|
Analýza stability lineárních systémů
Jelen, Michal ; Jeřábek, Jan (oponent) ; Koton, Jaroslav (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se bude zabývat analýzou stability lineárních systémů. V teoretické části bude zmíněna stabilita a její podmínky, kritéria stability, jejich rozdělení do skupin a popis jednotlivých kritérií. V praktické části se vybere jedno kritérium stability se kterým se následně bude pracovat. Zkoumaným obvodem bude filtr s proudovými konvejory, jakožto aktivními prvky, ze kterého bude získán charakteristický polynom. V příkladech se bude pracovat s přenosovými funkcemi aktivních prvků prvního i druhého řádu. Bude vytvořen program, který umožní automatizovat Routhovo kritérium stability a vykreslení grafických výstupů v závislosti na vstupních parametrech a jejich hodnotách.
|
|
Detekce mutací spojovaných se zvýšeným výskytem nádorů prsu a vaječníků pomocí moderních metod molekulární biologie
RÁJOVÁ, Kristýna
Karcinom prsu a vaječníků je jedno z nejčastějších maligních onemocnění žen v České republice a incidence nových diagnóz má tendence stoupat. Odhaduje se, že v 5 10 % případů těchto nádorů je příčinou patogenní mutace ve vysoce penetrantních tumorsupresorových genech BRCA1 nebo BRCA2. Hlavní funkcí těchto genů jsou opravy zlomů dvouvláknové DNA, kontrola buněčného dělení a spolupodílejí se i na regulaci transkripce a remodelaci chromatinu. Cílem této práce bylo shrnutí současných poznatků na dané téma, genové mutace, funkce genů BRCA1 a BRCA 2 a jejich souvislost s hereditárním karcinomem prsu a vaječníků, přehled možných metod detekce těchto mutací a zvláště také shrnutí českých studií o zabývajících se výskytem mutací BRCA1 a BRCA2 na území České republiky od počátku jejich testování v rámci preventivní i diagnostické péče. To poukázalo na silný efekt zakladatelských mutací. Mezi nejčastěji nalézanými mutacemi v České republice byly mutace c.5266dupC, c.181T>G a c.3700_3704del5 v genu BRCA1 a c.7913_7917del5 a c.8537_8538del2 v genu BRCA2. V experimentální části práce jsem se pokusila optimalizovat metodu PCR ARMS pro detekci bodové mutace c.5266dupC v genu BRCA1. Tato mutace patří mezi nejčastěji se vyskytující mutace nejen v České republice, ale i v Evropě. Cílem bylo optimalizovat metodu PCR ARMS v podmínkách laboratoře GENLABS s.r.o. V rámci optimalizace šlo především o výběr vhodného PCR mixu a úpravu teplotního profilu PCR, při kterém bude kvalita i kvantita výtěžku vizualizovaná pomocí gelové elektroforézy dostatečná pro prokázání přítomnosti či nepřítomnosti mutace u pacienta. V této části práce bylo cílem i praktické zvládnutí izolace DNA z periferní krve a bukálního stěru, příprava a provedení PCR reakce a detekce PCR produktů pomocí gelové elektroforézy. Nakonec se nám podařilo metodu optimalizovat pro dvě různé matrice, pro izolát DNA a periferní krev. Pro bukální stěr se metodu podařilo optimalizovat pouze částečně. Při postupném zvyšování teploty annealingu začínající na teplotě 55 °C, jsme nejlepších výsledků dosáhli při teplotě 65,5 ° za použití kitu gb Basic PCR Master Mix od firmy Generi Biotech. Tato optimalizace může v budoucnu umožnit použití metody pro cílenou detekci mutace c.5266dupC v genu BRCA1 v rámci rutinní praxe v laboratoři.
|
|
Wavelet-based Realized Variation and Covariation Theory
Baruník, Jozef ; Vošvrda, Miloslav (vedoucí práce) ; Kočenda, Evžen (oponent) ; Di Matteo, Tiziana (oponent) ; Veredas, David (oponent)
Czech Abstract Kvadratická variace a kovariace se během několika posledních desetiletí staly jedněmi z nejfrekventovanějších, ale také nejúspěšněji studovaných témat ekonometrie časových řad. Tato disertace obsahuje kompletní teorii odhadu realizované variace a kovariace. Tato teorie je zobecněním současného stavu poznání v dané oblasti, přičemž vlastním přínosem je odhad veličin v časově frekvenční doméně. Zatímco první část teorie je věnována jednorozměrnému odhadu realizované variace pomocí waveletů, druhá část přináší vícerozměrný protějšek této teorie: odhad realizované kovariace pomocí waveletů. Konkrétními přínosy k již známým přístupům k realizované variaci je jednak robusti- fikace šumu, který nově nemusí být nutně Gaussovský a může obsahovat skoky, dále pak možnost měřit realizovanou variaci a kovariaci nejen v časové, ale i frekvenční doméně. Teorie je ověřena pomocí numerické studie zkoumající výkonnost z ní odvozených odhadů na malých vzorcích a srovnávající tyto odhady s ostatními užívanými odhady realizované variace, přičemž odhady jsou srovnány pomocí simulace při různých úrovních šumu a ve- likosti skoků. Výsledky studie ukazují, že tyto nové odhady dosahují...
|
|
Kmitočtové filtry s řiditelným proudovým zesilovačem
Jemelík, Lukáš ; Lattenberg, Ivo (oponent) ; Jeřábek, Jan (vedoucí práce)
Bakalářská práce pojednává o návrhu aktivních kmitočtových filtrů druhého řádu, které budou využívat aktivní prvky. Tyto filtry byly navrženy pomocí metody autonomních obvodů. Aktivními prvky jsou řiditelný proudový zesilovač DCCA a vícevýstupový proudový sledovač MO-CF. Všechny navržené filtry pracují v proudovém módu. Práce je rozdělena do pěti kapitol. V úvodní kapitole jsou obecně popsány vlastnosti kmitočtových filtrů, druhá se zaobírá popisem použitých aktivních prvků, třetí použitými návrhovými metodami. Ve čtvrté kapitole jsou popsána jednotlivá zapojení, jejich přenosové funkce a ověření jejich funkčnosti v počítačovém software.
|
|
Plně diferenční kmitočtové filtry v proudovém módu
Kubík, Milan ; Koton, Jaroslav (oponent) ; Jeřábek, Jan (vedoucí práce)
Bakalářská práce je zaměřena na návrh plně diferenčních kmitočtových filtrů v proudovém módu. V první části práce je seznámení s problematikou kmitočtových filtrů a vytvářením diferenčních struktur v proudovém módu. Poté následuje seznámení s použitými aktivními prvky - digitálně řiditelný proudový zesilovač DCCA (Digitally Controlled Current Amplifier) a vícevýstupový proudový sledovač MO-CF (Multiple Output Current Follower). Klíčovým bodem je vlastní návrh difrenčních filtrů, který je rozdělen na tři části. V první části návrhu jsou vytvářeny filtry za pomoci předloh z programu FilterPro. Vznikla obvodová řešení umožňující realizaci kmitočtových filtrů typu dolní propust, horní propust a pásmová propust. V další části jsou dva návrhy filtrů odvozených z autonomních obvodů pracující jako dolní a horní propust. V poslední části jsou navrženy dva typy integračních článků – ztrátový a bezeztrátový. Spojením těchto obvodů vzniklo kaskádní zapojení realizující tři filtrační funkce a to pásmovou propust 1, pásmovou propust 2 a dolní propust. Na závěr je zhodnocení celé práce a vytvořených struktur filtrů.
|
|
Novel active function blocks and their applications in frequency filters and quadrature oscillators
Herencsár, Norbert ; Zahradník, Pavel (oponent) ; Kolka, Zdeněk (oponent) ; Lattenberg, Ivo (vedoucí práce)
Frequency filters and sinusoidal oscillators are linear electric circuits that are used in wide area of electronics and also are the basic building blocks in analogue signal processing. In the last decade, huge number of active building blocks (ABBs) were presented for this purpose. In 2000 and 2006, the universal current conveyor (UCC) and the universal voltage conveyor (UVC), respectively, were designed at the Department of Telecommunication, BUT, Brno, and produced in cooperation with AMI Semiconductor Czech, Ltd. There is still the need to develop new active elements that offer new advantages. The main contribution of this thesis is, therefore, the definition of other novel ABBs such as the differential-input buffered and transconductance amplifier (DBTA), the current follower transconductance amplifier (CFTA), the z-copy current-controlled current inverting transconductance amplifier (ZC-CCCITA), the generalized current follower differential input transconductance amplifier (GCFDITA), the voltage gain-controlled modified current-feedback operational amplifier (VGC-MCFOA), and the minus-type current-controlled third-generation voltage conveyor (CC-VCIII-). Using the proposed ABBs, novel structures of first-order all-pass filters, second-order universal filters, KHN-equivalent circuits, inverse filters, active grounded inductance simulators, and quadrature sinusoidal oscillators working in the current-, voltage-, or mixed-mode are presented. The behavior of the proposed circuits has been verified by SPICE simulations and in selected cases also by experimental measurements.
|
|
Segmentace cévního řečiště na snímcích sítnice s využitím statistických metod
Šolc, Radek ; Walek, Petr (oponent) ; Odstrčilík, Jan (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá problematikou segmentace krevního řečiště ze snímku fundus kamery. Teoretická část pojednává o základních charakteristikách těchto snímku. Jsou zde probrány nynější přístupy k segmentaci krevního řečiště. Cíl praktické části je návrh metody využívající statistického modelu. Postupně je vytvářen model využívající Studentova rozdělení, použitelný pro automatickou segmentaci. Do tohoto modelu byl zapojen nejprve iterační algoritmus E-M a poté model založený na Markovských náhodných polích z důvodu zvýšeni robustnosti celého modelu vůči šumu. Kontrast mezi tenkými cévami a okolím byl zvýšen ve fázi předúpravy obrazu pomocí diskrétní vlnovkové transformace. Výstupní binární obraz vlnkové transformace je použit jako maska pro snížení intenzity odstínu šedi tenkých cév a zesvětlení okolí patřící pozadí sítnice. Celý model byl implementován v prostředí Matlab. Navržený model byl testována na celé databázi snímků HRF. Výstupní binární obrazy byli kvantitativně hodnoceny v porovnání s zlatými standardy HRF.
|
|
Analysis of Thick Film Amperometrical Sensors Signal and Its Usage for Measurement and Characterization of Enzymes
Ondruch, Vít ; Kizek, René (oponent) ; Masojídek,, Jiří (oponent) ; Vrba, Radimír (vedoucí práce)
The principle of synchronous detection (SD) has been applied to biosensor measurement. SD principle achieves significant increases in the signal-to-noise ratio, limit of detection and overall measurement robustness. Application of SD in biosensor measurements improves the analysis of the response and avoids the influence of interference/noise produced by stirring, electromagnetic effects and influence of parasitic currents. SD also enables to decompose the signal to stimulation response and phenomena with long time of response and last but not least, to identify second-order phenomena in the signal. Linear statistical model was used to develop software for identification of the stimulation signal in the output current. SD was applied to the response signal of a Photosystem II complex (PSII) biosensor. PSII response to light stimulation follows first order kinetics. The inhibition kinetics of PSII has been studied. Kinetic constants of herbicide binding to PSII depend linearly on herbicide concentration and enable measurement of its concentration at low concentrations.
|
|
A study of binary stars with accretion disks
Chadima, Pavel ; Harmanec, Petr (vedoucí práce) ; Krtička, Jiří (oponent) ; Mourard, Denis (oponent)
Tato disertační práce obsahuje spektroskopické analýzy dvou neobvyklých dvojhvězd s diskem kolem jedné ze složek - β Lyr a ǫ Aur. Několik stovek optických spekter bylo zpracováno a analyzováno pro obě dvojhvězdy, což vedlo k několika původním výsledkům. Pro β Lyr jde o objev slabého spektra pocházejícího z pseudofotosféry disku a skrytého satelitního spektra, přítomného pouze během zákrytu, které je způsobeno dodatečnou absorpcí světla primáru procházejícího skrze plynou obálku kolem sekundáru. V případě ǫ Aur vedly analýzy k objevu zjevné multiperiodické proměnnosti spektrálních čar během zákrytu s hlavní společnou periodou 66d .21 a dále k objasnění komplexních profilů čáry Hα během zákrytu, které jsou opět způsobeny dodatečnou absorpcí světla primáru v atmosféře tmavého disku okolo sekundáru. Pro ǫ Aur bylo též získáno velké množství měření radiálních rychlostí a fotomet- rických měření, které byly pouzity na výpočet nového přesného orbitálního řešení této dvojhvězdy. Dále pak bylo provedeno hydrodynamické a "zářivé" modelování diskrétního přenosu hmoty mezi složkami blízké dvojhvězdy, což vedlo k vytvoření eliptického disku s pomalou prográdní rotací. Profil Hα čáry...
|
|
Dielektrická spektroskopie karboxymetylcelulózy v časové oblasti
Palai-Dany, Tomáš ; Lelák, Jaroslav (oponent) ; Mentlík, Václav (oponent) ; Liedermann, Karel (vedoucí práce)
Práce se zabývá dielektrickou relaxační spektroskopií karboxymetylcelulózy v časové oblasti. V rámci experimentálních prací bylo navrženo a postupně dále vyvíjeno měřicí pracoviště umožňující záznam časového průběhu vybíjecích proudů dielektrik, jeho zpracování a analýzu. Předmětem měření byla karboxymetylcelulóza, což je jednoduchý polysacharid používaný v širokém spektru aplikací, mezi jiným i v biomedicínském inženýrství. Studium vlastností karboxymetylcelulózy si vyžádalo vytvoření vlastního experimentálního zařízení, v němž byly ošetřeny stabilizace vzorku před měřením, jeho nabíjení i vybíjení v definovaných časových intervalech, přepínání mezi jednotlivými režimy, záznam měření, úpravy a zpracování naměřených signálů až po Fourierovu transformaci do frekvenční oblasti. Frekvenční průběh komplexní permitivity či jeho imaginární část, získaný Fourierovou transformací průběhu vybíjecího proudu dielektrika v časové oblasti, se pak označuje jako dielektrické spektrum. Vzhledem k tomu, že měření probíhala na velice nízkých úrovních měřeného signálu (pod 10-12 A), nejednalo se o právě jednoduchou záležitost. V rámci práce tak bylo nutné studovat a řešit otázky zemnění, šumu a citlivosti k různým vnějším vlivům. Hlavním těžištěm práce je matematické zpracování šumu přítomného ve vybíjecím proudu, tedy operace s původními získanými signály v časové oblasti směřující v podstatě k číslicové filtraci zaznamenaných dielektrických dat. Na to navazujícím cílem práce je objasnit dielektrické parametry zkoumaného vzorku karboxymetylcelulózy v co nejširším spektru frekvencí. Nedílnou součást práce tvoří výběr a aplikace metody převodu upraveného signálu do frekvenční oblasti. Měření včetně experimentální části i zpracování měřených dat bylo provedeno na Ústavu fyziky FEKT VUT Brno. Pro účely měření byl používán elektrometr Keithley 617, měřicí most HP 4284A a kryogenický systém Janis CCS-400-204. Výsledky měření byly doplněny měřením provedeným na V. katedře experimentální fyziky Přírodovědecké fakulty University Augsburg.
|
host ::
