Original title: Bootstrappingové metody ve fylogenetice
Translated title: Bootstrap methods in phylogenetics
Authors: Sedlář, Karel ; Vohánka,, Jaroslav (referee) ; Škutková, Helena (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2011
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
V posledních desetiletích zaznamenala fylogenetická rekonstrukce velký rozvoj. Použitím nově získaných molekulárních znaků a počítačového zpracování bylo dosaženo toho, že začala být brána jako objektivní věda. Rychlý vývoj však ukázal, že je potřeba výsledky vyhodnotit, neboť nové techniky vytvořily fylogramy i z nespolehlivých dat. Pro tyto účely byly do fylogenetiky aplikovány vzorkovací statistické metody, z nichž později začal převládat bootstrapping. I ten má však omezení, se kterými je nutno počítat při interpretaci výsledků, které nám poskytl. Spojením principů bootstrappingu a konsenzuálních stromů však lze získat fylogramy, jejichž vlastnosti jsou lepší než vlastnosti klasických fylogramů jak prokazuje tato práce. In recent decades, phylogenetic reconstruction has noted great development. It was achieved by using newly acquired molecular characteristics and processing that it began to be taken as an objective science. Rapid development showed that it is necessary to evaluate the results because new techniques provided phylograms from unreliable data. For these purposes, statistical sampling methods have been applied to the phylogeny, of which bootstrapping began later to dominate. However, it also has limitations, which should be considered during interpreting the results it provided to us. This work demonstrates by combining the principles of bootstrapping and consensus trees we can obtain phylograms with better properties than those of conventional phylograms.
Keywords: bootstrapping; consense tree; dendrogram; jackknife; OTU; phylogenetics; phylogram; support; bootstrapping; dendrogram; fylogenetika; fylogram; jackknife; konsenzuální strom; OTU; podpora

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/1929

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-237367


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses