Název:
S čepičkou nebo bez čepičky? Iniciace translace eukaryot se zaměřením na opurtunního patogena C. albicans
Překlad názvu:
To cap or not to cap? Eukaryotic translation initiation with a special interest in human opportunistic pathogen C. albicans
Autoři:
Feketová, Zuzana ; Pospíšek, Martin (vedoucí práce) ; Půta, František (oponent) ; Vanáčová, Štěpánka (oponent) Typ dokumentu: Disertační práce
Rok:
2011
Jazyk:
slo
Abstrakt: [eng][cze] Candida albicans belongs to serious human opportunistic pathogens, causing severe health complications to immunocompromised patients. To my best knowledge, it is the only organism that survives with unmethylated cap structures found on the 5'ends of mRNA molecules. Using functional assay, I demonstrated that orf19.7626 codes for C. albicans translation initiation factor 4E (Ca4E). We couldn't prove our hypothesis, that Ca4E could be responsible for the unmethylated cap recognition in our model organism S. cerevisiae. Candida sp. possesses also another rather unusual feature - ambiguous CUG codon. In most of the cases, CUG is decoded as a serine, but sometimes also as a leucine. This gives rise to a so called "statistical proteome". One CUG codon is also part of the mRNA coding for Ca4E protein, therefore two versions of Ca4E-Ca4ELeu and Ca4ESer -might occur in C. albicans simultaneously. Both of them are able to rescue deletion of S. cerevisiae eIF4E gene, but they confer temperature sensitivity to the heterologous host. This phenotype is more pronounced with the Ca4ELeu version. We observed milder temperature sensitive phenotype after co-expression of Ca4E together with C. albicans eIF4G (Ca4G). Conformational coupling between eIF4E and eIF4G leads to enhanced affinity of eIF4E to the cap...Candida albicans je bezpochyby veľmi dôležitý oportúnny patogén, ohrozujúci hlavne imunokompromitovaných pacientov. Pokiaľ viem, ide o jediný organizmus, ktorý je schopný prežívať s nemetylovanými čiapočkami nachádzajúcimi sa na 5'konci mRNA. Funkčnou analýzou som potvrdila, že orf19.7626 kóduje translačný iniciačný faktor 4E C. albicans (Ca4E). Predpoklad, že Ca4E proteín by mohol rozpoznávať nemetylované čiapočky, sa nám v modelovom organizme S. cerevisiae nepodarilo potvrdiť. Rod Candida má však aj ďalšiu zvláštnosť- dvojaké dekódovanie CUG kodónu. Vo veľkej väčšine prípadov je dekódovaný ako serín, ale môže ísť aj o leucín, takže vzniká tzv. "štatistický proteóm". Jeden takýto kodón je aj súčasťou mRNA Ca4E proteínu. U C. albicans by sa teda mohli vyskytovať súčasne dve varianty Ca4E - Ca4ELeu a Ca4ESer . Obe formy dokážu nahradiť eIF4E S. cerevisiae, ale spôsobujú termosenzitívny fenotyp, ktorý je výraznejší v prípade Ca4ELeu proteínu. Zmiernenie termosenzitívneho fenotypu sa podarilo docieliť koprodukciou Ca4E spolu s C. albicans eIF4G proteínom (Ca4G). Úlohou eIF4G je prepojiť mRNA s 43S podjednotkou ribozómu pomocou interakcie s eIF4E, ktorá zároveň zvyšuje afinitu eIF4E k čiapočke. Preto sa domnievam, že interakcia Ca4E s eIF4G proteínom S. cerevisiae nie je dostačujúca. Ca4G taktiež...
Klíčová slova:
C. albicans; CUG; databáza; eIF4E; HCV; IRES; čiapočka; C. albicans; cap; CUG; database; eIF4E; HCV; IRES