Název:
Studium variability DNA mrkve obecné a příbuzných druhů
Autoři:
Smolová, Kristýna Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2019
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Tato práce zahrnuje studium literárního i praktického hlediska variability DNA vy-braných druhů čeledi Apiaceae. Cílem bylo také zkoušet a ověřovat přenositelnost mi-krosatelitních markerů navržených pro mrkev a kumin na příbuzné druhy. Praktická část byla vypracována pomocí metod izolace DNA, PCR amplifikace a elektroforetické sepa-race na agarózovém i polyakrylamidovém gelu. Za použití celkem 13 SSR markerů u 15 odrůd různých zástupců z čeledi miříkovitých (mrkev, celer, petržel, pastinák a kopr) bylo nalezeno 98 alel s velikostí mezi 140 a 400 bp. Poté byly sestaveny binární matice a vypočteny charakteristiky pro každý z použitých markerů, jejichž hodnoty dokazují vy-sokou využitelnost pro studium genetické variability u všech uvedených druhů s výjimkou kopru. Na základě výsledků byl zpracován dendrogram naznačující blízké i vzdálené vztahy mezi jednotlivými odrůdami a druhy plodin. Výsledky byly srovnány s podobně zaměřenými odbornými studiemi.This thesis includes the study of the literary as well as practical aspects of DNA variability in selected species of Apiaceae family. Among the objectives were also an examination and a verification regarding the transferability of microsatellite markers designed for carrot and cumin to related species. The practical part was elaborated by using methods of DNA isolation, PCR amplification and electrophoretic separation on both agarose and polyacrylamide gel. Using a total of 13 SSR markers in 15 varieties of various representatives from the Umbelliferae family (carrot, celery, parsley, parsnip and dill), 98 alleles of the size differing from 140 to 400 bp have been found. Then, binary matrices were compiled and characteristics for each of the markers used were calculated, the values of which demonstrate high utility for the study of genetic variability in all species except dill. Based on the results, the dendrogram was developed, indicating the close and distant relationships between individual varieties and sorts of crops. The results were compared with similarly focused expert studies.
Klíčová slova:
Anethum graveolens L.; Apium graveolens L.; Daucus carota L.; Pastinaca sativa L.; PCR; Petroselinum crispum; přenositelnost SSR markerů