Název:
Studium velikosti genomu rostlin - od vnitrodruhové variability po ekologické důsledky
Překlad názvu:
Genome size studies in plants - from intraspecific variation to ecological consequences
Autoři:
Lučanová, Magdalena ; Trávníček, Pavel (vedoucí práce) ; Leitch, Ilia (oponent) ; Šmarda, Petr (oponent) Typ dokumentu: Disertační práce
Rok:
2018
Jazyk:
eng
Abstrakt: [eng][cze] Nuclear DNA content (genome size) is one of the basic characteristics of living organisms. In the Angiosperms, the range of genome size is 2,300-fold, which raises questions about the causes and consequences of this tremendous variation. This thesis deals with genome size in plants from the level of intraspecific homoploid variation, through intraspecific ploidy variation, to interspecies comparisons. On various study systems we investigated the dynamics and ranges of genome size variation, tried to reveal possible associations between genome size and selected biological traits, and assessed the extent to which differences in genome size are manifested at the ecological and evolutionary level. As a means of estimating genome size we applied flow cytometry (FCM). In Taraxacum stenocephalum we conducted a detailed study of its enormous genome size variation. We carried out crossings of parents with various genome sizes and compared these parental genome sizes with those of F1 offspring. We also attempted to reveal the association of genome size with various growth traits. In Galium valdepilosum and Arabidopsis arenosa we carried out an extensive flow-cytometric ploidy level screening and compared the distribution and ecological preferences of detected cytotypes. We studied the Andean genus...Velikost genomu je jednou ze základních charakteristik živých organizmů. U krytosemenných rostlin dosahuje rozsahu pěti řádů, což vždy fascinovalo vědce a vyvolávalo mnoho otázek. Tato práce se zabývá různými aspekty velikosti genomu u rostlin. Počínaje detailním studiem na homoploidní vnitrodruhové úrovni, přes studium ploidně variabilních druhů až po srovnávání velikosti genomu mezi druhy, jsme se snažili zjistit, jaký vztah má velikost genomu k biologickým vlastnostem rostlin, stanovit dynamiku a rozsah variability velikosti genomu a detekovat dosah velikosti genomu až do úrovně ekologické a evoluční. Stěžejní metodou stanovení velikosti genomu v celé práci je průtoková cytometrie (FCM). U druhu Taraxacum stenocephalum vykazujícího extrémní variabilitu velikosti genomu jsme provedli opylovací experiment, kde jsme křížili rodiče s různou velikostí genomu. Porovnali jsme velikost genomu rodičů a F1 generace. U potomků jsme také sledovali souvislost velikosti genomu a růstových charakteristik. U ploidně variabilních druhů Galium valdepilosum a Arabidopsis arenosa jsme se zabývali rozšířením zjištěných cytotypů a jejich ekologickými nároky. Na souboru druhů andského rodu Lasiocephalus jsme studovali relativní i absolutní velikost genomu, provedli jsme ITS sekvenování a otestovali možné hlavní...
Klíčová slova:
C-hodnota; cytogeografie; obsah jaderné DNA; opylovací pokusy; polyploidie; průtoková cytometerie; velikost genomu; C-value; cytogeography; DNA content; flow cytometry; genome size; pollination experiment; polyploidy