Název:
Charakterizace rostlinného proteomu
Autoři:
Petrová, Silvie Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2019
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Analýza listového proteomu přináší mnoho výzev a komplikací, včetně přítomnosti abundantních proteinů jako je RuBisCO. Teoretická část této práce představuje metody a frakcionační techniky využívané v proteomice. Experimentální část pak porovnává složení listového proteomu pěti rostlin, zahrnující tři představitele bylin (Arabidopsis thaliana, Solanum lycopersicum, Hordeum vulgare) a dva zástupce dřevin (Malus domestica a hybrid Populus). Dále je demonstrováno využití frakcionace (SCX a C18 za vysokého pH) a ukázán význam různých kombinací algoritmů pro identifikaci proteinů pomocí proteomické analýzy.Plant leaf tissue proteomics analyses face multiple challenges, including the presence of highly abundant proteins like RuBisCO. This thesis reviews methods in protein analysis and outlines proteome fraction techniques. The experimental part compares the leaf proteome composition of five plants, including three representatives of herbaceous (Arabidopsis thaliana, Solanum lycopersicum, Hordeum vulgare), and two woody plants (Malus domestica and Populus hybrid). Further, peptide fractionations by a high-pH C18 and SCX chromatography, and the role of data processing in proteomics analyses are illustrated.
Klíčová slova:
frakcionace; hmotnostní spektrometrie; kapalinová chromatografie; proteom; proteomika