|
|
Predikce vlivu mutace na rozpustnost proteinů
Velecký, Jan ; Martínek, Tomáš (oponent) ; Hon, Jiří (vedoucí práce)
Cílem práce je vytvoření prediktoru změny rozpustnosti mutovaného proteinu ze znalosti jeho původní 3D struktury. Predikce rozpustnosti proteinů je část bioinformatiky, která dosud není uspokojivě vyřešena. Přičemž především predikci ze 3D struktury není věnována náležitá pozornost. Práce obsahuje souhrn relevantních znalostí o proteinech, jejich rozpustnosti a stávajících predikčních nástrojích. Princip navrženého prediktoru je inspirován článkem Surface Patches, a práce si tak dává za cíl také ověřit výsledky v něm dosažené. Navržená predikce funguje podle změn oblastí kladného elektrického potenciálu nad povrchem proteinu. Nástroj byl úspěšně implementován a byla provedena celá řada výpočetně náročných experimentů. Z nich vyplynulo, že tímto způsobem lze elektrický potenciál, a tedy i prediktor, použít úspěšně jen u omezené množiny proteinů. Metoda použitá v článku navíc koreluje s mnohem jednodušší proměnou celkového náboje proteinu.
|
|
|
Odstraňování mikropolutantů při úpravě pitné vody
Hambálková, Kateřina ; Vávrová, Milada (oponent) ; Dolejš, Petr (vedoucí práce)
Průnik léčiv do povrchových a pitných vod je celosvětově nově řešeným problémem. Tato diplomová práce se zabývá odstraněním léčiv z vody pomocí koagulace, při níž jsou porovnávána koagulační činidla chitosan a síran železitý. Pro srovnání byla použita i adsorpce na práškové aktivní uhlí. Účinnost odstranění byla zjišťována pomocí UV-VIS spektrofotometru a HPLC.
|
|
|
Hluboké neuronové sítě pro rozpoznání tváří ve videu
Jeřábek, Vladimír ; Sochor, Jakub (oponent) ; Hradiš, Michal (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá rozpoznáváním tváří ve videu pomocí neuronových sítí. Na začátku je popsán výběr a ověření konvolučních neuronových sítí pro generování příznakových vektorů z obrázků různých identit. V další části se tato práce věnuje agregování příznakových vektorů ze snímků videa. Agregování probíhá pomocí agregačních neuronových sítí. Na konci této práce jsou diskutovány výsledky, kterých dané agregační metody dosáhli.
|
|
|
Hluboké neuronové sítě pro rozpoznání tváří ve videu
Stratil, Jan ; Sochor, Jakub (oponent) ; Hradiš, Michal (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá rozpoznáváním tváří ve videu pomocí hlubokých neuronových sítí. Tato úloha je rozdělena na 2 části. První část se zabývá trénováním sítě, která vytváří kompaktní příznakový vektor reprezentující identitu tváře ze snímku videa. Druhá část se zabývá trénováním agregační sítě, která vytvořené příznakové vektory agreguje v jeden. Tato agregace je rychlá a ukázala se být lepší než pooling metody. Výsledky jsou testovány na datasetu LFW , kde dosažená přesnost je 92.8% a na datasetu YTF , kde přesnost je 84.06%.
|
|
|
Production and characterization of regenerated humic acids
Uhrová, Anna ; Daniela,, Šmejkalová (oponent) ; Kučerík, Jiří (vedoucí práce)
A fraction of South Moravian lignite mined in Mír Mikulčice, Lignit Ltd. was modified by two oxidizers (HNO3, H2O2) and two “amphiphilic-like” agents (acetic and citric acids, respectively). Alkali extraction was used to obtain both humic acids from non-treated lignite and so-called regenerated humic acids. Several methods were used for characterization of obtained samples. Based on the results of elemental analysis, the C/O and C/H ratios were calculated and completed by FTIR measurement; that provided the information on aromaticity/aliphaticity of the samples and degree of carbon oxidation. To assess the distribution of molecular dimensions of humic aggregates the High Performance Size Exclusion Chromatography was used. To elucidate the mechanisms of processes occurring in the surface layer of water solutions the surface tension measurement was carried out. Obtained data were fitted with Szyszkowski equation to get parameters characterizing the surfactant efficiency of humic acids and indicating the nature of humic molecules responsible for their surface activity. Finally, the Pearson correlation was used to search the interrelationships among results obtained by the above-mentioned techniques.
|
|
|
Hluboké neuronové sítě pro rozpoznání tváří ve videu
Mihalčin, Tomáš ; Sochor, Jakub (oponent) ; Hradiš, Michal (vedoucí práce)
Táto diplomová práca sa zameriava na rozpoznanie tvári z videa, konkrétne na spôsob agregácie príznakových vektorov, do jedného diskriminatívneho vektora, tiež nazývaného šablóna. Skúma problém extrémne natočených tvárí, vzhľadom na presnosť verifikácie. Ďalej, porovnáva vzťah medzi šablónami tvorenými vektormi extrahovanými zo snímkov z videa a vektormi z fotografií. Navrhnutá hypotéza je testovaná pomocou dvoch hlbokých konvolučných neurónových sietí a to so známym modelom VGG-16 siete a modelom siete nazývanej Fingera, poskytnutej od firmy Innovatrics. V rámci práce, bolo vykonaných niekoľko experimentov, ktorých výsledky potvrdzujú úspešnosť navrhnutého postupu. Ako metrika presnosti bola zvolená ROC krivka. K práci s neurónovými sieťami bol použitý framework Caffe.
|
|
|
Upravitelnost povrchových vod
Fuks, Josef ; Palčík,, Jiří (oponent) ; Kučera, Tomáš (vedoucí práce)
V diplomové práci se zabývám tématem upravitelnosti povrchových vod se zaměřením na proces tvorby suspenze. K práci byly použity vzorky vody odebrané z pěti různých míst v okolí Brněnské přehrady, která se dlouhodobě potýká se zhoršenou kvalitou vody, a s těmito vzorky byla následně provedena série sklenicových optimalizačních pokusů s užitím třech různých běžně používaných koagulantů. V teoretické části práce se zabývám složením a vlastnostmi povrchových vod a technologií jejich úpravy. Jsou zde stručně popsány jednotlivé procesy úpravy, přičemž je kladen důraz na proces tvorby suspenze. Experimentální část shrnuje a představuje získané výsledky při laboratorních koagulačních testech. Vyhodnocuji vliv různých parametrů na výslednou účinnost úpravy vody a pokouším se nalézt optimální dávku koagulantu, pH a rychlost rychlého a pomalého míchání. Na závěr srovnávám vhodnost jednotlivých koagulantů a vliv místa odběru na účinnost úpravy.
|
|
|
Moderní technologie v OLAP
Janoška, Daniel ; Kužela, Alois (oponent) ; Hruška, Tomáš (vedoucí práce)
Nástroje OLAP sa v stále väčšej miere uplatňujú v podnikoch a inštitúciach po celom svete. Sú špeciálne zamierené na podporu potrieb riadiacich pracovníkov. Hlavnou témou seminárnej práce je OLAP analýza s jej možnosťami. Seminárna práca sa tiež zaoberá technológiami FLEX a AIR. V seminárnej práci sú prebrané základné princípy fungovania týchto technológií.
|
|
|
Agregační reakce chitosanu využitelné při úpravě pitné vody.
Leskovjanová, Jana ; Mega, Jaroslav (oponent) ; Dolejš, Petr (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá úpravou povrchových vod s obsahem huminových látek. Nejpoužívanější metodou úpravy povrchové vody je koagulace s následnou separací vzniklých agregátů. V tomto případě byla při koagulaci sledována pouze perikinetická fáze koagulace, kdy tvorba agregátů probíhá výhradně vlivem Brownova pohybu, tj. bez vlivu míchání. Separace vzniklých agregátů byla prováděna centrifugací. Série koagulačních pokusů byly prováděny za laboratorních podmínek s uměle připravenou modelovou vodou, jejímž základem byl koncentrát huminové vody z přírodního rašeliniště. Za těchto podmínek byl sledován především vliv teploty na průběh koagulace, v rozsahu teplot 5 až 22 °C. Jako koagulační činidlo byl použit biopolymer chitosan, který u nás v praxi v současné době stále ještě není využíván. U tohoto koagulantu nebyl pozorován nijak výrazný vliv teploty. Pro ověření, zda je možné vliv teploty sledovat centrifugačním koagulačním testem, byla série pokusů zopakována s použitím síranu hlinitého a železitého, což jsou v praxi běžně používaná koagulační činidla. Vliv teploty u nich byl zkoumán již dříve na poloprovozním modulu. Účinnost koagulace byla hodnocena na základě zbytkových absorbancí (při 254 a 387 nm) a pro optimální dávku byla navíc stanovena hodnota CHSK manganistanovou metodou. V případě hlinitého a železitého koagulantu byla účinnost koagulace dále posuzována i na základě koncentrací zbytkového koagulantu. U každého z použitých koagulantů byla nejprve provedena série pokusů při laboratorní teplotě, jejichž cílem bylo nalezení nejvhodnější doby agregace pro určení optimální dávky koagulantu. Účinnost koagulace byla vyhodnocena pro dobu agregace 10, 40 a 120 minut. Na základě naměřených hodnot byla pro měření za snížené teploty vybrána jako optimální doba agregace 40 minut. Na závěr bylo provedeno srovnání použitých koagulantů při jednotlivých teplotách.
|
|
|
Příprava a charakterizace komplexů železa s aminokyselinami
Bednárová, Paula ; Hurčíková, Andrea (oponent) ; Kalina, Michal (vedoucí práce)
Táto bakalárska práca sa zameriava na prípravu a charakterizáciu komplexov železa s aminokyselinami. Práca je v teoretickej časti sústredená na rozobratie železa ako esenciálneho prvku v organizmoch, na jeho schopnosť tvoriť komplexy a na rozmanité biologické vlastnosti týchto komplexov, ktoré môžu byť prirodzené až vedúce k rôznym poruchám ich metabolizmu. Preštudovaná literatúra v práci sa orientuje na prípravu komplexov Fe(III) s aminokyselinami. V experimentálnej časti práce sa venujeme titračným stanovenia zeta potenciálu a kritickej agregačnej koncentrácii, ktorá bola stanovená len pri aminokyselinách L-lyzín a kyseline asparágovej. Taktiež sa venujeme zrážacím reakciám, ktoré mali malú výťažnosť vo väčšine zvolených aminokyselinách okrem cysteínu, ktorého množstvo bolo po úprave podmienok dokonca dvojnásobné. Konštatovali sme, že výsledný výťažok závisí hlavne od druhu použitej aminokyseliny, tak isto aj od použitého rozpúšťadla a aj jeho množstva využitého v syntéze.
|
host ::
RSS.