host ::
| Hlavní stránka > Vysokoškolské kvalifikační práce > Rigorózní práce > Paratrypanosoma is a novel early-branching trypanosomatid |
Název:
Paratrypanosoma is a novel early-branching trypanosomatid
Autoři: SKALICKÝ, Tomáš
Typ dokumentu: Rigorózní práce
Rok: 2014
Jazyk: eng
Abstrakt: The kinetoplastids are a widespread and important group of single-celled eukaryotes, many of which are devastating parasites of animals, including humans. We have discovered a new insect trypanosomatid in the gut of Culex pipiens mosquitoes. Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase- and SSU rRNA-based phylogenetic analyses show this parasite to constitute a distinct branch between the free-living Bodo saltans and the obligatory parasitic clades represented by the genus Trypanosoma and other trypanosomatids. From draft genome sequence data, we identified 114 protein genes shared among the new flagellate, 15 trypanosomatid species, B. saltans, and the heterolobosean Naegleria gruberi, as well as 129 protein genes shared with the basal kinetoplastid Perkinsela sp. Individual protein phylogenies together with analyses of concatenated alignments show that the new species, here named Paratrypanosoma confusum n. gen., n. sp., branches with very high support at the base of the family Trypanosomatidae. P. confusum thus represents a long-sought-after missing link between the ancestral free-living bodonids and the derived parasitic trypanosomatids. Further analysis of the P. confusum genome should provide insight into the emergence of parasitism in the medically important trypanosomatids.
Klíčová slova: genome sequencing; insect trypanosomatid; Paratrypanosoma; phylogenetics
Citace: SKALICKÝ, Tomáš. Paratrypanosoma is a novel early-branching trypanosomatid. České Budějovice, 2014. rigorózní práce (RNDr.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta
Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU.
Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/39398
Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-173266
Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Vysokoškolské kvalifikační práce > Rigorózní práce
Autoři: SKALICKÝ, Tomáš
Typ dokumentu: Rigorózní práce
Rok: 2014
Jazyk: eng
Abstrakt: The kinetoplastids are a widespread and important group of single-celled eukaryotes, many of which are devastating parasites of animals, including humans. We have discovered a new insect trypanosomatid in the gut of Culex pipiens mosquitoes. Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase- and SSU rRNA-based phylogenetic analyses show this parasite to constitute a distinct branch between the free-living Bodo saltans and the obligatory parasitic clades represented by the genus Trypanosoma and other trypanosomatids. From draft genome sequence data, we identified 114 protein genes shared among the new flagellate, 15 trypanosomatid species, B. saltans, and the heterolobosean Naegleria gruberi, as well as 129 protein genes shared with the basal kinetoplastid Perkinsela sp. Individual protein phylogenies together with analyses of concatenated alignments show that the new species, here named Paratrypanosoma confusum n. gen., n. sp., branches with very high support at the base of the family Trypanosomatidae. P. confusum thus represents a long-sought-after missing link between the ancestral free-living bodonids and the derived parasitic trypanosomatids. Further analysis of the P. confusum genome should provide insight into the emergence of parasitism in the medically important trypanosomatids.
Klíčová slova: genome sequencing; insect trypanosomatid; Paratrypanosoma; phylogenetics
Citace: SKALICKÝ, Tomáš. Paratrypanosoma is a novel early-branching trypanosomatid. České Budějovice, 2014. rigorózní práce (RNDr.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta
Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU.
Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/39398
Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-173266
Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Vysokoškolské kvalifikační práce > Rigorózní práce
Záznam vytvořen dne 2014-05-01, naposledy upraven 2023-01-15.