Original title: Komparační analýza genomických dat pomocí grafické reprezentace
Translated title: Similarity/dissimilarity analysis of genomic data on the basis of graphical representation
Authors: Těthal, Jiří ; Provazník, Ivo (referee) ; Maděránková, Denisa (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2011
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Práce se zabývá identifikací druhů živočichů pomocí denzity nukleotidů mitochondriálního genu CO1. V první části práce jsou teoreticky shrnuty informace o DNA barcodingu a buněčné organele mitochondrii, která s touto metodou úzce souvisí. Druhá část se již prakticky zabývá porovnáváním různých sekvencí s využitím denzity jejich nukleotidů. K tomuto účelu byl vytvořen program, který využívá dvě funkce, přičemž první ze zadaných sekvencí nukleotidů vypočítá jejich denzitu a druhá dokáže tyto denzity porovnat distanční metodou. The work deals with the identification of species of animal through the density of nucleotids of mitochondrial gene CO1. In the first part the theory summarized information about DNA barcoding and the mitochondria, cellular organel that with this method is closely related. The second part deals with virtually comparing different sequences using the density of nucleotides. For this it was created program, which uses two functions, the first of the specified nucleotide sequence calculates the density and one can compare the density by distance methods.
Keywords: BOLD; CBOL; dendrogram; density of DNA; distance; DNA barcoding; fasta; gene CO1; genome; iBOL; mitochondria; mitochondrial DNA; PCR; species; BOLD; CBOL; dendrogram; denzita DNA; distance; DNA barcoding; druh; fasta; gen CO1; genom; iBOL; mitochondrie; mitochondriální DNA; PCR

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/1940

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-237369


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses