Original title: Evoluční vztahy mezi druhy parem rodu Barbus (Cyprinidae) s důrazem na Řecko a biogeografie řeckých linií
Translated title: Evolutionary relationships within genus Barbus (Cyprinidae) with emphasis on Greece, and biogeography of Greek lineages
Authors: Kyralová, Eva ; Vukićová, Jasna (advisor) ; Kalous, Lukáš (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2017
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Evoluční vztahy mezi druhy rodu Barbus byly studovány již v minulosti, většina studií však byla založena na mitochondriální DNA, neexistuje žádná detailní studie, která by studovala vztahy i na základě nukleárních markerů. Je to dáno především tím, že parmy rodu Barbus jsou tetraploidní. Oblast Řecka nebyla dosud dostatečně studována, a to především oblast západního Řecka, o které se ví, že skrývá daleko vyšší diverzitu sladkovodní ichtyofauny, než bylo dosud známo. Území Řecka je jedním z "horkých míst" (tzv. hotspots) biodiverzity. Řecké říční systémy se vyznačují značným podílem endemických druhů sladkovodních ryb. V této práci byly studovány evoluční vztahy mezi druhy rodu Barbus, s důrazem na diverzitu řeckých linií. Také bylo revidováno geografické rozšíření jednotlivých druhů rodu Barbus v Řecku. Celkem bylo analyzováno 192 jedinců, z čehož bylo 156 jedinců ze 40 řeckých lokalit a dalších 36 jedinců druhů rodu Barbus z dalších oblastí rozšíření. Dataset byl doplněn dostupnými publikovanými sekvencemi. Pro fylogenetické analýzy byl použit mitochondriální gen cytochrom b a nukleární markery 1. intron ribozomálního protein genu S7 a 2. intron genu beta-actinu. Pro oba nukleární markery byly použity paralog-specifické primery. Analýza cytochromu b odhalila několik dobře podpořených linií: 1.... Evolutionary relationships between Barbus species have been already studied in the past, but most of the studies were based only on mitochondrial DNA, there is no detailed study based on nuclear markers. This is mainly due to the fact that Barbus species are tetraploid. The western part of Greece has been studied insufficiently, and moreover a greater diversity of freshwater ichthyofauna is expected here. Greece is one of the hotspots of biodiversity. Greek river system is characterized by a significant proportion of endemic species of freshwater fishes. In this work evolutionary relationships between Barbus species were studied, with focus on diversity of Greek lineages. The geographical distribution of Barbus species has been also revised. In total, 192 individuals were analyzed, 156 individuals were from 40 Greek localities and another 36 Barbus species were from other areas of distribution of the genus. Dataset was supplemented with avaible published sequences. For the phylogenetic analysis mitochondrial gene cytochrom b, 1st intron of ribosomal protein gene S7 and 2nd intron of gene beta-actin were used. For both nuclear markers paralog-specific primers were used. The analysis of cytochrom b revealed several well-supported lines: 1. species of southwestern Mediterranean (B. meridionalis and B....
Keywords: Barbus; beta-actin; cytochrom b; evolutionary relationships; freshwater ichthyofauna; Greece; phylogeography; S7; Barbus; beta-actin; cytochrom b; evoluční vztahy; fylogeografie; S7; sladkovodní ichtyofauna; Řecko

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/91277

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-367800


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses