Original title: Aplikace pro zpracování dat z oblasti evoluční biologie
Translated title: Application for the Data Processing in the Area of Evolutionary Biology
Authors: Radakovič, Lukáš ; Burgetová, Ivana (referee) ; Očenášek, Pavel (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2015
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Tato bakalářská práce se zabývá návrhem a implementací aplikace, která má za úkol ověřit správnost algoritmu sloužícího na analýzu použitých mechanismů při tvorbě fylogenetického stromu. Aplikace umožňuje uživatelům zadat různé parametry fylogenetického stromu, jeho následné vytvoření a analýzu pomocí algoritmu. Výsledky analýzy se uloží do výstupního souboru, přičemž uživatel má možnost nastavit cestu. Zkoumaný algoritmus správně odhaduje podíl mechanismů na tvorbě stromu. Při odhadu relativního a absolutního podílu na změně počtu chromozomů a velikosti genomu nedosahuje přesné výsledky. This Bachelor’s thesis describes the design and implementation of the application that has the task to verify the accuracy of the algorithm. Purpose of the algorithm is to analyze mechanisms used in the creation of the phylogenetic tree. The application allows users to specify different parameters of phylogenetic tree, its generation and subsequent analysis using an algorithm. Results of the analysis are written to the output file, giving the user the option of setting file path. Studied algorithm correctly estimates the participation of specific mechanism in the tree formation. Estimates of the absolute and relative share of changes in chromosome number and genome size are less than accurate results.
Keywords: aneuploidy; chromosome fission; chromosome fusion; Phylogenetic tree; polyploidy; proliferation of DNA; removal of DNA; aneuploidie; Fylogenetický strom; odstranění DNA; polyploidie; proliferace DNA; rozpad chromozomů; spojení chromozomů

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/52366

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-235042


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses