|
|
Nové biologické markery u lymfoproliferativních onemocnění
Špaček, Martin ; Mandys, Václav (vedoucí práce) ; Smolej, Lukáš (oponent) ; Lysák, Daniel (oponent)
Nové biologické markery u lymfoproliferativních onemocnění Souhrn Prognóza pacientů s lymfoidními neopláziemi je extrémně variabilní. Spolehlivé prognostické markery mohou pomoci identifikovat skupiny pacientů, které mohou profitovat z odlišných přístupů. Virus Epsteina-Barrové (EBV) je asociován přibližně s jednou třetinou pacientů s Hodgkinovým lymfomem (HL). EBV-DNA je často přítomna v plazmě i plné krvi pacientů s EBV-asociovaným HL. Nicméně význam EBV-DNA monitorování je dosud nejasný. V souboru 165 dospělých pacientů s HL jsme prospektivně monitorovali nálož EBV-DNA. Naše výsledky ukázaly, že hodnocení EBV-DNA v plazmě by mohlo být využito k odhadu prognózy a při sledování pacientů s EBV-pozitivním HL. Role R72P polymorfismu genu TP53 byla analyzována v několika studiích u NHL, nikoli však dosud u HL. V naší práci jsme hodnotili roli R72P u 340 pacientů s NHL a 298 pacientů s HL. Naše výsledky ukázaly, že R72P není prognostický faktor u bělošských pacientů s NHL a že nemá vliv na vývoj či prognózu HL. Ve studii se 73 pacienty s chronickou lymfocytární leukemií jsme stanovovali mutační stav IgVH, mutaci genu TP53 a expresi CD38 a tyrozinkinázy ZAP-70. Celková konkordance mezi expresí ZAP-70 a mutačním stavem IgVH byla 85%. Validace flow cytometrické analýzy exprese ZAP-70 byla provedena srovnáním s...
|
|
|
Implementation of Immunohistochemical and Molecular-Genetic Methods in Differential Diagnosis of Urogenital and Gynecologic Tract Lesions
Ondič, Ondrej ; Hes, Ondřej (vedoucí práce) ; Mandys, Václav (oponent) ; Vernerová, Zdeňka (oponent)
Dizertačná práca je komentovaným súborom siedmich publikácií uverejnených v anglicky písaných impaktovaných časopisoch. Hlavnou témou je hľadanie optimálnej stratégie využitia imunohistochemických metód a metód molekulovej genetiky pri diagnostike zriedkavých a nových nádorov či podtypov nádorových jednotiek v gynekopatológii a aj v patológii urogenitálneho traktu. Ťažiskovou témou je gynekopatológia. Všeobecnejší úvod je výberovým náčrtom spôsobov akými patológovia môžu aplikovať metódy molekulovej genetiky vo výskume. Ciele práce stručne charakterizujú výskumné zámery jednotlivých projektov. Prvý predstavený projekt sa zaoberá histomorfologickou "mulleriánskou" variabilitou kožnej endometriózy. Nasleduje raritná kazuistika serózneho papilárneho borderline tumoru fimbrií tuby s analýzou prítomnosti mutácií génov KRAS, BRAF a p53. Prospektívna longitudinálna štúdia ťažkej dysplázie dlaždicového epitelu (HSIL) krčka maternice u HPV vakcinovaných žien sa snaží odhaliť príčiny tohoto fenoménu. Ďalšie dve štúdie sa zaoberajú incidenciou fumarát hydratáza (FH) deficientných leiomyómov maternice a syndrómu hereditárnej leiomyomatózy a renálneho karcinómu (HLRCC) s cieľom prispieť k zlepšeniu diagnostiky a zvýšiť záchytnosť tohoto syndrómu. Napokon je v podobe dvoch publikácií predstavená bizarná...
|
|
|
Molekulární genetika nádoru urogenitálního traktu a jeji vztah k biologickému chování
Pivovarčíková, Kristýna ; Hes, Ondřej (vedoucí práce) ; Mandys, Václav (oponent) ; Vernerová, Zdeňka (oponent)
Disertační práce je komentovaným souborem sedmi v anglické literatuře publikovaných prací zabývajících se problematikou molekulární genetiky nádorů urogenitálního traktu. Při velkém množství současných poznatků v tomto odvětví a při širokém spektru urogenitálních lézí je pak tato dizertační práce blíže zaměřena zejména na současný pohled na renální neoplásie charakterizované predominantně papilárním typem růstu. Po obecném úvodu jsou blíže prezentovány jednotlivé renální neoplasie s papilární morfologií, specifikovány jsou jejich morfologické, imunohistochemické a molekulárně-genetické vlastnosti, komentována je jejich diferenciální diagnostika. Ve výsledcích jsou představeny recentně publikované novinky v morfologickém spektru těchto lézí, poznatky o heterogenitě výsledků molekulárně genetických metod u jednotlivých nádorových jednotek, zmíněna jsou úskalí běžné diagnostické praxe, komentován je též prognostický význam těchto lézí. Závěrem je zhodnocen a komentován klinický dopad a užití těchto poznatků v běžné praxi.
|
|
|
Diferenciální diagnostika vřetenobuněčných lézí trávicího traktu
Daum, Ondřej ; Hes, Ondřej (vedoucí práce) ; Mandys, Václav (oponent) ; Ehrmann, Jiří (oponent) ; Zámečník, Josef (oponent)
MUDr. Ondřej Daum DIFERENCIÁLNÍ DIAGNOSTIKA VŘETENOBUNĚČNÝCH LÉZÍ TRÁVICÍHO TRAKTU DIFFERENTIAL DIAGNOSTICS OF SPINDLE CELL LESIONS OF THE DIGESTIVE TRACT UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE LÉKAŘSKÁ FAKULTA V PLZNI Šiklův ústav patologie FN a LF UK Plzeň, 2006 1 Dizertační práce byla zpracována v rámci kombinované formy postgraduálního studia na Šiklově ústavu patologie FN a LF UK v Plzni v letech 2004-2006. Doktorand: MUDr. Ondřej Daum Školitel: Doc. MUDr. Ondřej Hes, PhD. docent Lékařské fakulty UK, Šiklův ústav patologie FN a LF UK v Plzni Oponenti: Prof. MUDr. Václav Mandys, CSc. přednosta Ústavu patologie FN Královské Vinohrady a 3. LF UK v Praze Doc. MUDr. Jiří Ehrmann, PhD. docent Lékařské fakulty UP, Ústav patologie FN a LF UP v Olomouci Doc. MUDr. Josef K. Zámečník, PhD. docent Lékařské fakulty UK, Ústav patologie FN Motol a 2. LF UK v Praze Stanoviska k dizertaci vypracovala Lékařská fakulta UK v Plzni. Autoreferát byl odeslán dne .......................................................... Obhajoba se koná dne .................................... 2007 v ....................... hod. před komisí pro obhajoby doktorských dizertací v oboru patologická anatomie v...................................................................................................... S dizertační prací je možné se seznámit na...
|
|
|
The role of selected molecules in biologic behaviour of human breast cancer
Gojiš, Ondřej ; Mandys, Václav (vedoucí práce) ; Kolář, Zdeněk (oponent) ; Kinkor, Zdeněk (oponent)
The role of selected molecules in biologic behaviour of human breast cancer Abstrakt Ondřej Gojiš V různých imunohistochemických studiích kracinomu prsu se neshoda mezi primárním a sekundárním ložiskem v detekci estrogenového receptoru pohybuje od 28 do 42%, u progesteronového receptoru kolem 17% a u Her2 receptoru se neshoda exprese pohybuje mezi 0-37%. Předcházející práce prokázaly, že Pax2 soutěží s SRC-3 o regulaci Her2 v transkripčním procesu. Karcinomy prsu, které vykazovaly Pax2 pozitivitu a SRC-3 negativitu, měly nízké riziko relapsu onemocnění. Tento poznatek naznačuje možnost dvou "subtypů" karcinomu prsu: pozitivní pro ER a pozitivní pro Her2. V první studii byl chrakterizován imunohistochemický profil SRC3, Pax2, ER, PgR, Her2, CK5/6, Ki67, EGFR u 30 metastatických cerebrálních ložisek karcinomu prsu. SRC-3 byl pozitivní v 66,6% případů a Pax2 v 73,3%. Vztah mezi imunohistochemickým nálezem, věkem pacientky, gradem nádoru, histologickým typem a metastatickým postižením lymfatických uzlin byl statisticky nevýznamný. Při hodnocení přítomnosti sledovaných znaků v primárním tumoru a sekundárním metastatickém ložisku se proteinová exprese lišila v 93%. U SRC-3 byl stejný imunohistochemický nález v 71% a u Pax2 v 50% vzorků. Při porovnávání primárního nádoru a metastatického ložiska byl největší...
|
|
|
Srovnání morfologie, exprese, epigenetických změn a mutací HNF1B v solidních nádorech a nenádorových lézích.
Bártů, Michaela ; Dundr, Pavel (vedoucí práce) ; Mandys, Václav (oponent) ; Škarda, Jozef (oponent)
Úvod HNF1B je tkáňově specifický transkripční faktor, který hraje zásadní roli v embryonálním vývoji celé řady orgánů, zejména ledvin, gastrointestinálního systému, pankreatu a žlučových cest. Zatímco význam HNF1B pro vznik vývojových malformací ledvin a dalších orgánů již byl poměrně dobře popsán, jeho uplatnění v patogenezi solidních nádorů dosud nebylo objasněno. Dle dostupných dat se ukazuje, že HNF1B se v závislosti na různých typech nádorů pravděpodobně může na procesu karcinogeneze podílet buď jako onkogen, nebo jako tumorsupresor. Přesný mechanismus, jakým tuto svoji roli uplatňuje, ovšem není jasný. Cíle: Práce je zaměřená na prohloubení znalostí o významu změn HNF1B u vybraných solidních nádorů i nenádorových lézí. Jednotlivé cíle zahrnují: 1) objasnění role, kterou HNF1B hraje v patogenezi těchto lézí, 2) zhodnocení možného významu HNF1B pro diferenciální diagnostiku jednotlivých lézí, 3) analýzu možného prognostického a prediktivního významu HNF1B, 4) mutační analýzu genu HNF1B u všech nádorových i nenádorových tkání s cílem identifikovat dosud nepopsané somatické patogenní mutace, 5) metylační analýzu promotoru genu HNF1B. Materiál a metody: Imunohistochemické vyšetření s protilátkou proti HNF1B bylo provedeno u celkem 516 vzorků nádorové a nenádorové tkáně. Mutační analýzy zahrnovaly...
|
|
|
The Study of Expression and Function of Selected Nuclear Receptors in Caenorhabditis Elegans
Vohánka, Jaroslav ; Kostrouchová, Marta (vedoucí práce) ; Nedvídek, Josef (oponent) ; Mandys, Václav (oponent)
5 Abstrakt: V genomu Caenorhabditis elegans je více než 280 jaderných hormonálních receptor (NHRs) v porovnání se 48 jadernými receptory u člov ka a 18 jadernými receptory u octomilky (Drosophila). V tšina jaderných hormonálních receptor u C. elegans pat í do skupiny suplementárních (podp rných) jaderných receptor (supnrs), které vznikly následnou duplikací jednoho p vodního genu. Evoluční tlak, který vedl ke zmnožení jaderných hormonálních receptor u nematod, stejn tak i funkce v tšiny supnrs nejsou známé. V této práci byla studována exprese sedmi gen organisovaných v klastru na chromosomu V: nhr- 206, nhr-208, nhr-207, nhr-209, nhr-154, nhr-153 a nhr-136. Metodou reverzní transkripce-kvantitativní PCR a použitím transgenních linií nesoucích f zní geny (obsahující pravd podobné promotory) s GFP bylo zjišt no, že všech sedm gen tohoto klastru je exprimováno a p t z t chto gen má částečn se p ekrývající expresní profil. Exprese byla lokalizována v jícnu, ve st ev , v určitých neuronech, v análním sv rači a v samčích specifických bu kách. ýty i geny v tomto klastru jsou zachovány u C. elegans a u C. briggsae, zatímco t i geny jsou p ítomné pouze u C. elegans, což ukazuje na pom rn nedávnou genovou expanzi. V naší práci jsme zjistili, že jak část zachovaných tak všechny nezachované geny v tomto klastru...
|
|
|
Diagnostický příspěvek k hodnocení intervenčních modelů léčby diabetu mellitu 1. typu
Zacharovová, Klára ; Saudek, František (vedoucí práce) ; Plecitá, Lydie (oponent) ; Mandys, Václav (oponent)
Při imunointervenční či transplantační léčbě diabetu je nutné monitorovat ukazatele imunitní nebo rejekční destrukce přežívající inzulín produkující tkáně. Disertační práce si klade za cíl zlepšit možnosti sledování průběhu autoimunitního procesu a in vivo průkazu přežívání transplantovaných Langerhansových ostrůvků. Dílčí úkoly zahrnovaly průkaz vitality izolovaných ostrůvků určených k transplantaci měřením respirační aktivity, objasnění průběhu in vitro značení izolovaných ostrůvků superparamagnetickou kontrastní látkou pro následné zobrazení pomocí magnetické rezonance a sledování transportu této látky po transplantaci. Pro identifikaci kontrastních částic v histologickém materiálu jsme studovali nově připravenou paramagnetickou kontranstní látku s navázaným fluoresceinem. Dále jsme se zaměřili na hodnocení autoimunitního procesu pomocí sledování cytokinové odpovědi na specifickou stimulaci autoantigenem. Autoimunitní poškození beta buněk v experimentu u myší jsme se snažili ovlivnit polyklonálními anti-thymocytárními protilátkami. Nová metoda testování respirační aktivity ostrůvků dobře korelovala s ostatními metodami testování kvality ostrůvků a byla navržena do diagnostického schématu před klinickou transplantací. Při studiu intercelulárního transportu železitých kontrastních látek jsme...
|
|
|
Dipeptidylpeptidáza IV v ortotopických modelech gliomu
Hilšer, Marek ; Šedo, Aleksi (vedoucí práce) ; Mandys, Václav (oponent) ; Šefc, Luděk (oponent)
Maligní gliomy se řadí mezi vysoce agresivní nádorová onemocnění. Průměrná doba přežití pacientů nepřesahuje 15 měsíců. Přes intenzivní výzkum se dosud nedaří nalézat terapeutické strategie, které by významným způsobem prodloužily život postižených tímto onemocněním. Jednu z oblastí výzkumu možného terapeutického zacílení v onkologické léčbě představují proteázy buněčného povrchu. Do této skupiny proteinů patří i dipeptidylpeptidáza IV (DPP-IV). Změna exprese DPP-IV byla prokázána v různých typech nádorových onemocnění a také v maligních gliomech. Poznání role DPP-IV v biologických procesech tohoto maligního onemocnění může přispět k rozvoji nových terapeutických modalit. Cílem této dizertační práce bylo zavést xenograftový ortotopický model gliomu a geneticky modifikovaný model gliomu (genetically engeneered model, GEM). Dále jsme zkoumali vliv DPP-IV na růst experimentálního gliomu a zaměřili se na rozlišení podílu jejího katalytického a nekatalytického mechanismu v tomto procesu. V GEM modelu jsme sledovali enzymovou aktivitu a distribuci DPP-IV. Pro intraexperimentální sledování dynamiky růstu experimentálních gliomů jsme testovali vhodnost neinvazivní fluorescenční zobrazovací metody. Výsledky práce ukázaly, že DPP-IV negativně ovlivňovala růst gliomu v xenograftovém ortotopickém modelu. Tento...
|
|
|
Exprese miRNA v adenokarcinomu pankreatu-vztah k morfologickým charakteristikám a prognóze onemocnění.
Szabó, Arpád ; Mandys, Václav (vedoucí práce) ; Hermanová, Markéta (oponent) ; Daum, Ondřej (oponent)
Duktální adenokarcinom (PDAC) je nejčastějším primárním nádorem pankreatu. Jeho nepříznivá prognóza je dána mimo jiné i tím, že je často diagnostikován až v inoperabilním pozdním stadiu a navíc vykazuje vysokou chemorezistenci. Pro možnost časnější diagnózy PDAC a tím zlepšení prognózy nemocných jsou hledány nové biomarkery, mezi které patří mimo jiné i microRNA (miRNA), krátké nekódující RNA molekuly, zapojené do post- transkripční regulace genové exprese. Na rozdíl od jiných RNA jsou molekuly miRNA v biologických vzorcích stabilní. Jejich expresi je možné stanovit prostřednictvím více analytických metod, například kvantitativní real-time PCR (RT-qPCR). Pro normalizaci metod požívaných pro zjištění hladiny miRNA je nutné použít vhodné endogenní kontroly. Variabilní exprese endogenních kontrol však může znamenat určitou nejistotu při kvantifikaci exprese miRNA. Cílem první práce byly analýza exprese šesti miRNA, izolovaných z parafínových bloků (FFPE) biopticky vyšetřených PDAC a určení optimální vnitřní kontroly. Při normalizaci výsledků RT-qPCR byly hodnoceny čtyři interní kontroly: arteficiální spike miR-39 od C. elegans, U6 snRNA, miR-16 a snoRNA U91. Hodnoty exprese všech sledovaných miRNA byly v nádorech signifikantně odlišné v závislosti na zvolené vnitřní kontrole. Mimo to vykazovala...
|
host ::
RSS.