a potential drug target. In this diploma thesis, local structures in genomes of viruses from Flaviviridae and Retroviridae families are analysed using bioinformatics tools. Furthermore, these structures are visualised using atomic force microscopy.
Klíčová slova: AFM; bioinformatická analýza; DNA; kvadruplex; křížová struktura; viry; AFM; bioinformatics analysis; cruciform structure; DNA; quadruplex; viruses

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/199767

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-445146


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce