Název:
Interakční partneři proteinu eIF4E2 v lidských buňkách
Překlad názvu:
Interaction partners of protein eIF4E2 in human cells
Autoři:
Pospíšilová, Klára ; Pospíšek, Martin (vedoucí práce) ; Hálová, Martina (oponent) Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2020
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Protein eIF4E2 patří do rodiny eukaryotních translačních iniciačních faktorů 4E, za běžných okolností se ale iniciace translace neúčastní. Jeho hlavní úloha spočívá v represi translace specifických mRNA. Přesto se v podmínkách hypoxie eIF4E2 účastní iniciace translace jako podjednotka specific- kého translačního iniciačního komplexu. Přesný mechanismus působení eIF4E2 ani v jednom z procesů není znám. Jedním ze způsobů, jak roli eIF4E2 v buňce prostudovat, je zjistit, s jakými dalšími proteiny eIF4E2 interaguje. Cílem práce bylo vyhledat pomocí imunoprecipitace následované hmotnostní spek- trometrií potenciální interakční partnery eIF4E2 v buňkách linie HEK293. Kromě individuálních pro- teinů bylo cílem také identifikovat proteinové komplexy, jejichž součástí je v buňkách linie HEK293 faktor eIF4E2. Druhým směrem práce byla příprava systému pro hledání inhibitorů interakce eIF4E2 s eIF4G3. Hlavním výsledkem práce je nalezení potenciálních nových interakčních partnerů eIF4E2 v lidských buňkách.Protein eIF4E2 belongs to the family of eukaryotic translation initiation factors 4E, but it does not participate in translation initiation under normal circumstances. Its main role lies in translational repression of specific mRNAs. Nevertheless eIF4E2 takes part in translation initiation as a subunit of a specific translation initiation complex in hypoxic conditions. The exact mechanism in which eIF4E2 takes part in either of these processes is not known. One way to study the role of eIF4E2 in the cell is to find out what other proteins does eIF4E2 interact with. The goal of this work was to seek out potential eIF4E2-interacting partners in the HEK293 cell line using immunoprecipitation followed by mass spek- trometry. Apart from finding individual proteins the goal was to identify eIF4E2-containig protein com- plexes in HEK293 cells. A second line of work was preparation of a system for screening inhibitors of the interaction between eIF4E2 and eIF4G3. The main result is finding potential new eIF4E2-intera- cting partners in human cells.
Klíčová slova:
eIF4E2; iniciace translace; eIF4E2; translation initiation