|
|
Detailní analýza genů rezistence na antibiotika a těžké kovy a znaků horizontálního přesosu genů u zástupců anaerobních bakterií
Vancová, Kateřina ; Schwarzerová, Jana (oponent) ; Čejková, Darina (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá detailní analýzou genů rezistence na antibiotika a těžké kovy a znaků horizontálního přesosu genů u zástupců anaerobních bakterií. Antimikrobiální rezistence (AMR) u bakterií je celosvětově rostoucí hrozbou pro veřejné zdraví. U těchto bakterií jsou geny AMR často spojeny s mobilními genetickými elementy (MGE), které pod- porují jejich mobilitu a umožňují jim rychlé šíření mezi různými bakteriemi. V práci je popsán horizontální přenos genetické informace, problematika antimikrobiální rezistence a databáze pro detekci genů AMR a MGE. Poté byla provedena detekce a analýza genů AMR a MGE u zástupců anaerobních bakterií. Téměr polovina z nich obsahovala alespoň 1 gen AMR, celkem 112 různých genů. Poté bylo detekováno 66 různých MGE, 4 z nich přenášely 6 různých detekovaných genů AMR.
|
|
|
Detailní analýza genů rezistence na antibiotika a těžké kovy a znaků horizontálního přesosu genů u zástupců anaerobních bakterií
Vancová, Kateřina ; Schwarzerová, Jana (oponent) ; Čejková, Darina (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá detailní analýzou genů rezistence na antibiotika a těžké kovy a znaků horizontálního přesosu genů u zástupců anaerobních bakterií. Antimikrobiální rezistence (AMR) u bakterií je celosvětově rostoucí hrozbou pro veřejné zdraví. U těchto bakterií jsou geny AMR často spojeny s mobilními genetickými elementy (MGE), které pod- porují jejich mobilitu a umožňují jim rychlé šíření mezi různými bakteriemi. V práci je popsán horizontální přenos genetické informace, problematika antimikrobiální rezistence a databáze pro detekci genů AMR a MGE. Poté byla provedena detekce a analýza genů AMR a MGE u zástupců anaerobních bakterií. Téměr polovina z nich obsahovala alespoň 1 gen AMR, celkem 112 různých genů. Poté bylo detekováno 66 různých MGE, 4 z nich přenášely 6 různých detekovaných genů AMR.
|
|
|
Analysis of antibiotic administration in open appendectomies in pediatric patients.
Šugrová, Kristína ; Rejmanová, Anna (vedoucí práce) ; Šorf, Aleš (oponent)
Analýza podávania antibiotík pri otvorených apendektómiách v populácii detských pacientov Autor: Kristína Šugrová Vedúci diplomovej práce: PharmDr. Anna Rejmanová, Ph.D. Konzultant: PharmDr. Petra Rozsívalová Katedra sociální a klinické farmacie, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Univerzita Karlova Úvod a cieľ: Apendicitída predstavuje najčastejšiu indikáciu k chirurgickému brušnému výkonu v populácii detských pacientov. V prípade komplikácií, ktoré zahŕňajú absces, periapendikulárny infiltrát alebo perforáciu s peritonitídou môže ísť až o život ohrozujúce ochorenie. Cieľom práce bolo zanalyzovať podávanie antibiotík (ATB) ako v profylaxii akútnej apendicitídy, tak aj v liečbe komplikovaných apendicitíd pri otvorených apendektómiách v populácii detských pacientov. Ďalším cieľom bolo porovnať podávanie ATB pred a po zavedení doporučeného postupu nemocnice (DPNM). Následne sledovať výskyt komplikácií a dĺžku hospitalizácie a ich súvislosť s podávaním ATB a ďalšími rizikovými faktormi. Metodika: Bola vykonaná unicentrická retrospektívna prierezová štúdia. Sledovaní boli pacienti ≤ 18 rokov, ktorí v rokoch 2014 - 2020 podstúpili otvorenú apendektómiu na Klinike detskej chirurgie a traumatologie vo fakultnej nemocnici v Hradci Králové. Sledované údaje o pacientoch, podávaných ATB a chirurgickom...
|
|
|
Analysis of antibiotic administration in laparoscopic appendectomies in pediatric patients.
Opatovská, Tamara ; Rejmanová, Anna (vedoucí práce) ; Malá, Kateřina (oponent)
Analýza podávania antibiotík pri laparoskopických apendektómiách v populácii detských pacientov Autor: Tamara Opatovská Vedúci diplomovej práce: PharmDr. Anna Rejmanová, Ph.D. Konzultant: PharmDr. Petr Domecký Katedra sociální a klinické farmacie, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Univerzita Karlova Úvod a ciele: Apendicitída patrí medzi najčastejšie akútne diagnózy v pediatrickej populácii. Nesprávna diagnóza, zle vykonávaná antibiotická profylaxia (AP) alebo liečba môžu viesť k život ohrozujúcim komplikáciám ako perforácia, peritonitída, periapendikulárny infiltrát alebo absces. Cieľom tejto štúdie bolo zanalyzovať podávanie antibiotík (ATB) v rámci profylaxie pred apendektómiou ako aj v rámci terapie komplikovaných apendicitíd v detskej populácii a získané výsledky medzi sebou porovnať. Konkrétne boli porovnávané 2 obdobia - pred a po zavedení doporučeného postupu nemocnice (DPN; 22. 06. 2017). Čiastkovým cieľom štúdie bolo identifikovať faktory, ktoré u sledovanej populácie ovplyvnili výskyt komplikácií a dĺžku hospitalizácie. Metodika: Unicentrická retrospektívna prierezová štúdia prebiehala na Klinike detskej chirurgie a traumatológie vo Fakultnej nemocnici Hradec Králové. Údaje boli zbierané od roku 2014 do roku 2020. V štúdii boli zahrnutí pacienti mladší 18 rokov, ktorí podstúpili...
|
|
|
Analýza spotřeby antibiotik pro systémové podání v České republice v letech 2005-2019
Suchopárová, Lenka ; Malý, Josef (vedoucí práce) ; Kolář, Jozef (oponent)
Analýza spotřeby antibiotik pro systémové podání v České republice v letech 2005-2019 Autor: Lenka Suchopárová Vedoucí diplomové práce: doc. PharmDr. Josef Malý, Ph.D. Konzultant: Mgr. Petr Domecký Katedra sociální a klinické farmacie, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Univerzita Karlova Úvod a cíl: Antibiotika (ATB) jsou látky, které působí bakteriostaticky nebo baktericidně. Léčba pomocí ATB s sebou nese i rizika v podobě nežádoucích účinků, lékových interakcí a vzniku rezistence. Důvodem sledování spotřeby ATB není pouze zjevná koherence mezi jejich spotřebou a nárustem rezistence, ale i ekonomická stránka léčby bakteriálních infekcí. Cílem této práce bylo analyzovat spotřebu ATB pro systémové použití v České republice (ČR) v letech 2005-2019. Metodika: Analýza spotřeby ATB probíhala jako retrospektivní analýza dat o spotřebě ATB z databáze Státního ústavu pro kontrolu léčiv v období od 1. 1. 2005 do 31. 12. 2019. Pro analýzu byla využita anatomicko-terapeuticko-chemická klasifikace vztažená na definované denní dávky (DDD) jednotlivých léčiv. Spotřeba ATB se vypočítala jako DDD na tisíc obyvatel za den (TID). Data o počtu obyvatel byla získána z Českého statistického úřadu. Analyzována byla celková spotřeba ATB v jednotlivých letech a celkové náklady na ATB ve finančních jednotkách v...
|
|
|
Vyhodnocení používání antibiotik ve vybraných chovech celkem a ve vztahu k jednotlivým druhům a kategoriím zvířat
SVÁČKOVÁ, Marie
Diplomová práce se zabývá tématem souvislostí mezi zdravím hospodářských zvířat a nutností použití antimikrobních látek v chovech. Cílem práce bylo získat základní údaje a formulovat poznatky o používání antibio-tik ve vybraných chovech celkem a ve vztahu k jednotlivým kategoriím zvířat. V teoretické části jsou vysvětleny základní pojmy jako welfare zvířat, biosekurita v chovu, definovány jsou antimikrobiální látky, původce onemocnění a rezistence patogenů na léčbu. V praktické části jsou zpracované výsledky zaměřené na používání antibiotik k léčbě vybraných kategorií zvířat a vyhodnocení četnosti jejich aplikace v konkrét-ních chovech. Dále vyhodnocuji nejčastěji léčené kategorie jednotlivých druhů zví-řat a důvody použití antimikrobních přípravků k léčbě. Výsledky ukazují, že ve vybraných chovech skotu jsou z antibiotik nejvíce používá-ny cefalosporiny a sulfonamidy, peniciliny, tetracykliny; z ostatních antimikrobiál-ních látek antiparazitika. Také byl ve vybraných chovech skotu detekován výskyt multirezistentních bakterií, konkrétně u respiračních a průjmových onemocnění.
|
|
|
Faktory ovlivňující informovanost veřejnosti o antibiotikách
TUNKOVÁ, Barbora
Odpovídající znalosti užívání antibiotik jsou jedním z hlavních předpokladů pro zabránění šíření antibiotické rezistence, která se stala hrozbou veřejného zdraví dnešního světa. Cílem práce bylo prostřednictvím dotazníkového šetření (n=799) posoudit vliv pohlaví, vzdělání a oboru (potravinářství, zemědělství či zdravotnictví) na informovanost o antibiotikách a antibiotické rezistenci a dále porovnat spotřebu antibiotik (definovaná denní dávka na 1000 obyvatel a rok, DDD) v 16 státech Evropy za sledované období. Bylo zjištěno, že ženy mají větší znalosti o účincích antibiotik než muži (p <0,0010). Byl prokázán statisticky významný vliv úrovně vzdělání a příslušného oboru na vědomosti týkající se antibiotické rezistence (p <0,0010). Nejvyšší průměrná spotřeba antibiotik (21,97 DDD) byla zjištěna v jižní Evropě, naopak nejnižší spotřebu antibiotik měly severské země (15,62 DDD).
|
|
|
Baktericidy v životním prostředí: Výskyt vybraných baktericidů v odpadních vodách a jejich vliv na vodní životní prostředí
DUŠÁNKOVÁ, Monika
Baktericidy jsou skupinou chemicky aktivních látek, které vykazují antimikrobiální účinky. Jejich schopnost zabíjet či inhibovat růst nežádoucích mikroorganismů je hojně využíváno v průmyslových odvětvích, zdravotnictví, ale i v domácnostech. Široké používání baktericidů má však za následek bohatý výskyt těchto látek v povrchových a odpadových vodách, čímž je poté podpořen rozvoj antibiotické rezistence. Konkrétně čistírny odpadních vod (ČOV) mají významný vliv na vstup genů antibiotické rezistence do životního prostředí. Cílem této práce bylo pomocí vysokoúčinné kapalinové chromatografie s tandemovou hmotnostní spektrometrií stanovit výskyt baktericidů ve vzorcích odpadních a povrchových vod, sedimentů a čistírenských kalů. Zjištěné koncentrace byly použity k hodnocení účinnosti odstraňování a vlivu na recipient. Pozitivní účinnost odstranění byla potvrzena především u skupiny kvartérních amoniových sloučenin, a některých antibiotik. Nejvyšší účinnost odstranění dosáhl klarithromycin. I když některé sledované látky měly vysokou účinnost odstranění na ČOV, přesto jejich konečný výskyt prokázal ovlivnění vodního životního prostředí. Kvartérní amoniové sloučeniny byly účinně odstraněny z odpadní vody. Ale především díky jejich vlastnostem jako je silná sorpce na pevné látky, tedy i sedimenty a kaly, se koncentrovaly v čistírenském kalu. Toto může vést k problémům při využívání čistírenských kalů na zemědělské plochy. Některé sledované látky mohou být zadrženy v půdách, ale zbytek může být transportován do povrchových a podzemních vod. V této práci byl stručně zmapován osud vybraných baktericidů na čistírně odpadních vod a v přilehlém recipientu a bylo poukázáno na možná rizika používání baktericidů a jejich vstupu do životního prostředí. Vzhledem k různorodosti a množství baktericidů a závažnosti důsledků plynoucích z jejich nadměrného používání, si toto téma zasluhuje širší pozornost.
|
|
|
Detekce antimikrobiální rezistence u původců sexuálně přenosných infekcí
KREJČÍKOVÁ, Pavlína
Sexuálně přenosné infekce (STD) představují riziko pro veřejné zdraví, a to zejména z hlediska nárůstu antibiotické rezistence. V předkládané práci jsou shrnuty poznatky o nejčastějších původcích těchto infekcí, laboratorní diagnostice a současné epidemiologii, antimikrobiální rezistenci a jejích molekulárních mechanismech. Stanovení antimikrobiální citlivosti u většiny původců STD není v rutinní mikrobiologii možné z hlediska vysokých nebo specializovaných kultivačních nároků. Také, v současné době, z důvodu vyšší citlivosti detekce, jsou k diagnostice STD využívány metody molekulární biologie, které upozaďují provádění kultivace u Neisserie gonorrhoeae. Experimentální část projektu si kladla za cíl detekci popsaných mechanismů rezistence v pozitivních vzorcích na přítomnost původců STD vyšetřených pomocí mutiplexové PCR. V prvním kroku bylo použito celogenomové sekvenování (WGS). Bohužel, získané sekvence obsahovaly velké množství humánních sekvencí a extrahumánní sekvence tak neposkytovaly dostatečné pokrytí pro detekci jednotlivých genů a mutací. Nedostatečné pokrytí bylo zjištěno i po odstranění části humánní DNA ze vzorku pomocí saponinu a tritonu-X. Vzhledem k nevhodnosti WGS jsme optimalizovali a zavedli dříve popsané metody cílově specifické molekulární detekce nejčastějších mechanismů rezistence u N. gonorrhoeae. První metodou je PCR amplifikace s analýzou křivek tání (HRM). Jako referenční metodu k HRM jsme použili Sangerovo sekvenování šesti genů (penA, mtrR, ponA, porB, 23S rRNA, gyrA). V průběhu řešení práce byly optimalizovány teplotní profily pro PCR amplifikaci jednotlivých genů. Pro úplné pokrytí sekvenovaného úseku DNA (genu) dále bylo nutné navrhnout doplňující sekvenační primery. Pro klinické použití HRM pro detekci mechanismů rezistence u N. gonorrhoeae je nutné metodu ověřit na vzorcích DNA s identifikovanými mechanismy rezistence pomocí sekvenování jednotlivých fragmentů, které bylo v předložené práci optimalizováno.
|
|
|
Efekt iontů těžkých kovů na biologické vlastnosti, rezistenci a virulenci
Hegerová, Dagmar
Bakteriální infekce s komplikovaným průběhem, a tudíž zdlouhavou, mnohdy i neřešitelnou léčbou způsobenou vznikající rezistencí vůči antibiotickým léčivům, jsou v současnosti stále častějším problémem řady medicínských oborů. Předkládaná práce s názvem "Efekt iontů těžkých kovů na biologické vlastnosti, rezistenci a virulenci" byla primárně zaměřena na studium vlivu vybraných iontů kovů (Ag+, Cd2+, Cu2+, Pb2+ a Zn2+) na biochemické vlastnosti bakteriálních kmenů, zejména na pozorování jejich vlivu na tvorbu volných kyslíkových radikálů, vznik oxidačního stresu a růstové vlastnosti. Průkaz vlivu kovů na biochemické parametry, ale především jejich významný antimikrobiální efekt, nasměroval naše další studie na testování antimikrobiální aktivity kovů (nejčastěji stříbra), popřípadě kovů ve formě nanočástic syntetizovaných do komplexů s polymerními látkami (chitosanem a kyselinou hyaluronovou). Dosažené výsledky jednoznačně prokazovaly formu nanočástic jako nejvhodnější, proto byly následně porovnávány účinky prokazatelně antimikrobiálních nanočástic stříbra s nanočásticemi polokovu selenu, se kterým jsme dosáhli ještě slibnějších výsledků v oblasti antimikrobiální aktivity. V neposlední řadě byl testován vliv dlouhodobého působení iontů kovů na vznikající rezistenci nebo tzv. multirezistenci v případě zkřížené rezistence kovů a antibiotických léčiv.
|
host ::
RSS.