Název: Processing of secondary structures in nucleic acids
Překlad názvu: Processing of secondary structures in nucleic acids
Autoři: Goldwein, Robert ; Kukačka, Marek (oponent) ; Mrázová, Iveta (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2009
Jazyk: eng
Abstrakt: [eng] [cze]
This work explores and studies basic methods of bioinformatics - new and perspective branch of computer science. Introduces the term Bioinformatics, familiarizes with necessary biological background (DNA and RNA molecules, proteins, central dogma of molecular biology) and also with basic bioinformatics terms (biological sequence, primary and secondary structure). It also demonstrates the implementation of basic bioinformatics algorithms and their use with real data (on Foot-and-mouth disease virus) - motif finding, longest common subsequence and sequence alignment. This work also introduces higher structures of biological sequences, primarily with secondary structure of RNA molecule. Předložená práce se zabývá studiem základních metod v bioinformatice - v novém a perspektivním odvětví informatiky. Vysvětluje vlastní pojmem bioinformatika, seznamuje s nutnými biologickými základy (molekuly DNA, RNA, proteiny, centrální dogma molekulární biologie) a se základními bioinformatickými pojmy (biologická sekvence a její primární a sekunární struktura). Dále demonstruje implementaci základních bioinformatických algoritmů a jejich použití na reálných datech (na viru slintavky a kulhavky) - vyhledávání motivů, nejdelší společná podsekvence a alignment sekvencí. Práce také seznamuje s vyššími strukturami, především pak se sekundární strukturou RNA.

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/26832

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-281925


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce