Název: Hledání substrátové specifity DUSP fosfatáz
Překlad názvu: In search of DUSP specificity
Autoři: Sladeček, Stanislava ; Novotný, Marian (vedoucí práce) ; Martínková, Natália (oponent)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2016
Jazyk: eng
Abstrakt: [eng] [cze]
Dual specificity phosphatases (DUSP) are enzymes that dephosphorylate both phosphoserine/threonine and phosphotyrosine residues on one substrate. Most of them specifically dephosphorylate family mitogen-activated protein kinases (MAPK). Number of DUSPs increases with complexity of organisms and in human genome there are 25 DUSPs described. Some DUSPs can dephosphorylate only one protein while other interact with wider spectrum of substrates. Except for substrate specificity DUSPs differ in expression, subcellular localization etc. Although first DUSPs were described about 20 years ago, a clear factor responsible for their substrate specificity is not known. This works uses in silico methods to discover and describe similarities and differences between DUSPs which may be important in determining DUSP specificity. Key words: phosphatase, kinase, DUSP, MAPK, substrate specificity, conservation of residues, phylogenetic tree, in silico methods Duálně specifické fosfatázy (DUSP) jsou enzymy, které defosforylují fosfoserinové/threoninové a fosfotryrozínové zbytky na jednom substrátu. Většina z nich specificky defosforyluje rodinu mitogeny-aktivovaných protein kináz (MAPK). Počet DUSPů se zvyšuje u složitějších organismů a v lidském genomu je 25 popsaných DUSPů. Některé DUSPy mohou defosforylovat pouze jeden protein, zatímco jiné interagují s širším spektrem substrátů. S výjimkou substrátové specificity se DUSPy liší v expresii, subcelulární lokalizaci atd. Přestože byly první DUSPy popsány asi před 20 lety, doposud není popsaný žádný zřejmý faktor zodpovědný za jejich substrátovou specifitu. Předložená diplomová práce se snaží použitím in silico metod objasnit a popsat společné vlastnosti a rozdíly DUSPů, které mohou být důležité pro určování jejich specificity. Klíčová slova: fosfatázy, kinázy, DUSP, MAPK, substrátová specificita, konzervovanost aminokyselinových zbytků, fylogenetický strom, in silico metody
Klíčová slova: DUSP; fofatáza; kináza; ortolog; vazebný povrch; binding surface; DUSP; kinase; ortologue; phosphatase

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/75623

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-345023


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce