Original title:
Porovnání bakteriálních genomů získaných z druhé a třetí generace sekvenátorů.
Translated title:
Comparison of bacterial genomes obtained from second and third generation sequencing
Authors:
Rumlerová, Tereza ; Škutková, Helena (referee) ; Nykrýnová, Markéta (advisor) Document type: Bachelor's theses
Year:
2021
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Tato bakalářská práce se zabývá sekvenačními technologiemi se zaměřením především na druhou a třetí generaci sekvenátorů a platformy Illumina Miseq a Oxford Nanopore Technologies MinION. Je zde uveden popis sestavování genomů s praktickou ukázkou sestavení 6 genomů bakterie Klebsiella pneumoniae poskytnuté FN Brno a testování kvality těchto genomů. Závěrečná část obsahuje teoretický popis a praktickou implementaci vybraných metod pro porovnání sestavených genomů pocházejících z dvou odlišných sekvenačních platforem.
This bachelor thesis deals with sequencing technologies with a focus on the second and third generation of sequencers and platforms Illumina Miseq and Oxford Nanopore Technologies MinION. There is a description of an assembly of genomes with an example of the assembly of 6 genomes of a bacteria Klebsiella pneumoniae and a quality testing of these genomes. The final part contains a theoretical description and a practical implementation of selected methods for comparison of the assembled genomes, which come from two different sequencing platforms.
Keywords:
comparison of bacterial genomes; genome assembly; Sequencing technology; porovnání bakteriálních genomů; Sekvenační technologie; sestavování genomu
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/198489