Original title: Identifikace a aktivace kryptického genového shluku pro biosyntézu látek manumycinového typu u Saccharothrix espanaensis DSM44229
Translated title: Identification and activation of a cryptic biosynthetic gene cluster for manumycin-type metabolites in Saccharothrix espanaensis DSM44229
Authors: Zelenka, Tomáš ; Petříčková, Kateřina (advisor) ; Beranová, Jana (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2014
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
1 Abstrakt: Sekundární metabolismus grampozitivních půdních bakterií rodu Streptomyces je neocenitelným významným zdrojem přírodních produktů, mezi které patří i skupina polyketidových látek, manumycinů. Tyto látky vykazují kromě slabého antimikrobiálního účinku významné protizánětlivé a protinádorové aktivity. Rod Streptomyces skýtá značné množství dosud neobjevených, potenciálně klinicky využitelných antibiotik, což dělá z těchto organismů nadějné řešení současného problému rozvoje antibiotikových rezistencí u mikroorganismů. Výzkum se ubírá dvěma hlavními směry, jednak je zde snaha o "umělé" vytváření různých modifikací ve struktuře molekul a o porozumění jejich funkcím, jednak jde o objevování úplně nových producentů metodami "genome miningu", optimalizace postupů pro probouzení skrytých kryptických genových shluků a zvýšení produkce požadovaných metabolitů. Jeden z mnoha takových tichých shluků obsahuje i Saccharothrix espanaensis DSM44229. Tato genetická informace byla s cílem charakterizace jejího produktu přenesena do heterologního hostitele, kde následně došlo k aktivaci a produkci nových látek manumycinového typu. 1 Abstract: Secondary metabolism of Gram-positive soil bacteria from the genus Streptomyces is a inestimable source of natural products including manumycins, which belong to a polyketide group. These products possess weak antimicrobial, but important antiinflammatory, and antitumor activities. Streptomyces sp. offers broad amounts of yet undiscovered antibiotics, potentially utilizable in clinical medicine. This fact makes out of these organisms a promising solution to our present problem with rising antibiotic resistance among microorganisms. Two main ways are applied in this research: There are efforts of prepairing new derivates based on known products and creating various modifications in their structure. Next, new producers are discovered by "genome mining" methods, activation of silent gene clusters, followed by improvements of antibiotic production. One of those silent clusters was found in the Saccharothrix espanaensis DSM44229 strain. The genetic information has been transferred to a heterologous host in order to characterize its product. Cluster activation and production of novel manumycin-type metabolites occurred in the host after the transfer.
Keywords: anti-inflammatory metabolites; genetic engineering; manumycins; polyketides; secondary metabolites; streptomycetes; genové inženýrství; manumyciny; polyketidy; protizánětlivé metabolity; sekundární metabolity; streptomycety

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/68009

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-337145


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses