Original title:
Proteinová chemie a hmostnostní spektrometrie v biochemickém výzkumu
Translated title:
Protein chemistry and mass spectrometry in biochemical research
Authors:
Pompach, Petr Document type: Rigorous theses
Year:
2015
Language:
eng Abstract:
[eng][cze] Protein chemistry and mass spectrometry in biochemical research Petr Pompach Ph. D. Thesis (2006) Department of Biochemistry, Faculty of Science, Charles University Abstract Mass spectrometry is a fast and growing analytical approach frequently used not only for detection of small molecules, but also for detection and characterization of macromolecules such as proteins and peptides. The presented PhD thesis summarizes several mass spectrometric applications for identification and characterization of proteins in complex biological matrices, applications for determination of protein structures and characterization of posttranslational modifications. Analytical methods are described in different chapters and include: separation of protein/peptides by two dimensional SDS electrophoresis, separation of proteins/peptides by high performance liquid chromatography, protein sequencing by Edman degradation, etc. As an example of the usage of mass spectrometry for identification of proteins, a method for enrichment followed by characterization of proteins associated with membrane microdomains is shown. For determination of proteins structure by mass spectrometry, chemical cross-linking is usually used. The length of spacer arm of the cross-linker determines the distance constrains between modified amino acids. The...Proteinová chemie a hmotnostní spektrometrie v biochemickém výzkumu Petr Pompach Disertační práce (2006) Katedra Biochemie, Přírodovědecká Fakulta Univerzity Karlovy Abstrakt Hmotnostní spektrometrie se díky svému velmi rychlému rozvoji zařadila mezi oblíbené analytické metody nejen pro detekci malých molekul, ale i pro detekci makromolekul, jakými jsou například proteiny. V této disertační práci jsou shrnuty některé aplikace hmotnostní spektrometrie jednak pro nalezení a popsání jednotlivých proteinů v komplexních směsích, tak i aplikace pro řešení struktury proteinů a jejich postranslačních modifikací. V jednotlivých kapitolách jsou popsány poslední poznatky o analytických přístupech zahrnující separaci proteinů pomocí dvoudimenzionální elektroforézy, vysokoúčinnou separaci proteinů/peptidů na kolonách s obrácenou fází, dále potom sekvenace proteinů Edmanovým odbouráváním, atd. Jako příklad využití hmotnostní spektrometrie pro identifikaci proteinů je v této práci ukázána metoda pro nabohacení a následnou charakterizaci proteinů asociovaných s tzv. membránovými mikrodoménami. Pro řešení struktury proteinů pomocí hmotnostní spektrometrie se využívá její spojení s metodami proteinové chemie, konktrétně reakcí proteinů s tzv. zesíťovacími činidly. Délka raménka zesíťovacího činidla určuje poté vzdálenost...
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/68165
guest ::
