Original title: Využití polymerázové řetězové reakce, PCR-RFLP techniky a sekvenační analýzy k determinaci homozygotů, vnitrodruhových heterozygotů a mezidruhových hybridů rodu Salvelinus v chovných zařízeních
Translated title: Utilization of polymerase chain reaction, PCR-RFLP technique and sequence analysis for determination of homozygotes, intraspecific heterozygotes and interspecific hybrids of the genus Salvelinus in breeding facilities
Authors: Mendel, Jan ; Halačka, Karel ; Mareš, J.
Document type: Methods
Year: 2017
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Cílem metodiky je poskytnout relevantní informace a spolehlivé nástroje k determinaci nejčastěji chovaných ryb rodu Salvelinus v ČR a v evropských státech. Metodika obsahuje optimalizovaný postup identifikace čtyř druhů (Salvelinus fontinalis, Salvelinus alpinus, Salvelinus umbla, Salvelinus namaycush) v homozygotním i heterozygotním stavu a v jejich hybridních kombinacích. Metodika popisuje aktuální stav identifikace uvedených druhů ryb v ČR včetně jejich nedostatků a současně navrhuje nové a spolehlivé řešení s využitím polymerázové řetězové reakce, restrikční techniky PCR-RFLP a sekvenace. Vizualizace a separace fragmentů je prováděna buď na agarózovém gelu anebo na přístroji Fragment AnalyzerTM. The methodology provides relevant information and reliable instruments for determination of the most frequently bred fish of the genus Salvelinus in the Czech Republic and in European countries. It includes the optimized process of identification of four species (Salvelinus fontinalis, Salvelinus alpinus, Salvelinus umbla, Salvelinus namaycush) in the homozygous and heterozygous state and in their hybrid combinations. The methodology describes the present situation in identification of the above mentioned fish species in the Czech Republic including its drawbacks and at the same time proposes a new and reliable solution utilizing polymerase chain reaction, PCR-RFLP restriction technique and sequencing. Visualization and separation of diagnostic fragments is performed either on agarose gel or on the Fragment AnalyzerTM.
Keywords: breeding facilities; PCR-RFLP technique; Salvelinus
Project no.: QJ1510077 (CEP)
Funding provider: GA MZe

Institution: Institute of Vertebrate Biology AS ČR (web)
Document availability information: Fulltext is available at external website.
External URL: http://www.rybarstvi.eu/pub%20rybari/metodika%20mendel.pdf
Original record: http://hdl.handle.net/11104/0281855

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-371599


The record appears in these collections:
Research > Institutes ASCR > Institute of Vertebrate Biology
Analytical and methodological materials > Methods