|
|
Mammalian proteins carrying zinc finger arrays
Vobruba, Adam ; Svoboda, Petr (vedoucí práce) ; Mašek, Jan (oponent)
Zinkový prst je malý peptidový motiv stabilizovaný jedním zinečnatým iontem, známý zejména pro svou schopnost specificky vázat třínukleotidovou sekvenci DNA v závislosti na konkrétních aminokyselinách přítomných v DNA-vazebných pozicích. Zinkové prsty jsou unikátní svou schopností spojovat se do delších tandemově uspořádaných sad, které mohou vázat DNA cíle o libovolné délce a sekvenci, určené kombinací jednotlivých prstů. Tyto sady mohou jednoduše měnit vazebnou specificitu díky mutacím a přestavbám, což jim dodává velkou flexibilitu a pomohlo zinkovým prstům rozšířit se do mnoha endogenních proteinů o rozličných funkcích. Tato vlastnost sad zinkových prstů je také činí vhodnými pro tvorbu DNA-vazebných domén na míru pro využití v genovém inženýrství. Tato práce podává přehled o objevu těchto domén, jejich struktuře a funkci a poté shrnuje a diskutuje vybrané přirozeně se vyskytující savčí proteiny se zinkovými prsty a jejich vlastnosti, představujíc různé funkce pro něž byly sady zinkových prstů v průběhu evoluce adaptovány. Diskutována je také minulost a budoucnost zinkových prstů v umělých proteinech vytvořených pro genovou terapii a výzkum. Klíčová slova: zinkový prst, ZnF, KRAB, KZFP, CTCF, PRDM9, ZFN, savci
|
|
|
Role β-podjednotky komplexu asociovaného s nascentním polypeptidem (NAC) při odpovědi huseníčku rolního na různé abiotické stresy
Šesták, Petr ; Fíla, Jan (vedoucí práce) ; Vosolsobě, Stanislav (oponent)
Komplex asociovaný s nascentním polypeptidem (NAC) je heterodimerní komplex složený z α- a β-podjednotky. Je konzervovaný napříč eukaryotními organismy a byl nalezen i u archeí. Tento komplex se váže na nově syntetizované proteiny vystupující z ribozomu a podílí se na jejich cílení do endoplasmatického retikula. U rostlin je komplex NAC studován v souvislosti s odolností vůči různým abiotickým stresům. V naší laboratoři jsme dříve charakterizovali T-DNA inserčního mutanta huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana) v obou genech kódujících NACβ, který vykazoval řadu fenotypových defektů. Mezi nimi se objevil například větší počet květních orgánů, zhoršená klíčivost pylových zrn a tvorba kratších šešulí s menším počtem obsažených semen. Cílem této diplomové práce bylo charakterizovat roli β-podjednotky komplexu NAC u huseníčku rolního při klíčení semen za osmotického a solného stresu. Prokázali jsme, že absence NACβ vede ke snížení klíčivosti semen a k prodloužení doby klíčení, stejně jako nadexprese této podjednotky. Dále jsme studovali, zda stresové podmínky ovlivňují hladinu transkriptu jednotlivých genů pro obě podjednotky NAC za využití metody RT-qPCR. Abychom zjistili, jakými molekulárními mechanismy by mohl studovaný komplex ovlivňovat odpověď rostliny na stresové podmínky, rozhodli jsme se...
|
|
|
Hmyz jako modelová skupina pro výzkum znalostí o bezobratlých a postojů k bezobratlým
Jelínek, Filip ; Mourek, Jan (vedoucí práce) ; Janšta, Petr (oponent)
Tato práce je literární rešerší, ve které si kladu za cíl zpracovat dostupnou literaturu o postojích ke hmyzu, znalostech o hmyzu a o způsobech jakými lze ovlivnit vnímání hmyzu člověkem. V kapitolách zaměřených na postoje ke hmyzu ukazuji, jak emoce odpor a strach vedou k negativním názorům na hmyz a naopak, jak nám vnímání jeho krásy a důležitosti podporuje pozitivní názory na hmyz. V současné době se hodně pozornosti věnuje také postojům veřejnosti ke konzumaci hmyzu, který může být vhodným doplňkem výživy člověka i hospodářských zvířat. V části zaměřené na znalosti ukazuji, jak děti i dospělí zaměňují pravdivé informace o hmyzu s mýty. Často nepřesně rozlišují, co je hmyz a co není, které druhy hmyzu jsou nebezpečné, a které ne. V závěrečných kapitolách představuji literaturu, která se zabývá, jakými způsoby lze ovlivnit postoje ke hmyzu a znalosti o hmyzu. Věnuji se v nich vlivu urbanizace, zážitkových vzdělávacích programů a obrazem hmyzu v kultuře člověka, především v jazyce, poezii, beletrii a výtvarném umění.
|
|
|
Design, synthesis and evaluation of heterocyclic compounds with potential antimicrobial activity V
Askari, Asal ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent)
(CZECH) Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Řešitel: Asal Askari Vedoucí diplomové práce: doc. PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Konzultant: Ghada Bouz, Ph.D. Název diplomové práce: Návrh, syntéza a hodnocení heterocyklických sloučenin s potenciální antimikrobní aktivitou V Staphylococcus aureus (SA) je jednou z nejčastějších příčin život ohrožujících infekcí. Jedním ze způsobů, jak kontrolovat infekčnost SA, je vývoj inovativních látek, nejlépe s novým mechanismem účinku, které jsou účinné jak proti kmenům citlivým na léky, tak proti kmenům lékově rezistentním. Chinazolon slouží jako základní kostra pro mnoho různých biologicky aktivních sloučenin. Antistafylokokové chinazolony (AQs) mají v literatuře popsané vztahy mezi strukturou a aktivitou. Penicilin vázající protein (PBP), DNA topoizomeráza a laktátdehydrogenáza jsou některé z molekulárních cílů pro AQs. S využitím in silico molekulového dokování jsme spojili naše rozsáhlé znalosti antibakteriálních léčiv s tím, co bylo popsáno v literatuře, abychom vytvořili nové, potenciálně aktivní AQs zaměřené na PBP. Výsledkem bylo, že jsme připravili 11 finálních sloučenin s lipofilitou v rozmezí 2,69 až 4,06 reakcí laktonového meziproduktu, benzoxazinonu, s různými benzylaminy....
|
|
|
Úloha HPA osy v rozvoji afektivních poruch
Fiedlerová, Alžběta ; Telenský, Petr (vedoucí práce) ; Svoboda, Jan (oponent)
Tato bakalářská práce se zaměřuje na vliv hypotalamo-hypofýzo-nadledvinové osy (HPA osy) na rozvoj afektivních onemocnění. Afektivní onemocnění, jako je velká depresivní porucha nebo posttraumatický stresový syndrom, jsou vážnými psychickými onemocněními, která mají závažný dopad na život jedince trpícího touto poruchou. HPA osa hraje klíčovou roli v adaptaci organismu na stresové situace. Dysfunkce HPA osy může významně ovlivnit homeostázu organismu díky zvýšeným či sníženým hladinám hormonů a neurotransmiterů či deregulacím stresového systému. To může vést k rozvoji afektivních poruch. Tato práce se zaměřuje na analýzu souvislostí mezi aktivitou HPA osy a vznikem afektivních poruch a zkoumá možnosti terapeutické léčby této osy jako potenciálního cíle léčby těchto poruch. Výsledky této rešerše jednotlivých vědeckých článků podporují porozumění mechanismům, které spojují HPA osu s afektivními poruchami a nabízejí perspektivu pro budoucí výzkum. Klíčová slova: HPAosa, kortizol, velká depresivní porucha, úzkostná porucha, posttraumatický stresový syndrom, bipolární porucha
|
|
|
Behaviorální fenotyp alzheimerovského modelu APPswe/PSEN1dE9 myší a úloha parvalbuminových interneuronů
Klausová, Tereza ; Svoboda, Jan (vedoucí práce) ; Telenský, Petr (oponent)
Alzheimerova choroba představuje sociální a ekonomickou zátěž pro celou společnost. Její etiologie stále zůstává neznámá, známe však některé mechanismy patogeneze, které nám umožňují vytvářet zvířecí modely (zejména myší). V této práci zkoumáme behaviorální fenotyp často používaného modelu APPswe/PSEN1. Zjistili jsme, že ani šestiměsíční, ani desetiměsíční zvířata nevykazují v testech anxiety (otevřené pole a vyvýšené křížové bludiště) ani v testech sociálního chování (sociální interakce a tříkomorový test) zhoršení oproti kontrolní skupině. Test prepulzní inhibice však odhalil, že PPI u alzheimerovských myší zcela mizí, což ukazuje na významnou aberaci v senzomotorickém gatingu. Druhá část práce je zaměřena na chemogenetickou studii úlohy parvalbuminových interneuronů v Alzheimerově chorobě a vlivu jejich excitace na sociabilitu, sociální paměť a senzomotorický gating. Využíváme zde výše zmíněný model křížený s PV-Cre myšmi, což nám umožnilo zavedení Cre dependentních DREADDs. U této skupiny zvířat jsme zkoumali sociální chování a přítomnost narušení v senzomotorickém gatingu. Získané výsledky však nepřinesly žádný důkaz vlivu excitace parvalbuminových interneuronů na chování zvířat a bude potřeba provést více experimentů s větším počtem zvířat. Klíčová slova: Alzheimerova choroba, chování,...
|
|
|
The question of Mycenaean lexical relics in Ancient Greek
Vlach, Petr ; Lipp, Reiner (vedoucí práce) ; Bakyta, Ján (oponent)
Tato práce se zabývá otázkou možných mykénských lexikálních reliktů v pozdější řečtině. Některá slova v klasické řečtině vykazují neobvyklý fonologický vývoj pro svůj vlastní dialekt. Nabízí se tedy otázka, zdali se nejedná o mezidialektální výpůjčky. Většina těchto slov, která je doložena už u Homéra, se liší od podob, které bychom očekávali pro ‚homerische Kunstsprache', jazyk Homérových epických básní, jenž se skládá hlavně z iónských a aiolských dialektálních prvků. V některých případech tato slova ukazují vývoj charakteristický pro tzv. silné dialekty, jako jsou např. dórské dialekty. Dórské dialekty se však nepodílely na vzniku homérského jazyka, tyto formy je tedy třeba vysvětlit jiným způsobem. Jedním možným řešením tohoto problému je interpretovat tato slova jako na relikty z mykénského dialektu. Nicméně přesný stav fonologického systému mykénštiny není stále ještě zcela pochopen kvůli nedostatkům lineárního písma B, toto vysvětlení je tedy třeba brát s jistou opatrností.
|
|
|
Závazkové poměry s mezinárodním prvkem se zaměřením na postoupení pohledávky
Zbíral, Filip ; Bříza, Petr (vedoucí práce) ; Brodec, Jan (oponent)
Závazkové poměry s mezinárodním prvkem se zaměřením na postoupení pohledávky Abstrakt Předkládaná diplomová práce se ve své první části zaměřuje na úpravu závazkových právních poměrů s mezinárodním prvkem. V současnosti totiž nezřídka dochází k situaci, kdy je v závazkovém poměru přítomna určitá vazba na zahraničí, jako je obvyklé bydliště jeho subjektů v různých státech, jejich odlišná státní příslušnost či místo plnění závazku v zahraničí. Regulaci takových poměrů se věnují normy mezinárodního práva soukromého, jež mají v zásadě trojí původ - unijní, mezinárodní a vnitrostátní. Diplomová práce se tak zprvu věnuje základnímu pojmosloví v oblasti závazků. Vymezuje závazkový poměr, jejž diferencuje podle právního důvodu jeho vzniku na závazky smluvní a mimosmluvní, osvětluje pojem mezinárodního prvku a rozvádí metody úpravy vztahů s mezinárodním prvkem. Následně blíže rozebírá platnou právní úpravu smluvních závazků obsaženou v právu Evropské unie představovanou nařízením Řím I, multilaterálních smlouvách obsahujících přímé normy, jakož i dvoustranných smlouvách o právní pomoci. Pozornost je nicméně věnována též zbytkové úpravě v tuzemském prameni mezinárodního práva soukromého, kterým je ZMPS. Druhá část práce je zaměřena na o poznání užší, avšak se závazkovými poměry související, téma, jímž je přeshraniční...
|
|
|
Dobré mravy ve vztazích podnikatele
Kurník, Jan ; Čech, Petr (vedoucí práce) ; Černá, Stanislava (oponent)
Dobré mravy ve vztazích podnikatele Abstrakt Tato diplomová práce se zabývá konceptem dobrých mravů ve vztazích podnikatele. Cílem práce je přispět k hlubšímu pochopení role dobrých mravů v obchodních vztazích a poskytnout ucelený pohled na jejich význam a aplikaci v současném českém právním prostředí. Skrze analytický přístup k judikatuře, legislativě a teoretickým konceptům si klade za cíl poskytnout komplexní analýzu významu a uplatnění dobrých mravů v obchodních vztazích. Dobré mravy, s dlouhou tradicí sahající až do klasického římského práva, představují klíčový morální korektiv v právních vztazích, který se vyvíjel přes první republiku a Všeobecný občanský zákoník, až po současný občanský zákoník. Práce zkoumá, jak dobré mravy fungují jako nástroj k regulaci obchodních vztahů, přičemž se zaměřuje na konkrétní případy, kde byla mravnost jednání mezi podnikateli předmětem soudního posouzení. Práce začíná historickým exkurzem, který mapuje vývoj pojmu dobrých mravů od římského práva po současnost. Prostřednictvím rozsáhlé analýzy judikatury Ústavního a Nejvyššího soudu se práce snaží poskytnout komplexní pohled na to, jak dobré mravy formují vztahy mezi podnikateli a jak jsou reflektovány v současném právním řádu. Zvláštní pozornost je věnována vztahu mezi zásadami poctivého obchodního styku a dobrými...
|
|
| |
host ::
RSS.