Original title:
Analýza krátkých izoforem proteinů Argonaut z myších oocytů
Translated title:
Analysis of short Argonaute isoforms from mouse oocytes
Authors:
Jankele, Radek ; Svoboda, Petr (advisor) ; Petr, Jaroslav (referee) Document type: Master’s theses
Year:
2015
Language:
eng Abstract:
[eng][cze] AnalysisofshortArgonauteisoformsfrommouseoocytes Abstract: Argonaute proteins carrying small RNAs form the conserved core of RNA silencing mechanisms, which repress viruses, mobile genetic elements, and genes in a sequence specific manner. The microRNA (miRNA) pathway is a dominant mammalian RNA silencing mechanism in somatic cells, which post-transcriptionally regulates large fraction of genes and thereby adjusts protein levels. miRNA-guided Argonautes inhibit translation and induce deadenylation of complementary mRNAs, ultimately resulting in their decay. In contrast to RNA interference (RNAi), which employs Argonaute slicer activity to directly cleave perfectly complementary RNAs, an effective miRNA-mediated mRNA repression requires multiple Argonaute-associated protein factors and enzymes. The miRNA pathway has been implicated in many complex biological processes ranging from organogenesis, stress-response to haematopoiesis or cancer. Surprisingly, canonical miRNAs are not essential for oocytes and early embryonic development in mice. Even the most abundant miRNAs present in mouse oocytes are unable to effectively repress target genes. However, RNAi, which shares key enzymes with the miRNA pathway, is highly active in oocytes and early embryos. The cause of miRNA inactivity in mouse oocytes remains...Analýza kratkých isoforem proteinů Argonaůt z mýsích oocýtů Abstrakt: Proteiny z rodiný Argonaůtů, řízené malými molekůlami RNA, představůjí konzervované jádro mechanismů ůmlčování RNA (RNA silencing). Týto mechanismý potlačůjí prodůkci virů, šíření mobilní DNA, a regůlůjí genovoů expresi na základě sekvenční informace nesené asociovanou RNA. V somatických bůňkách savců je dominantním mechanismem regůlační microRNA (miRNA) dráha. Malé miRNA ovlivňůjí expresi většiný savčích genů. Argonaute proteiny inhibůjí translaci a indůkůjí deadenylaci mRNA s částečnoů homologií k navázané miRNA. Deadenylace obvykle výústí degradaci mRNA. Těmito mechanismý miRNA dráha citlivě kontrolůje hladiný prodůkovaných proteinů. Na rozdíl od příbůzného mechanismů RNA interference (RNAi) výůžívajícího katalyticky aktivní proteiny Argonaute schopné rozštěpit komplementárních molekuly RNA, miRNA ůmlčování je závislé na celé řadě dalších faktorů. Role miRNA regulace v komplexních biologických procesech od organogeneze, přes krvetvorbů až po rakovinu je dobře doložená. Mýší oocýtý postrádající kanonické miRNA jsoů překvapivě schopné oplození a úspěšně projdoů preimplantačním vývojem. Ani nejčetnější oocýtární miRNA však nejsou sto efektivně ůmlčet cílové gený, přestože příbůzný mechanismůs RNAi, sdílející s miRNA mechanismem klíčové...
Keywords:
AGO; Argonaute; Dicer; miRNA; oocyte; piRNA; RISC; RNA; silencing; siRNA; AGO; Argonaute; Dicer; miRNA; oocyte; piRNA; RISC; RNA; silencing; siRNA
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/5295