Název:
Předzpracování obrazu 1D gelové elektroforézy
Překlad názvu:
Preprocessing of 1D gel electrophoresis image
Autoři:
Hlavatý, Matej ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Vítek, Martin (vedoucí práce) Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2014
Jazyk:
cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze][eng]
Projekt sa zaoberá automatickým spracovaním výsledkov 1D gélovej elektroforézy. Študuje základné princípy elektroforézy a druhy šumu a chýb ovplyvňujúcich výsledok. Navrhovaný program slúži na automatickú detekciu stĺpcov v obraze. Z čiernobielych digitálnych snímkov elektroforézy vytvára sumačnú projekciu na vodorovnú os. Po vyhladení profilu hľadá lokálne minimá pomocou derivácie projekcie. V týchto miestach určuje hranice medzi stĺpcami dát.
The aim of this project is an automatic analysis of 1D gel electrophoresis results. Basic principles of gel electrophoresis and types of errors and signal noise influencing the result are studied. The proposed algorithm serves for automatic detection of lanes in the image. Summation projection on the horizontal axis is created from black-and-white digital pictures of electrophoresis. Local minima of the profile are located after smoothing the profile. In the location of these minima borders between lanes are established.
Klíčová slova:
detekcia stĺpcov; Gélová elektroforéza; lokálne extrémy funkcie; mediánový filter; úprava kontrastu; contrast enhancement; function local extremes; Gel electrophoresis; lane detection; median filter
Instituce: Vysoké učení technické v Brně
(web)
Informace o dostupnosti dokumentu:
Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT. Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/33145