Název: Structure-function analysis of selected hop (Humulus lupulus L.) regulatory factors
Překlad názvu: Structure-function analysis of selected hop (Humulus lupulus L.) regulatory factors
Autoři: FÜSSY, Zoltán
Typ dokumentu: Disertační práce
Rok: 2013
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Práce byla soustředěna na izolaci nových transkripčních faktorů (TF) chmelu z rodin bHLH, bZIP, MYB a WRKY, které se účastní regulace metabolických drah flavonoidů lupulinových žlázek. Následně byla provedena strukturní a funkční analýza těchto faktorů. Strukturní analýza zahrnovala metody bioinformatiky pro predikci genové organizace, doménové struktury předpokládaných proteinových produktů a potencionální post-translační modifikace. Provedl jsem mutagenezi pro odhalení funkce fosforylačních míst pro stabilitu HlbZIP1A. Dále tato práce zjistila protein-DNA interakce získaných TF a podpořila vazbu komplexů MYB-bHLH-WDR na promotor chalkonsyntázy H1, klíčového enzymu syntézy flavonoidů lupulinu. Použitím bioinformatických metod, kvantitativní RT-PCR a tranzientní koexprese jsem ukázal, že chalkonsyntáza H1 je regulačním bodem při metabolické odpovědi chmelu v průběhu patogeneze viroidu zakrslosti chmelu. This work concentrated on isolation of novel hop transcription factors from bHLH, bZIP, MYB, and WRKY families involved in the regulation of lupulin flavonoid pathways, followed by their structural and functional analysis. Structural analyses included bioinformatic approaches to elucidate gene organization, domain structure of the putative protein products, and potential post-translational modifications. I performed site-directed mutagenesis to disclose the role of phosphorylation sites in HlbZIP1A stability. Further, this work determined protein-DNA interactions for obtained TFs, giving support to the binding of MYB-bHLH-WDR complexes to the promoter of chalcone synthase H1, a key enzyme of the lupulin flavonoid pathways. Employing bioinformatic approaches, quantitative RT-PCR and transient co-expression, I pointed out chalcone synthase H1 as a regulatory crossroads in the metabolic (flavonoid) responses during hop stunt viroid pathogenesis.
Klíčová slova: flavonoid; Humulus lupulus; transkripční faktory; viroid zakrslosti chmele; flavonoid; hop stunt viroid; Humulus lupulus; trancription factors
Citace: FÜSSY, Zoltán. Structure-function analysis of selected hop (Humulus lupulus L.) regulatory factors. České Budějovice, 2013. disertační práce (Ph.D.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU.
Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/13952

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-151840


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Vysokoškolské kvalifikační práce > Disertační práce