Original title: Studium interakcí forkhead box O (FOXO) transkripčních faktorů s DNA
Translated title: Study of interactions of forkhead box O (FOXO) transcription factors with DNA
Authors: Hofmanová, Adéla ; Obšil, Tomáš (advisor) ; Pavlíček, Jiří (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2020
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Tato práce se zabývá studiem "O" podskupiny FOX transkripčních faktorů, která sestává ze čtyř zástupců (FOXO1, FOXO3, FOXO4 a FOXO6). Jedná se o významné regulační molekuly, které hrají zásadní roli v kontrole buněčného cyklu, odpovědi organismu na stres, diferenciaci a apoptóze. Na základě jejich schopnosti vyvolat buněčnou smrt jsou obecně považovány za tumorové supresory. Nedávné studie však ukázaly, že jejich působení může mít i opačný účinek, tedy že mají schopnost podpořit vývoj nádoru, či vyvolat rezistenci na léčiva používaná při léčbě některých typů národů. Přes intenzivní výzkum zůstává řada otázek týkajících se funkce FOXO proteinů stále nezodpovězená. Jednou z nich je, zda drobné strukturní rozdíly pozorované v jinak vysoce konzervovaných DNA-vazebných doménách (DBD) jednotlivých zástupců FOXO transkripčních faktorů mají vliv na DNA-vazebnou afinitu. Dále pak, zda má nedávno popsaná protein-proteinová interakce FOXO-DBD s transkripčním faktorem p53 vliv na jejich DNA-vazebné vlastnosti, nebo jaký je význam vazebného místa pro Mg2+ ion nalezeného v krystalové struktuře komplexu FOXO4-DBD:DNA. Pro objasnění těchto otázek byly exprimovány a purifikovány DNA-vazebné domény lidských transkripčních faktorů FOXO3 a FOXO4 (FOXO3-DBD142-267 a FOXO4-DBD82-207). Pomocí změn stacionární anisotropie... This work studies the "O" subgroup of FOX transcription factors, which consists of four members (FOXO1, FOXO3, FOXO4 and FOXO6). They are important regulatory molecules that play a critical role in a number of physiological and pathological processes such as cell cycle control, the body's response to stress, differentiation and apoptosis. Due to their ability to induce cell death, they are generally considered to be tumor suppressors. However, recent studies have shown that they can also induce an opposite effect, i.e. to promote tumor progression or induce resistance to drugs used in the therapy of certain types of tumors. Despite intensive research, a number of questions regarding the function of FOXO proteins still remain unanswered. One question is whether the small structural differences observed in the highly conserved DNA-binding domains (DBD) of FOXO transcription factors affect their DNA- binding affinities. Furthermore, it is unclear whether the recently described protein-protein interaction of FOXO-DBD with the transcription factor p53 affects their DNA-binding affinity. Moreover, the role of the binding site for Mg2+ ion which was found in the crystal structure of FOXO4-DBD:DNA, is also still not understood. To clarify these questions, the DNA-binding domains of the human transcription...
Keywords: forkhead; FOXO4; p53; protein-protein interaction; transcription factor; forkhead; FOXO4; p53; protein-protein interakce; transkripční faktor

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/121142

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-435080


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses