|
|
Softwarové prostředky pro optimalizaci základních elektrolytů v elektroforéze
Hruška, Vlastimil ; Gaš, Bohuslav (vedoucí práce) ; Gebauer, Petr (oponent) ; Kašička, Václav (oponent)
il l li I L 1. Dosaženévýsledky I]áPlní. mÍdisertačnípníce byl výoj softwarových prostředků pro optimďizaci zríkladních gte\trotytů v elektrofoÉze,studium systémov1;crr i*t a obécnéieorle etett,omi|nce. Spolupracoval jsem na interpretaci amplitud a irogramováni výpočetního ;aora v p.offiuP:šYasler 5. Hlavní ruáplní mé pníceóyl výoj prog-nmu simut š. sehem .Ěr.o 'tuaii;,E. áo něj zabudoval mnoho nástrojů, které vyznamne roxiň;íjeho aplikaci' ota. pr.ogramy jsou s oblibou pouŽívány na mnoha univerziLách a pracovištích po celém světě. Předevšímprogram PeakMaster si získal velmi širokou ziíkladnu uživatelů, jak výzkumnftů používajícíchelektroforetické separačnímetody, tak z dalšíchanalytickýcň aisáprrn afty rychlému výpočnrpH libovolně složitých roztoků s velmi dobrou korekcí na ióntouou síu. Dále jsem spolupracoval na nďezení někteýh reálných systémů, které jsou za|oženy na linearizaci elektromigračního problému a vlastnostech systémo;ých píku jako napríkhd nalezeni oscilujícíchelektrolytů, systémůbez stacionámích systémovyďzon (d. bez regulačníchfunkcí) nebo využitísystémových píku v micelámírn prostředí ke zjišiěníCMC micel. V ruísledujícíchkapitolách kopírujícístÍukturu disertačnípn{ce budou knátce tvto komentovánv. t-
|
|
| |
|
| |
|
|
Matematické modelování lineárních a nelineárních jevů v kapilární elektroforéze
Dvořák, Martin ; Dubský, Pavel (vedoucí práce) ; Kašička, Václav (oponent) ; Gebauer, Petr (oponent)
Kapilární elektroforéza je jedna z předních analytických separačních metod. V současné době existuje řada počítačových programů, které jsou schopny předpovědět výsledek elektroforetického experimentu. Jde jednak o programy založené na numerickém řešení příslušných rovnic kontinuity a rovnic chemické rovnováhy a jednak o programy založené na aproximativních modelech kapilární elektroforézy. Programy z první skupiny jsou použitelné pro širokou škálu módů kapilární elektroforézy a poskytují přesné řešení. Jejich nevýhodou je však jejich značná časová náročnost. Aproximativní modely naopak dávají výsledek téměř okamžitě a navíc poskytují teoretické vztahy užitečné při optimalizaci separační metody. Tato disertační práce se zaměřuje na vylepšení a rozšíření oblasti platnosti stávajících aproximativních modelů kapilární elektroforézy. V rámci této práce je představen model vhodný pro plnohodnotný popis kapilární elektrokinetické chromatografie. Tento model je implementován do programu PeakMaster 6. Dále je pozornost věnována nelineárnímu modelu elektromigrace bez difúze. Tento model umožňuje velmi dobrý popis elektromigrační disperze včetně efektů spojených se vzájemnou interakcí mezi píky. Činí tak ovšem na úkor úplného zanedbání difúze. V této práci je nelineární model elektromigrace bez difúze...
|
|
|
Softwarové prostředky pro optimalizaci základních elektrolytů v elektroforéze
Hruška, Vlastimil ; Gaš, Bohuslav (vedoucí práce) ; Gebauer, Petr (oponent) ; Kašička, Václav (oponent)
il l li I L 1. Dosaženévýsledky I]áPlní. mÍdisertačnípníce byl výoj softwarových prostředků pro optimďizaci zríkladních gte\trotytů v elektrofoÉze,studium systémov1;crr i*t a obécnéieorle etett,omi|nce. Spolupracoval jsem na interpretaci amplitud a irogramováni výpočetního ;aora v p.offiuP:šYasler 5. Hlavní ruáplní mé pníceóyl výoj prog-nmu simut š. sehem .Ěr.o 'tuaii;,E. áo něj zabudoval mnoho nástrojů, které vyznamne roxiň;íjeho aplikaci' ota. pr.ogramy jsou s oblibou pouŽívány na mnoha univerziLách a pracovištích po celém světě. Předevšímprogram PeakMaster si získal velmi širokou ziíkladnu uživatelů, jak výzkumnftů používajícíchelektroforetické separačnímetody, tak z dalšíchanalytickýcň aisáprrn afty rychlému výpočnrpH libovolně složitých roztoků s velmi dobrou korekcí na ióntouou síu. Dále jsem spolupracoval na nďezení někteýh reálných systémů, které jsou za|oženy na linearizaci elektromigračního problému a vlastnostech systémo;ých píku jako napríkhd nalezeni oscilujícíchelektrolytů, systémůbez stacionámích systémovyďzon (d. bez regulačníchfunkcí) nebo využitísystémových píku v micelámírn prostředí ke zjišiěníCMC micel. V ruísledujícíchkapitolách kopírujícístÍukturu disertačnípn{ce budou knátce tvto komentovánv. t-
|
|
|
Dynamická enantioseparace v kapilární zónové elektroforéze
Dubský, Pavel ; Gaš, Bohuslav (vedoucí práce) ; Kašička, Václav (oponent) ; Gebauer, Petr (oponent)
32 4. ZÁVĚR V rámci diplomové práce byly vytvořeny programy EvalChir pro automatické vyhodnocení elučních profilů s platem a SimulChir pro nalezení zdánlivé rychlostní konstanty interkoncerze počítačovou simulací. Oba programy tak tvoří komplexní řešení pro rychlé a jednoduché vyhodnocení experimentálních dat získaných metodami dynamické enantioseparace. Byla vyvinuta nová metoda pro rozlišení všech čtyř lokálních konstant interkonveze zvlášť v achirální i chirální fázi systému (Obr. 1A). Metoda poskytuje novou možnost studia vlivu CS na rychlost interkonverze. Navržený postup byl úspěšně ověřen experimentálně. Byl navržen nový model popisující interakci analytu s libovolnou směsí CS, včetně interkonverze. Z modelu vyplývá, že jakýkoli multi-CS systém lze popsat vztahy formálně shodnými s popisem single-CS systémů (s jediným CS), pomocí souhrnné distribuční konstanty, souhrnné limitní mobility a souhrnné rychlostní konstanty interkonverze v chirálním prostředí směsi jako celku. Popis je možný dokonce i bez znalosti přesného složení směsi. Na druhou stranu model umožňuje předpovědět chování analytu ve směsi o známém složení. Model byl ověřen experimentálně a získané výsledky potvrdily tyto úvahy. V rámci tohoto modelu byla rovněž vysvětlena značná účinnost multi-CS enantioseparačních systémů mnohdy...
|
|
| |
|
|
Systémové zóny v kapilární elektroforéze
Riesová, Martina ; Gaš, Bohuslav (vedoucí práce) ; Kašička, Václav (oponent) ; Gebauer, Petr (oponent)
Martina Riesová Souhrn dizertační práce Kapilární elektroforéza je účinná, spolehlivá a rychlá separační metoda s nízkou spotřebou chemikálií a tedy i nízkými náklady na analýzu. Systémové zóny, které tato práce studuje, jsou nevyhnutelnou součástí každého elektroforetického systému a v nepříznivých případech mohou značně ovlivnit elektroforetické výsledky, znehodnotit je, nebo vést k jejich špatnému výkladu. Pomocí predikčních počítačových programů vystavěných na základě teoretického popisu elektromigrace lze v jednoduchých systémech dobře a spolehlivě předpovídat pozice systémových píků. Tato předpověď však nemusí být dostatečná a nemusí zaručit jednoznačnou identifikaci systémových píků v získaných záznamech. V rámci předkládané práce byl proto rozšířen současný teoretický model elektromigrace a vznikla nová verze 5.3 predikčního programu PeakMaster, která umožňuje předpovídat nejen pozice, ale i tvary a polarity systémových zón. Pomocí nového PeakMasteru 5.3 lze tak lépe předpovídat případnou interakci nebo překryv systémových píků s píky analytů a nově může být také optimalizováno složení vzorku právě s ohledem na polaritu a tvary systémových píků. Program PeakMaster má široké využití v běžné analytické praxi při efektivním výběru separačních systémů a predikce elektroforetických výsledků....
|
|
| |
|
| |
host ::
RSS.