Original title: Adaptivní změny rozšíření populací v odpovědi na klimatické změny
Translated title: Adaptive population shifts in response to climate change
Authors: Horníková, Michaela ; Kotlík, Petr (advisor) ; Munclinger, Pavel (referee) ; Bryja, Josef (referee)
Document type: Doctoral theses
Year: 2021
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Adaptive population shifts in response to climate change Ing. Michaela Horníková, Doctoral thesis Abstract Understanding of species' reactions to past climate and environmental changes is a hot topic in many fields of biology as it is relevant also for addressing species' future under the contemporary climate change. Using an emerging model species, the bank vole, I combine genomic phylogeographic data with information on known intraspecific functional variability and environmental niche modelling and aim to elucidate the particular role of intraspecific variation and ultimately selection in shaping the species' response to the climatic and environmental changes after the end of the last glaciation. Based on the mtDNA markers, bank voles exhibit a complex phylogeographic pattern suggesting population replacement events during the postglacial recolonization of Europe and thus possible involvement of selection in the process. An extensive dataset of more than 6000 SNPs was used to search for signs of population replacement in the bank vole genomic DNA and to investigate the species' postglacial recolonization history throughout its European distribution range. The genomic data revealed even more complex population history than previously detected with mtDNA markers, including not only admixture but also... Adaptive population shifts in response to climate change Ing. Michaela Horníková, Doctoral thesis Abstrakt Porozumění tomu, jak druhy reagovaly na změny klimatu a prostředí v minulosti, je žhavým tématem v mnoha oborech biologie, jelikož je relevantní i pro řešení otázky budoucnosti druhů pod vlivem současných klimatických změn. S využitím modelového druhu norníka rudého propojuji genomická fylogeografická data s informacemi o známé vnitrodruhové funkční variabilitě a environmentálním modelováním nik a zaměřuji se na objasnění konkrétní úlohy vnitrodruhové variability a selekce v utváření odpovědi tohoto druhu na klimatické a environmentální změny po skončení posledního zalednění. Norník rudý vykazuje podle mtDNA markerů komplexní fylogeografický pattern, naznačující nahrazení populací během postglaciální kolonizace Evropy a tedy možný vliv selekce v tomto procesu. K pátrání po známkách nahrazení populací v genomické DNA norníka rudého a k prozkoumání postglaciální rekolonizační historie v rámci jeho evropského areálu rozšíření jsme použili rozsáhlý datový soubor s více než 6000 SNP. Genomická data odhalila ještě složitější populační historii, než byla dříve detekována pomocí mtDNA, zahrnující nejen nahrazení populací, ale také příměs mezi vnitrodruhovými liniemi pocházejícími z různých glaciálních refugií....
Keywords: bank vole;Clethrionomys glareolus;ecological niche modelling;GBS;genotyping-by-sequencing;glacial refugia;haemoglobin;next-generation sequencing;phylogeography;post-glacial colonization; Clethrionomys glareolus;fylogeografie;GBS;genotypování sekvenováním;glaciální refugia;hemoglobin;modelovaní ekologických nik;norník rudý;postglaciální kolonizace;sekvenování nové generace

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/125094

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-438693


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses