Original title: Genetická diverzita vodních plžů Aplexa hypnorum a Anisus vorticulus v rámci střední Evropy
Translated title: Genetic diversity of two freshwater molluscs - Anisus vorticulus and Aplexa hypnorum - in central Europe
Authors: Buďová, Jana ; Černý, Martin (advisor) ; Štefka, Jan (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2013
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Předmětem mé práce bylo shrnutí genetické variability sladkovodních plžů periodických tůní. Modelovými druhy byla ubývající levotočka bažinná (Aplexa hypnorum) a kriticky ohrožený svinutec tenký (Anisus vorticulus). Genetická variabilita byla zkoumána pomocí dvou mitochondriálních a dvo jaderných markerů. Rozložení genetické variability na genu COI u levotočky bažinné odpovídá různým povodím. Ostatní genetické markery (16S, ITS) však tento trend nepotvrdily. Příčiny tohoto nesouladu mezi různými markery jsou diskutovány několika různými způsoby zahrnujícími možné historické scénáře vývoje populací levotočky, ale i možné chyby laboratorních metod. V této studii byla zaznamenána obecně malá úspěšnost amplifikace, jejím nejpravděpodobnějším důvodem je inhibiční vliv mukusu plžů na amplifikaci DNA. Dalším problémem, který při této práci nastal, bylo získání sekvence parazita (motolice) místo genu svinutce, i za použití primerů specifických pro plže. Kromě genetické a související metodické části má tato práce i třetí část zabývající se vyhodnocením environmentálních faktorů periodických tůní v přítomnosti a nepřítomnosti studovaných druhů a čtvrtou část zabývající se fylogenetickou analýzou evropských a amerických linií levotoček. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org) The aim of my study was to sum up the data about genetic variability of freshwater gastropods living in temporary ponds. My model species were moss bladder snail (Aplexa hypnorum) and the critically endangered ramshorn snail (Anisus vorticulus). Genetic variability was investigated by two mtDNA and two nuclear markers. The differences in genetic variation at the COI gene follow the pattern of different catchments. However, these findings do not agree with the patterns derived from genetic markers ITS1 and 16S. The reasons for the differences between the different markers are discussed in several ways involving few possible historical scenarios, but also possible errors of laboratory methods. In this study, there was only little success in amplification and the most likely reason is the inhibitory effect of snail mucus on DNA amplification. Another problem that occurred when this work was to obtain the sequence of the parasite (fluke) instead Anisus gene using gastropod specific primers. In addition to genetic and related methodological part of this work is the third part concerning the evaluation of environmental factors periodic pools in the presence and absence of the species studied. The fourth part sis focused on the phylogenetical analyses of the european and american Aplexa linneages. Powered by TCPDF...
Keywords: 16S; Anisus vorticulus; Aplexa elongata; Aplexa hypnorum; COI; enviromental factors; genetic vaiability; ITS-1; ITS-2; phylogenetical analyses; Temporary ponds; 16S; Anisus vorticulus; Aplexa elongata; Aplexa hypnorum; COI; environmentální faktory; fylogenetická analýza; Genetická variabilita; ITS-1; ITS-2; Periodické tůně

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/54350

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-323644


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses