|
|
Deconvolution fluorescence microscopy of yeast cells
Štec, Tomáš ; Plášek, Jaromír (vedoucí práce) ; Heřman, Petr (oponent)
Název práce: Využití dekonvoluce v digitální fluorescenční mikroskopii kvasinek Autor: Tomáš Štec Katedra/ústav: Fyzikální ústav Univerzity Karlovy Vedoucí diplomové práce: prof. RNDr. Jarmoír Plášek, CSc., Fyzikální ústav UK Abstrakt: Fluorescenční mikroskopie představuje rychlou a levnou alternativu k po- kročilejším metodám zobrazování jako jsou konfokální a elektronová mikroskopie. Snímaný obraz je však zatížen velkou mírou zkreslení. Pomocí počítačového zpraco- vání obrazu - dekonvoluce, lze do značné míry eliminovat zkreslení obrazu, čím se umožní rekonstrukce třírozměrné podoby snímaných objektů. V této práci je pod- robně prozkoumána dekonvoluční procedura programu NIS Elements AR, která je následně aplikována na rekonstrukci třírozměrné podoby kvasinek Saccharomyces cerevisiae barvených calcofluorem, s cílem charakterizovat změny vzhledu bunkové stěny v průběhu stárnutí. S rostoucím věkem kvasinky se na povrchu objevují ne- rovnosti, ke konci života dochází i k praskání bunkové stěny. Klíčová slova: fluorescence, mikroskopie, dekonvoluce, NIS Elements AR, calcof- luor, kvasinky, bunková stěna, stárnutí
|
|
|
Reaktivnost křemene v experimentálních maltových tělesech
Kuchyňová, Markéta ; Kuchařová, Aneta (vedoucí práce) ; Vavro, Martin (oponent)
Alkalicko-silikátová reakce (ASR) je jednou z nejničivějších chemických reakcí, které mohou probíhat v betonu a nenávratně jej poškodit. K ASR dochází, pokud jsou splněny následující podmínky: dostatečná vlhkost (> 80 %), dostatečné množství alkálií (Ca2+ , Na+ , K+ ) a reaktivní kamenivo (převážně špatně krystalické, deformované až amorfní formy SiO2). Reaktivní kamenivo, reaguje s vysoce zásaditými pórovými roztoky za vzniku hydrofilních gelů, které zvětšují svůj objem. Reaktivita kameniva je standardně testována pomocí dilatometrických zkoušek. Tyto zkoušky jsou založeny na vytvoření zkušebního tělesa, které je uloženo v prostředí urychlujícím vznik ASR. Délkové změny tělesa jsou způsobeny tvorbou a expanzí alkalicko-silikátových gelů. V rámci diplomové práce byla posouzena náchylnost křemenem bohatých typů hornin k ASR (křemenec, metadroba, kvarcit, pegmatitový křemen) za pomoci mikroskopických (optická mikroskopie, skenovací elektronová mikroskopie kombinovaná s analýzou obrazu) a dilatometrických (ASTM C1260, RILEM AAR-4.1) metod. Horniny byly zařazeny dle reaktivnosti do kategorií podle ASTM C1260 (reaktivní, potenciálně reaktivní, nereaktivní). Reaktivita hornin úzce souvisela s obsahem kryptokrystalické křemenné matrix, velikostí zrn, tvarem hranice zrn a výskytem subzrn či undulózního...
|
|
| |
|
|
Mikroskopie listů různých druhů rodu Bergenia.
Rulfová, Kateřina ; Spilková, Jiřina (vedoucí práce) ; Kašparová, Marie (oponent)
Rostliny rodu Bergenia jsou součástí léčebných prostředků užívaných v ajurvédské medicíně. Důležitou roli hrají i v tradiční lidové medicíně na území Číny, Indie, Mongolska a Ruska. Teoretická část této práce shrnuje nejnovější poznatky a výsledky výzkumů týkajících se tří zástupců rodu Bergenia: Bergenia ciliata (Haw.) Sternb., Bergenia crassifolia (L.) Fritsch a Bergenia ornata Stein. V tomto souhrnu se práce zaměřuje převážně na jejich stávající a potenciální využití v medicíně a farmacii. Extrakt z bergenie je tradičně využíván například k rozpouštění ledvinných kaménků, k léčbě onemocnění respiračního traktu a k zastavení krvácení. Uvedeny jsou i nejdůležitější obsahové látky přítomné v těchto rostlinách, jejich charakteristika a účinky. Bergenie jsou významným zdrojem arbutinu a bergeninu. Bergenin má antitusické, gastroprotektivní a protizánětlivé účinky. Arbutin je využíván při léčbě onemocnění močových cest a v kosmetologii k zesvětlování pleti. Experimentální část práce zahrnuje metodiku přípravy trvalých mikroskopických preparátů z listů vybraných zástupců rodu Bergenia. Z trvalých i nativních preparátů byla zhotovena obrazová dokumentace. Byla popsána příčná stavba listu a stavba pokožky listu, včetně stomatálního indexu. Zdokumentována je také přítomnost krystalů šťavelanu vápenatého v...
|
|
|
Mikroskopická charakteristika květů z kulturních odrůd Sambucus nigra L.
Andělová, Veronika ; Spilková, Jiřina (vedoucí práce) ; Kašparová, Marie (oponent)
Bez černý (Sambucus nigra L.) patří k nejoblíbenějším rostlinám našeho lidového léčitelství, významné místo zaujímá také ve farmaceutickém a potravinářském průmyslu. V našich podmínkách je znám zejména v planě rostoucí podobě, avšak zvyšující se zájem a potřeba kvalitativně vyrovnané drogy, přispěly k pěstování kulturních odrůd bezu černého v sadech. Květ bezu černého (Sambuci nigrae flos) obsahuje především flavonoidy. Pro získání co nejkvalitnější drogy je nutné dodržovat pravidla sběru i sušení. Droga se zatím získává jen sběrem z rostlin ve volné přírodě. Cílem diplomové práce bylo zhodnocení jednotlivých charakteristických znaků květů bezu černého z kulturních odrůd a rozlišení od planě rostoucího bezu pomocí mikroskopické zkoušky totožnosti uvedené v Českém lékopise 2009. Zkoumány byly charakteristické znaky květů odrůd Albida, Alleső, Aurea, Bohatka, Dana, Haschberg, Juicy, Kőrsőr, Madona, Pregarten, Riese aus Vobloch, Tulbing a planě rostoucí bez černý. Jednotlivé vzorky květů byly projasněny v roztoku chloralhydrátu, z nich následně vytvořeny mikroskopické preparáty. Výsledky pozorování byly fotograficky dokumentovány. Mezi znaky, které byly pozorovány, patří: buňky obsahující písek šťavelanu vápenatého, stomata, buňky pokožky korunního lístku, mimo jiné byly sledovány pylová zrna,...
|
|
|
Laboratorní diagnostika dermatofytóz
Drnková, Nela ; Vejsová, Marcela (vedoucí práce) ; Křivčíková, Lucie (oponent)
Autor: Nela Drnková Název bakalářské práce: Laboratorní diagnostika dermatofytóz Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Studijní obor: Zdravotní laborant Má bakalářská práce je zaměřena na laboratorní diagnostiku dermatofytóz. Cílem této práce je vytvořit přehled metod, které se pro tuto diagnostiku využívají. Začátek je věnován obecným vlastnostem dermatofyt, jejich nomenklatuře, taxonomii a morfologii jednotlivých rodů. Velkou část práce tvoří přehled laboratorních metod. Jsou zde popsány jednotlivé typy mikroskopie, kultivační techniky, molekulární metody a metody imunologické. Konec práce se zabývá jednotlivými onemocněními, která jsou způsobena dermatofyty a jejich léčbou. Nejčastěji využívanými metodami pro laboratorní diagnostiku jsou světelná mikroskopie a kultivace. Klíčová slova: dermatofyty, Trichophyton, Microsporum, Epidermophyton, laboratorní diagnostika, tinea
|
|
|
Možnosti využití funkčních analýz kamenné štípané industrie v archeologii
Krásná, Soňa ; Popelka, Miroslav (vedoucí práce) ; Květina, Petr (oponent) ; Hroníková, Linda (oponent)
Předmětem zájmu disertační práce je problematika funkčních analýz a traseologie a jejich aplikace na archeologický materiál, zejména kamennou štípanou industrii ve středoevropském kontextu. V práci je nejprve představen dosavadní vývoj stavu bádání. Následuje popis metodologického využití analýz funkce ve spojení s poznatky z oblasti materiálových věd, zejména tribologie, zabývající se vzájemnou interakcí povrchů při jejich zatížení. Další částí je popis aplikace metody na vybraný archeologický materiál za použití různých zvětšení: tzv. analýzy nižšího rozlišení (LPA), analýzy vyššího rozlišení (HPA), rastrovací elektronové mikroskopie (SEM) a konfokální laserové mikroskopie (CLSM). Aplikace těchto metod na vybraný archeologický materiál je volen s ohledem k cílenému stanovení optimálního metodického postupu při analýzách archeologického materiálu a jejich vzájemné porovnání, který je součástí závěrů práce. Nedílnou součástí práce je i návrh speciální české terminologie pro oblast funkčních analýz zejména kamenné štípané industrie v archeologii.
|
|
|
Mikroskopické hodnocení drogy Sambuci fructus z kulturních odrůd Sambucus nigra.
Applová, Lenka ; Spilková, Jiřina (vedoucí práce) ; Kašparová, Marie (oponent)
Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakognosie Kandidát: Lenka Applová Školitel: doc. RNDr. Jiřina Spilková, CSc. Název diplomové práce : Mikroskopické hodnocení drogy Sambuci fructus z kulturních odrůd Sambucus nigra Bez černý (Sambucus nigra L.) je významnou rostlinou tradičního lidového léčitelství, jehož poznatky přejímá i farmaceutický a potravinářský průmysl. Plody se používají jako diaforetikum, diuretikum, při migrénách a neurologických obtížích. Se zvyšující poptávkou již nestačí pouze sběr planě rostoucích plodů, a proto je bez černý společně s jeho kulturními odrůdami pěstován v sadech. Kvalitní drogu pro farmaceutické použití by právě mohly poskytnout kulturní odrůdy bezu černého, které se pěstují pro využití plodů v potravinářském průmyslu. Cílem diplomové práce bylo studium mikroskopických znaků plodů planě rostoucího bezu černého a jeho deseti kulturních odrůd Allesö, Bohatka, Haschberg, Mamut, Sambo, Sambu, Samdal, Sampo, Samyl a Weihenstephan, které pocházejí z Výzkumného a šlechtitelského ústavu ovocnářského Holovousy s.r.o. Plody planě rostoucího bezu černého byly získány z Botanické zahrady léčivých rostlin Farmaceutické fakulty v Hradci Králové. Z plodů byly po projasnění v roztoku chloralhydrátu připraveny mikroskopické preparáty. V...
|
|
|
Zobrazování fluorescenčně značených mitochondrií metodou Biplane_FPALM
Dostál, Marek ; Plášek, Jaromír (vedoucí práce) ; Valenta, Jan (oponent)
Název práce: Zobrazování fluorescenčně značených mitochondrií metodou Biplane FPALM Autor: Bc. Marek Dostál Ústav: Fyzikální ústav UK Vedoucí práce: prof. RNDr. Jaromír Plášek, CSc. Konzultanti: RNDr. Petr Ježek, DrSc. Mgr. Hana Engstová, Ph.D. Abstrakt: V této práci jsme hledali a nalezli vhodné PCFP markery pro vizualizaci vnitřní a vnější membrány mitochondrií na unikátním prototypu biplane FPALM mikroskopu. Podíleli jsme se na odlaďování měřicího softwaru za účelem 3D vizualizace mitochondriálních sítí a určení jejich parametrů. K tomuto účelu jsme vyvinuli dvě metody. Jedna je použitelná při určování parametrů vnějších membrán a druhá při určování parametrů vnitřních membrán. Na menším statistickém souboru dat se nám podařilo potvrdit závislost kvality mitochondriální sítě na podmínkách kultivace buněk. Ve stresových podmínkách, jakými je např. hypoxie, se kvalita mitochondriální sítě mění oproti kultivaci za normálních podmínek. Klíčová slova: mitochondrie, Biplane FPALM, GFP, 3D vizualizace.
|
|
|
Experimentální studium ultrajemnozrnných slitin Ti pro využití v biomedicíně
Václavová, Kristína ; Stráský, Josef (vedoucí práce) ; Šíma, Vladimír (oponent)
V předložené práci je studován vývoj mikrostruktury slitiny Ti-6Al-7Nb připravené pomocí torze za vysokého tlaku (high pressure torsion - HPT) a protlačováním pravoúhlým kanálem (equal channel angular pressing- ECAP). Experimentální studium probíhalo pomocí skenovací elektronové mikroskopie, měřením mikrotvrdosti a elektrického odporu. Elektronová mikroskopie prokázala bimodální strukturu slitiny a dále silně deformovanou strukturu po HPT. Mikrotvrdost se zvyšuje se vzrůstajícím počtem otáček během deformace pomocí HPT. Pomocí difrakce zpětně odražených elektronů se prokázalo, že misorientace zrn není náhodná. Změny elektrického odporu v slitině připravené metodou ECAP během lineárního ohřevu a chlazení prokázaly ireverzibilní proces uvnitř vzorku.
|
host ::
RSS.