Original title: Proteomická analýza organel parazitických protist
Translated title: Organelle proteomics of parasitic protists
Authors: Jedelský, Petr ; Tachezy, Jan (advisor) ; Kolářová, Libuše (referee) ; Půta, František (referee)
Document type: Doctoral theses
Year: 2017
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Rozvoj technologií pro sekvencování DNA přinesl technologický zlom, díky němuž bylo možné provést analýzu kompletních genomů, včetně parazitických protist Trichomonas vaginalis a Giardia intestinalis , které jsou tradičně studovány nejen z důvodu jejich klinického významu, ale rovněž z evolučního úhlu pohledu pro jejich adaptaci na anaerobní způsob metabolismu. Samotné dokončení sekvencování genomu a anotace predikovaných proteinových sekvencí nepřineslo detailní vhled do fungování organel odvozených od mitochondrie, jimiž jsou v případě G. intestinalis mitosomy, které se nepodílejí na energetickém metabolismu, a v případě T. vaginalis hydrogenosomy, které produkují molekulární vodík a produkují ATP substrátovou fosforylací. Tradiční metody výzkumu těchto organel založené na frakcionaci pomocí ultracentrifugace v hustotním gradientu a následné biochemické a enzymologické analýzy byly doplněny o metody jedno­ a dvoudimenzionální elektroforézy s následnou identifikací proteinů pomocí hmotnostní spektrometrie. V této práci byly použity metody... Advances in DNA sequencing led to a technological breakthrough, that allowed analyzis of complete genomes including those of parasitic protists Trichomonas vaginalis and Giardia intestinalis . These organisms are studied not only for their clinical importance, but also from the evolutionary point of view for their adaptation to anaerobic environment. Genome sequencing and annotations of predicted proteins alone did not bring detail view into functioning of their mitochondrion related organelles ­ in G. intestinalis mitosomes, not­participating in energetic metabolism, in T. vaginalis hydrogenosomes, producing molecular hydrogen and ATP by means of substrate phosphorylation. Traditional methods based on a fractionation by ultracentrifuging in density gradient and subsequent biochemical and enzymological analyzes were extended by one­ and two­dimensional electrophoresis with subsequent identification of proteins by mass spectrometry. Methods of multidimensional separation of peptides produced by specific proteolysis of a complex mixture...
Keywords: Giardia intestinalis; hydrogenosome; mitosome; proteomics; Trichomonas vaginalis; Giardia intestinalis; hydrogenosom; mitosom; proteomika; Trichomonas vaginalis

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/95176

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-373585


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses