Original title:
Regulace transkripce u mykobakterií.
Translated title:
Regulation of transcription in mycobacteria.
Authors:
Páleníková, Petra ; Krásný, Libor (advisor) ; Mrvová, Silvia (referee) Document type: Bachelor's theses
Year:
2014
Language:
slo Abstract:
[eng][cze] The bacterial cell has to be able to cope with environmental changes. Adaptation to these changes is achieved by changes in gene expression. Gene expression is regulated mostly at the level or transcription initiation. Transcription initiation depends on the sequence of promoters and is regulated by alternative sigma factors and many transcription factors acting either as activators or repressors. This work describes various ways of transcription regulation in the bacterial genus Mycobacterium that includes deathly pathogens such as M. tuberculosis and M. leprae. The typical characteristics of this genus are poorly conserved promoters, a high number of sigma and transcription factors, the presence of two-component systems and a lot of small RNAs that have not been characterized in detail so far.Bakteriálna bunka sa musí vedieť rýchlo prispôsobiť zmenám, ktorým je vystavená v prostredí. Na tieto zmeny reaguje reguláciou génovej expresie primárne na úrovni iniciácie transkripcie. Medzi formy reguláciu transkripcie môžeme zaradiť rôznu stavbu promótorových oblastí pred odlišnými skupinami génov, prítomnosť alternatívnych sigma faktorov a tiež ovplyvňovanie priebehu génovej expresie pôsobením transkripčných faktorov buď ako aktivátory, alebo ako inhibítory. V tejto práci sú popísané spôsoby regulácie transkripcie u baktérií rodu Mycobacterium, ku ktorým zahrňujeme aj patogénne baktérie M. tuberculosis a M. leprae. Baktérie tohto rodu vykazujú malú konzervovanosť promótorových oblastí, veľké množstvo sigma faktorov, veľký počet transkripčných faktorov, prítomnosť dvojkomponentových systémov a mnoho, zatiaľ málo preskúmaných, malých regulačných RNA.
Keywords:
mycobacterium; promoter; RNA polymerase; sigma factor; small RNA; transcription factor; malé RNA; mykobaktérium; promótor; RNA polymeráza; sigma faktor; transkripčný faktor
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/62418