Original title:
Interakce plasmidových DNA se sloučeninami lanthanoidů
Translated title:
Plasmid DNAs interactions with lanthanoide compounds
Authors:
Budko, Kateryna ; Horák, Daniel (referee) ; Rittich, Bohuslav (advisor) Document type: Master’s theses
Year:
2016
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická Abstract:
[cze][eng]
V poslední době je věnována značná pozornost lanthanoidům a jejich komlexům jako vynikajícím katalyzátorům štěpení nukleových kyselin. Diplomová práce byla zaměřena na štěpení plasmidové a bakteriální DNA ionty Nd3+ a Y3+ a různými nosiči obsahujícími sloučeniny lanthanoidů. Vznik jednořetězcových a dvouřetězcových zlomů v molekule plasmidové DNA byl sledován pomocí agarózové gelové elektroforézy. Ověření štěpení bakteriální DNA bylo provedeno pomocí polymerázové řetězové reakce s použitím primerů specifických pro doménu Bacteria a rodově a druhově specifických primerů. Výsledky budou použity při vývoji metody, která umožní ověření dokonalosti pokrytí nosičů s magnetickým perovskitovým jádrem, a dalších nosičů obsahujících sloučeniny lanthanoidů.
Recently much attention is given to lanthanides and their complexes as excellent catalysts for cleavage of nucleic acids. The thesis has been focused on the cleavage of plasmid and bacterial DNA by ions Nd3+ and Y3+ and by different carriers containing the lanthanide compounds. The creation of single-stranded nicks and double-stranded ones in the plasmid DNA molecules was studied by agarose gel electrophoresis. Verification of the cleavage of bacterial DNA was made by polymerase chain reaction using primers specific for the domain Bacteria and genus and species-specific primers. The results will be used in the development of the method that will allow perfect carriers`s coverage verification with the magnetic perovskit nucleus and other carriers with the lanthanide compounds.
Keywords:
bacterial DNA; cleavage; DNA pUC19; gel electrophoresis; lanthanides; polymerase chain reaction; bakteriální DNA; DNA pUC19; gelová elektroforéza; lanthanoidy; polymerázová řetězová reakce; štěpení
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/58294