Název:
Spektroskopické studium interakce antibakteriálních peptidů s modelovými membránami
Překlad názvu:
Spectroscopic study of interaction of antimicrobial peptides with model membranes
Autoři:
Tesař, Adam ; Kopecký, Vladimír (vedoucí práce) ; Kočišová, Eva (oponent) Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2012
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Antimikrobiální peptidy (AMP) mají obrovský potenciál užití v medicíně a farmacii. Mechanismus účinku je dán interakcí s buněčnou stěnou, která vede k penetraci membrány. Způsob narušení buněčné membrány však není plně pochopen, proto jsme se v práci zaměřili na interakci AMP HAL-1, izolovaného z jedu vosy Halictus sexctinctus, s modelovou membránou 100nm lipozomů složených z fosfatidylcholinu a fosfatidyl-glycerolu. Cirkulární dichroismus a infračervená spektroskopie (FTIR) prokázaly změnu sekundární struktury z neuspořádané, u volného HAL-1, na -helikální v interakci s membránou. Dalším krokem byla příprava lipidové dvojvrstvy na povrchu ATR hranolu, která by v budoucnu umožňovala užití polarizované FTIR spektroskopie ke studiu interakce AMP s modelovými membránami. Proto jsme pomocí ATR-FTIR spektrokopie, za použití faktorové analýzy, studovali dynamiku vysychání lipozomů a jejich opětovnou hydrataci, a to i za přidání HAL-1. Zaměřili jsme se na stabilizaci systému vzorku. Hydratace lipidové dvojvrstvy 2 µl vzorku vykazovala stabilitu po desítky minut, přičemž ředěním lipozomů stabilita klesá až k minutám. Rovněž jsme pozorovali protektivní vliv peptidu na lipidovou dvojvrstvu a zpomalení vysychání systému, což by mohlo být způsobeno vznikem kobercové struktury na povrchu. Nicméně, systém není zcela...Antimicrobial peptides (AMP) have a great potential in medicine and pharmacy. Mechanism of their impact is an interaction with a cell membrane leading to the penetration of the membrane. The way of disruption of the cell membrane is not completely understand, therefore we focused on the interaction of AMP HAL-1, isolated from the venom of the bee Halictus sexctinctus, with a model membrane of 100 nm liposomes consisting of phosphatidylcholin and phosphatidylglycerol. Circular dichroism and infrared spectroscopy (FTIR) proved the change of the secondary structure from the random coil of free HAL-1 to -helix in an interaction with the membrane. The next step was preparation of the lipid bilayer on the surface of ATR prism, which will enable usage of the polarized FTIR spectroscopy to study the interaction of AMP with model membranes in future. Therefore, the ATR-FTIR spectroscopy and factor analyses were applied to study dynamics of drying of the liposomes and their subsequent hydration also with an addition of HAL-1. We focused on the stabilization of the system. Hydratation of the lipid bilayer by 2 µl sample showed stability for minutes, nevertheless after dilution the stabilization decay in minutes. The protective influence of the peptide on the lipid bilayer and slowing down of the drying out of the...
Klíčová slova:
biofyzika; membrány; proteiny; spektroskopie; biophysics; membranes; proteins; spectroscopy