Original title: Imunoskóre ve 3D tkáních
Translated title: Immunoscore in 3D tissue
Authors: Novák, Jaromír ; Drbal, Karel (advisor) ; Procházka, Jan (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2020
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Pevné nádory představují komplexní struktury, které zahrnují kromě transformovaných buněk cévy, složky extracelulární matrix (ECM), rozpustné molekuly a širokou paletu různých typů buněk. Tyto složky dohromady tvoří nádorové mikroprostředí. Z buněčných typů, které jsou součástí nádorového mikroprostředí, mají největší vliv na prognózu pacienta tumor infiltrující lymfocyty (TIL). Jejich přítomnost navíc nabývá na významu i s rozvojem biologických terapií immune checkpoint inhibitory (ICIs). Stěžejní roli TIL reflektují i nové přístupy v diagnostice nádorů, ilustrované zejména metodou Imunoskóre (dnes používanou v klinické praxi), založenou na kvantifikaci a lokalizaci CD3+ a CD8+ TIL v tenkém řezu nádorovou tkání. Otevřenou otázkou zůstává, nakolik informace získaná z 2D řezu reflektuje skutečnou situaci v inherentně trojrozměrném nádorovém mikroprostředí. Je to zejména rozvoj nových metodických přístupů, které usnadňují získání 3D histologické informace je klíčový k zodpovězení této otázky. V teoretické části této práce je nejdříve nastíněna heterogenita nádorového mikroprostředí a role buněk imunitního systému v něm. Na množství příkladů je poté ilustrována role prostorové heterogenity a její případný vliv na histopatologické hodnocení nádoru s důrazem na TIL. Detailně je popsán vývoj, provedení,... Solid tumors are complex structures comprising besides the cancer cells vasculature, extracellular matrix (ECM), soluble molecules and a plethora of various other cell types. These components form a so-called tumour microenvironment. From the numerous cell types that are part of tumor microenvironment, tumor infiltrating lymphocytes (TILs) play a major role in patient prognosis. Their presence is also of major importance with regard to new biological therapies based on immune checkpoint inhibitors. Crucial role of TILs is also reflected by the new approaches in cancer diagnostics namely by Immunoscore method (currently used in clinical settings). Immunoscore is based on localization and quantification of CD3+ and CD8+ TILs in thin histological sections of tumor tissue. The question remains to which extent the information obtained from 2D slices reflects the situation in tumor microenvironment considering its spatial heterogeneity. The development of new methodological approaches allowing evaluation of histological information in 3D is the key to answer this question. The theoretical part of this work first describes the heterogeneity of the tumor microenvironment and the role of immune cells within it. Then, the role of spatial heterogeneity and its possible influence on the histopathological...
Keywords: carcinoma; immune infiltrate; immunoscore; lightsheet microscopy; solid tumor; SPIM; tissue clearing; tumor microenvironment; "lightsheet" mikroskopie; imunitní infiltrát; imunoskóre; karcinom; nádorové mikroprostředí; pevný nádor; projasnění tkáně; SPIM

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/122225

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-436103


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses