Název: Hidden Markovy modely jako nástroj pro predikci sekundární struktury proteinů
Překlad názvu: Hidden Markov models as a tool for protein secondary structure prediction
Autoři: Kraus, Ondřej ; Novotný, Marian (vedoucí práce) ; Mokrejš, Martin (oponent)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2010
Jazyk: eng
Abstrakt: [eng] [cze]
Hidden Markov models are ideal tool for sequence analysis therefore they are used also for protein secondary structure prediction. A number of tools for protein secondary structure prediction exist today a part of them utilizes also hidden Markov models. Hence I try to introduce them to a reader and explain him the way they work and their advantages and disadvantages in this assay. The majority of methods predict three secondary structures with accuracy between 60% and 80% nevertheless with regard to different testing methodologies the results should be treated solely as indicative. Key-words: protein structure prediction, hidden Markov model, secondary structure Hidden Markov modely jsou ideálním nástrojem na analýzu sekvencí, proto se využívají i v predikci sekundární struktury proteinů. V současnosti existuje několik nástrojů k predikci sekundární struktury proteinů a část z nich využívá hidden Markov modely. Ve své práci se proto pokusím s nimi čtenáře seznámit a vysvětlit na jakém principu pracují, jaké jsou jejich výhody a nevýhody. Většina metod predikuje tři sekundární struktury s úspěšností 60%- 80%, nicméně vzhledem k odlišné metodice testování úspěšnosti lze brát výsledky pouze jako orientační. Klíčová slova: predikce proteinové struktury, hidden Markov model, sekundární struktura

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/39527

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-303778


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce