Název: Genotypizace bakterií rodu \kur{Xanthomonas} patogenních pro rajče a papriku multilokusovým sekvenováním
Překlad názvu: Genotyping of bacterial genus \kur{Xanthomonas} pathogenic for tomato and pepper by multilocus sequencing.
Autoři: STEHLÍKOVÁ, Dagmar
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2013
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Předmětem této bakalářské práce je zjištění míry příbuznosti u 20 sbírkových izolátů rodu Xanthomonas způsobujících bakteriální skvrnitost rajčat a paprik. K určení příbuznosti byla použita metoda multilokusové sekvenční analýzy (MLSA). Byly zjištěny sekvence genů atpD, rpoD, gyrB, glnA a efP, které byly analyzovány pomocí softwaru MEGA verze 5.1. Výsledek byl vyhodnocen pomocí dendrogramu, dle kterého byly izoláty rozděleny do dvou klastrů. První klastr zahrnuje izoláty druhu Xanthomonas euvesicatoria spadající do skupiny A. Druhý klastr pak zahrnuje izoláty druhu Xanthomonas vesicatoria skupiny B. Výsledky dosažené v této práci se shodují se současnou klasifikací xanthomonád způsobujících bakteriální skvrnitost rajčat a paprik. The subject of this bachelor thesis is to estimate the degree of relationship of 20 collected isolated samples of Xanthomonas genus causing bacterial spot of tomatoes and peppers. To assess the relationship, the method of multilocus sequence analysis has been used (MLSA). Sequences of genes atpD, rpoD, gyrB, glnA and efP were found and analyzed using MEGA software version 5.1. The result was evaluated using a dendrogram according to which the isolates were divided into two clusters. The first cluster includes isolated of Xanthomonas euvesicatoria belonging to group A. The second cluster includes isolates of the species Xanthomonas vesicatoria belonging to group B. The results obtained in this work are consistent with the present classification of the xanhtomonads causing bacterial spot of tomatoes and peppers.
Klíčová slova: \kur{Xanthomonas}; klasifikace; MLSA; rajče a paprika; sekvenování; \kur{Xanthomonas}; classification; MLSA; sequencing; tomato and pepper
Citace: STEHLÍKOVÁ, Dagmar. Genotypizace bakterií rodu \kur{Xanthomonas} patogenních pro rajče a papriku multilokusovým sekvenováním. České Budějovice, 2013. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Fakulta zemědělská a technologická

Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU.
Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/27879

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-154255


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce