|
|
Detailed Investigation of Human Galectins -1 and -3 by employing selectively deoxyfluorinated N-acetyllactosamines
Kurfiřt, Martin
This work is focused on a detailed investigation of supramolecular recognition events between human galectins -1 and -3 and monodeoxyfluorinated N-acetyllactosamine probes, which were previously prepared in our laboratory. The recognition was studied using a combination of X-ray crystallography, isothermal titration calorimetry and several advanced NMR techniques, such as 19F T2-filter, 1H–1H STD, 1H–15N CSP or 19F EXSY. These techniques provided insight into the thermodynamics and kinetics of recognition and enabled us to uncover of subtle differences between both investigated galectins. Such differences could be potentially exploited in the selective targeting of individual galectins with important implications for the galectins-focused\npharmaceutic industry.
Plný tet:  PDF
|
|
|
Polymeric nanomaterials for targeted inhibition of tumor growth
Šťastná, Katarína ; Etrych, Tomáš (vedoucí práce) ; Sedláček, Ondřej (oponent)
Galektiny jsou lektiny vázající sacharidy, které mají mnoho biologických aktivit souvisejících s vývojem a progresí rakoviny. Cílem této bakalářské práce je syntéza, fyzikálně-chemické a předběžné in vitro biologické hodnocení nových glykopolymerů s vysokou afinitou ke galektinu- 3. Bylo syntetizováno několik biokompatibilních ve vodě rozpustných lineárních a diblokových N-(2-hydroxypropyl)methakrylamidových (HPMA) kopolymerů nesoucích multivalentně prezentované glykomimetické ligandy. Připravené glykopolymery byly charakterizovány řadou analytických metod, např. GPC, UV-VIS spektrometrií, DLS a NMR. Polymerní nosiče byly syntetizovány řízenou RAFT polymerací, jejich molekulová hmotnost se pohybovala v rozmezí 25 000-33 000 g/mol a vykazovaly poměrně nízkou disperzitu. Glykopolymery obsahující asi 4 mol % glykomimetických ligandů vykazovaly vysokou schopnost inhibovat apoptózu T- lymfocytů in vitro. Nicméně hypotéza spočívající ve zlepšení biologické aktivity díky hustší prezentaci ligandu na diblokových kopolymerech se nepotvrdila. Závěrem je možné konstatovat, že připravené glykopolymery, jak lineární, tak i diblokové, by hypoteticky mohly být vhodnými nástroji pro synergickou terapii s polymerními systémy dopravujícími léčiva pro cílenou terapii rakoviny. Klíčová slova: polymery, HPMA...
|
|
|
Multivalentní sacharidové ligandy galektinů
Hovorková, Michaela ; Křen, Vladimír (vedoucí práce) ; Kavan, Daniel (oponent)
Galektiny jsou proteiny patřící do skupiny lektinů, které jsou schopné vázat sacharidové jednotky a dokážou specificky rozeznat glykany vystavené na povrchu buněk. Galektiny se in vivo účastní např. kancerogeneze, angiogeneze či fibrózy. Jejich výskyt signifikantně stoupá v souvislosti s řadou patogenních procesů, a proto je lze využít jako markery u některých typů rakovin nebo kardiopatologií a též pro cílenou vazbu terapeutik a/ nebo zobrazovacích činidel v diagnostice a terapii. Galektin-3 má specifickou strukturu označovanou jako chimerická a je schopný tvořit multivalentní oligomery. Přirozenými ligandy galektinů jsou glykany obsahující terminální β-galaktosidy, zvláště N-acetyllaktosamin, avšak vazba monovalentních glykanů je velmi slabá. Glykokonjugáty s vysokou afinitou ke galektinovým receptorům jsou optimálně multivalentní, biokompatibilní a stabilní in vivo. Tato kritéria splňují sacharidové ligandy konjugované na rozpustné a strukturně flexibilní N-(2-hydroxypropyl)methakrylamidové (HPMA) kopolymery. V rámci této práce byly pomocí enzymové syntézy připraveny dva druhy funkcionalizovaných disacharidů, založené na N-acetyllaktosaminu (Galβ4GlcNAc) a jeho strukturním analogu N,N'-diacetyllaktosaminu (GalNAcβ4GlcNAc). Pro syntézu byl použit komerční enzym β-galaktosidasa z Bacillus...
|
|
|
Genetická analýza nádorů hlavy a krku
Čapková, Markéta ; Plzák, Jan (vedoucí práce) ; Smilek, Pavel (oponent) ; Čelakovský, Petr (oponent)
Dlaždicobuněčné karcinomy hlavy a krku (HNSCC = head and neck squamous cell carcinoma) jsou pátou nejčastější skupinou maligních nádorů člověka. Jsou spojeny s vysokou morbiditou způsobenou jak primárním onemocněním, tak následnou léčbou. Léčebné výsledky této skupiny nádorů se výrazně nezlepšují a to navzdory značným pokrokům, kterých bylo v posledních desetiletích dosaženo v chirurgii a onkologii. Ve své práci jsem se zaměřila na analýzu genové exprese séra pacientů s nádory hlavy a krku, která navazovala na předchozí výzkum analýzy genové exprese přímo v nádorové tkáni. Dále jsme též zkoumali analýzu genové exprese v nádorovém stromatu, které se poslední dobou ukazuje jako významný faktor v iniciaci i progresi kancerogeneze. Zjistili jsme několik kandidátních genů, které jsou součástí signalizačních drah související s buněčnou diferenciací a proliferací a které jsou součástí apoptotické dráhy ( BCl-2, BCl-XL a MAX) a zároveň pokles exprese hlavního tumor supresorového genu p53. V peritumorální tkáni jsme zaznamenali zvýšenou expresi cytokinů typických pro embryonální vývoj a diferenciaci ektodermové tkáně - IGF-2 a BMP-4, které v médiu významně ovlivňují fenotyp normálních keratinocytů. Dále jsme identifikovali několik kandidátních genů souvisejících s expresí Gal-1 ve tkáni bohaté na stromální...
|
|
|
Studium epitelově mezenchymových interakcí v nádorech vycházejících z dlaždicových epitelů
Kodet, Ondřej ; Lacina, Lukáš (vedoucí práce) ; Borovanský, Jan (oponent) ; Ehrmann, Jiří (oponent)
Tato dizertační práce je tematicky věnována epitelově mezenchymovým interakcím v nádorech vycházejících z dlaždicových epitelů a to včetně minoritní buněčné populace (melanocytů) zastoupené v tomto epitelu. Navazuje také na předchozí studie na téma glykobiologie, resp. studium endogenních lektinů, galektinů, v dlaždicobuněčných karcinomech hlavy a krku. Galektiny reprezentují v současném pojetí buněčné a zejména pak nádorové biologie molekuly s nezanedbatelným potenciálem. Účastní se kromě regulace pre- i postnatální homeostázy v normálních tkáních také mnoha dějů patologických, jako jsou autoimunitní reakce či maligní bujení. V této práci jsme prokázali přítomnost galektinu-1 a -2 a jejich glykoligandů v interfazických a mitotických jádrech, kde se mohou podílet na regulaci buněčného cyklu. Dále jsme prokázali galektin-9 jako poměrně citlivý znak přechodu normálního epitelu v dysplastický dlaždicový epitel v oblasti hlavy a krku. Epitelově mezenchymové interakce reprezentují mechanizmy odpovídající za dynamické udržování homeostázy organizmu jak během prenatálního vývoje, postnatálního růstu, tak i během cyklické obměny některých tkání. Účastní se i fáze hojení, ale také hrají významnou úlohu v procesu nádorové transformace, progrese a metastazování. Tyto interakce napomáhají utvářet specifické...
|
|
|
Multivalentní sacharidové ligandy galektinů
Hovorková, Michaela ; Křen, Vladimír (vedoucí práce) ; Kavan, Daniel (oponent)
Galektiny jsou proteiny patřící do skupiny lektinů, které jsou schopné vázat sacharidové jednotky a dokážou specificky rozeznat glykany vystavené na povrchu buněk. Galektiny se in vivo účastní např. kancerogeneze, angiogeneze či fibrózy. Jejich výskyt signifikantně stoupá v souvislosti s řadou patogenních procesů, a proto je lze využít jako markery u některých typů rakovin nebo kardiopatologií a též pro cílenou vazbu terapeutik a/ nebo zobrazovacích činidel v diagnostice a terapii. Galektin-3 má specifickou strukturu označovanou jako chimerická a je schopný tvořit multivalentní oligomery. Přirozenými ligandy galektinů jsou glykany obsahující terminální β-galaktosidy, zvláště N-acetyllaktosamin, avšak vazba monovalentních glykanů je velmi slabá. Glykokonjugáty s vysokou afinitou ke galektinovým receptorům jsou optimálně multivalentní, biokompatibilní a stabilní in vivo. Tato kritéria splňují sacharidové ligandy konjugované na rozpustné a strukturně flexibilní N-(2-hydroxypropyl)methakrylamidové (HPMA) kopolymery. V rámci této práce byly pomocí enzymové syntézy připraveny dva druhy funkcionalizovaných disacharidů, založené na N-acetyllaktosaminu (Galβ4GlcNAc) a jeho strukturním analogu N,N'-diacetyllaktosaminu (GalNAcβ4GlcNAc). Pro syntézu byl použit komerční enzym β-galaktosidasa z Bacillus...
|
|
|
The role of galectins in cancer cell invasiveness
Remišová, Michaela ; Brábek, Jan (vedoucí práce) ; Kovář, Marek (oponent)
Galektiny jsou skupinou proteinů vázajících β-galaktozidázu, které mají mnoho funkcí ve všech druzích savčích buněk. V uplynulých letech se ukázalo, že galektiny, jmenovitě galektin-1 a galektin-3, mají důležitou roli v procesech nádorové progrese, včetně invazivity nádorových buněk, procesu nezbytného pro tvorbu metastáz. Jak extracelulární, tak intracelulární formy galektinů modifikují proces invazivity různými způsoby, a to interakcí s různými komponentami buňky nebo buněčných signalizačních drah. Cílem této bakalářské práce je shrnout mechanismy, kterými galektiny zvyšují invazivitu nádorových buněk. Klíčová slova: galektiny, galektin-1, galektin-3, invazivita, nádorová onemocnění, metastázy
|
|
|
Studium epitelově mezenchymových interakcí v nádorech vycházejících z dlaždicových epitelů
Kodet, Ondřej ; Lacina, Lukáš (vedoucí práce) ; Borovanský, Jan (oponent) ; Ehrmann, Jiří (oponent)
Tato dizertační práce je tematicky věnována epitelově mezenchymovým interakcím v nádorech vycházejících z dlaždicových epitelů a to včetně minoritní buněčné populace (melanocytů) zastoupené v tomto epitelu. Navazuje také na předchozí studie na téma glykobiologie, resp. studium endogenních lektinů, galektinů, v dlaždicobuněčných karcinomech hlavy a krku. Galektiny reprezentují v současném pojetí buněčné a zejména pak nádorové biologie molekuly s nezanedbatelným potenciálem. Účastní se kromě regulace pre- i postnatální homeostázy v normálních tkáních také mnoha dějů patologických, jako jsou autoimunitní reakce či maligní bujení. V této práci jsme prokázali přítomnost galektinu-1 a -2 a jejich glykoligandů v interfazických a mitotických jádrech, kde se mohou podílet na regulaci buněčného cyklu. Dále jsme prokázali galektin-9 jako poměrně citlivý znak přechodu normálního epitelu v dysplastický dlaždicový epitel v oblasti hlavy a krku. Epitelově mezenchymové interakce reprezentují mechanizmy odpovídající za dynamické udržování homeostázy organizmu jak během prenatálního vývoje, postnatálního růstu, tak i během cyklické obměny některých tkání. Účastní se i fáze hojení, ale také hrají významnou úlohu v procesu nádorové transformace, progrese a metastazování. Tyto interakce napomáhají utvářet specifické...
|
|
|
Genetická analýza nádorů hlavy a krku
Čapková, Markéta ; Plzák, Jan (vedoucí práce) ; Smilek, Pavel (oponent) ; Čelakovský, Petr (oponent)
Dlaždicobuněčné karcinomy hlavy a krku (HNSCC = head and neck squamous cell carcinoma) jsou pátou nejčastější skupinou maligních nádorů člověka. Jsou spojeny s vysokou morbiditou způsobenou jak primárním onemocněním, tak následnou léčbou. Léčebné výsledky této skupiny nádorů se výrazně nezlepšují a to navzdory značným pokrokům, kterých bylo v posledních desetiletích dosaženo v chirurgii a onkologii. Ve své práci jsem se zaměřila na analýzu genové exprese séra pacientů s nádory hlavy a krku, která navazovala na předchozí výzkum analýzy genové exprese přímo v nádorové tkáni. Dále jsme též zkoumali analýzu genové exprese v nádorovém stromatu, které se poslední dobou ukazuje jako významný faktor v iniciaci i progresi kancerogeneze. Zjistili jsme několik kandidátních genů, které jsou součástí signalizačních drah související s buněčnou diferenciací a proliferací a které jsou součástí apoptotické dráhy ( BCl-2, BCl-XL a MAX) a zároveň pokles exprese hlavního tumor supresorového genu p53. V peritumorální tkáni jsme zaznamenali zvýšenou expresi cytokinů typických pro embryonální vývoj a diferenciaci ektodermové tkáně - IGF-2 a BMP-4, které v médiu významně ovlivňují fenotyp normálních keratinocytů. Dále jsme identifikovali několik kandidátních genů souvisejících s expresí Gal-1 ve tkáni bohaté na stromální...
|
host ::
RSS.