Original title:
Studium proteomu dentinu lidských zubů
Translated title:
Proteomic study of human tooth dentin
Authors:
Zettlová, Ludmila ; Jágr, Michal (advisor) ; Vrbacký, Marek (referee) Document type: Bachelor's theses
Year:
2013
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Analýza proteomu dentinu v lidských zubech dospělých jedinců byla provedena za účelem optimalizace analýzy proteinů zubního dentinu metodou dvourozměrné gelové elektroforézy (2-DE). Zuby moudrosti byly očištěny, rozdrceny a extrahovány v guanidinovém a EDTA pufru. Extrahované proteiny byly separovány 2-DE, naštípány trypsinem na peptidy a následně bylo ve vzorcích pomocí nLC MS/MS identifikováno celkem 7 proteinů. Využití IPG stripů s různou škálou oblasti pH gradientu a následné srovnání 2 DE gelů bohužel nepřineslo významné nové informace, neboť byly identifikovány především keratiny, kolageny a sérový albumin.Proteome analysis of dentin in human teeth adult subjects was conducted to optimize the two dimensional gel electrophoresis (2-DE) analysis of proteins from the dental tissue. The third molar teeth were cleaned, crushed and extracted in guanidine and EDTA buffer. Extracted proteins were separated by 2-DE, digested with trypsin to peptides and subsequently analyzed using nLC MS/MS. Totally, 7 unique proteins were identified in the samples. The use of IPG strips with different range of the pH gradient and the subsequent comparison of 2 DE gels unfortunately did not bring important new information, because common keratin, collagen and serum albumin proteins were identified.
Keywords:
Dentin; proteomic study; Dentin; proteomická studie
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/56207