Název:
Úloha RECQ5 helikázy při udržování stability genomu
Překlad názvu:
The role of RECQ5 helicase in maintanance of genome stability
Autoři:
Urban, Václav ; Janščák, Pavel (vedoucí práce) ; Krejčí, Lumír (oponent) ; Blažek, Dalibor (oponent) Typ dokumentu: Disertační práce
Rok:
2016
Jazyk:
eng
Abstrakt: [eng][cze] DNA replication is the most vulnerable process of DNA metabolism in proliferating cells and therefore it is tightly controlled and coordinated with processes that maintain genomic stability. Human RecQ helicases are among the most important factors involved in the maintenance of replication fork integrity, especially under conditions of replication stress. Collisions between replication and transcription machineries represent a significant source of genomic instability. RECQ5 DNA helicase binds to RNA-polymerase (RNAP) II during transcription elongation and suppresses transcription-associated genomic instability. Here we show that RECQ5 also associates with RNAPI and enforces the stability of ribosomal DNA arrays in cells exposed to replication stress. We demonstrate that RECQ5 associates with transcription complexes in DNA replication foci and counteracts replication fork stalling in RNAPI- and RNAPII-transcribed genes, suggesting that RECQ5 exerts its genome stabilizing effect by acting at sites of concomitant replication and transcription. Moreover, RECQ5- deficient cells accumulate RAD51 foci that are formed in a BRCA1-dependent manner at sites of interference between replication and transcription and likely represent unresolved replication intermediates. Importantly, BRCA1-dependent formation...V průběhu replikace často dochází k zastavení postupu replikačních vidlic v důsledku poškození DNA templátu, přítomnosti transkripčních komplexů nebo tvorby sekundárních struktur DNA. RecQ helikázy patří v buňce k nejdůležitějším faktorům, které zajišťují stabilitu genomu za podmínek replikačního stresu. Přestože jsou transkripce i replikace esenciálními buněčnými mechanismy, jejich vzájemná interference může vést k poškození DNA a následné genomové nestabilitě. RECQ5 helikáza interaguje s RNA polymerázou II během elongační fáze transkripce a zabraňuje vzniku transkripcí indukovaného poškození DNA. V této studii ukazujeme, že RECQ5 interaguje také s RNA polymerázou I a zabraňuje ztrátě či znásobení úseků ribozomální DNA, na kterých dochází k přepisu ribozomální RNA. Prokázali jsme, že během S-fáze buněčného cyklu RECQ5 asociuje s transkripcí v místech právě probíhající replikace. Odstranění RECQ5 pomocí RNA interference vede k zastavení replikačních vidlic v oblastech transkribovaných RNA polymerázou I nebo II, což naznačuje, že RECQ5 udržuje stabilitu genomu v místech kolize mezi replikací a transkripcí. Snížením exprese RECQ5 pomocí RNA interference dochází v jádrech replikujících buněk k akumulaci RAD51 a RAD18 fokusů, které pravděpodobně představují nerozřešené replikační intermediáty, které...