Original title: Genetická variabilita druhu Physconia muscigena (Physciaceae, Ascomycota) na severní polokouli
Translated title: Genetic variability in the Physconia muscigena group (Physciaceae, Ascomycota) in the Northern Hemisphere
Authors: Starosta, Jakub ; Koukol, Ondřej (advisor) ; Steinová, Jana (referee)
Document type: Rigorous theses
Year: 2020
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Hlavním cílem studie bylo zjistit, zda je lišejník Physconia muscigena dobře definovaný druh nebo zda chemické a ekologické odlišnosti jednotlivých populací odhalí přítomnost více druhů. V analýzách jsme používali sekvenční data ze tří úseků DNA (ITS rDNA, mtSSU rDNA a TEF1 α) pro rekonstrukci fylogenetických stromů. Sběry druhů P. muscigena, P. muscigena var. bayeri a P. isidiomuscigena probíhaly hlavně v Evropě a Kanadě. Dále jsme se snažili najít ekologické a geografické trendy mezi jednotlivými chemotypy a haplotypy. Z vyhodnocených dat vyplývá: 1) Sekvenční data úseků ITS rDNA a TEF1-α ukazují velikou genetickou variabilitu druhu Physconia muscigena, která nesouvisí s geografickým původem ani chemismem stélek. 2) Taxony P. muscigena var. bayeri a P. isidiomuscigena spadají ve fylogenetickém stromě do jedné linie a nelze je od sebe na základě úseků ITS rDNA, mtSSU rDNA a TEF1-α odlišit. 3) Synonymizovali jsme druh P. muscigena var. bayeri s druhem P. muscigena a vytvořili novou kombinaci pro druh P. isidiomuscigena jako varieta druhu P. muscigena. The principal goal of our study was to test whether ecologically and chemically different populations of lichens in the Physconia muscigena (Ach.) Poelt group belong to multiple species or one. We used sequence data from three markers (ITS rDNA, mtSSU rDNA and TEF1-α) for the reconstruction of phylogenetic trees based on a sampling of mostly European and Canadian populations of P. muscigena (Ach.) Poelt, P. muscigena var. bayeri (Nádv.) Poelt, and P. isidiomuscigena Essl. Further, we sought any possible geographical or ecological trends among chemotypes and haplotypes. Results show that: 1) Sequence data of ITS rDNA and TEF1-α shows large genetic variation in the Physconia muscigena group. This genetic variability does not correlate with geographical distribution or thallus chemistry; 2) Physconia muscigena var. bayeri and P. isidiomuscigena appear undifferentiated in our phylogenetic trees with P. muscigena. These three species cannot be distinguished on the basis of ITS rDNA, mtSSU rDNA and TEF1-α sequences. 3) We synonymized Physconia muscigena var. bayeri with P. muscigena and we recombine P. isidiomuscigena as a variety of P. muscigena.

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/123576

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-437028


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Rigorous theses