|
Generation and analysis of double deficient transgenic mice for kallikrein-related peptidase 5 and kallikrein-related peptidase 14
Hanečková, Radmila ; Sedláček, Radislav (vedoucí práce) ; Fulková, Helena (oponent)
Peptidázy příbuzné kalikreinu (KLK) představují vysoce konzervovanou rodinu serinových pro- teáz. In vitro experimenty naznačují, že KLK peptidázy hrají důležitou roli v řadě fyziologických a patofyziologických procesů. Jejich úloha in vivo ovšem zůstává ne zcela probádaná, částečně i kvůli nedostatku vhodných zvířecích modelů. Cílem této práce je příprava myšího modelu dvojnásobně deficientního na KLK5 a KLK14. Předpokládá se, že KLK5 a KLK14 jsou součástí proteolytických sítí v pokožce, které jsou významné pro udržení homeostáze kůže. Ovšem myší modely deficientní pouze na KLK5 nebo KLK14 vykazují jenom minimální či žádný fenotyp, pravděpodobně kvůli vzájemné funkční kompenzaci na základě podobné substrátové specifity. V této práci popisujeme úspěšné vytvoření myši dvojnásobně deficientní na KLK5 a KLK14. Dvojnásobně deficientní myši nelze snadno získat křížením kvůli přítomnosti genů pro Klk5 a Klk14 ve stejném lokusu na chromozomu 7, proto k tvorbě myšího modelu používáme TAL efektor nukleázy (TALENy) cílené na Klk14, které aplikujeme mikroinjekcí TALENové mRNA do KLK5-deficientních zygot. Dále ukazujeme, že myši dvojnásobně deficientní na KLK5 a KLK14 jsou životaschopné a plodné. Domníváme se, že tyto nové myší modely mohou sloužit jako užitečný experimentální nástroj ke studiu KLK5 a KLK14 in vivo.
|
|
Staticky neurčité prutové soustavy
Sedláček, Radek ; Řehák, Kamil (oponent) ; Florian, Zdeněk (vedoucí práce)
Bakalářská práce je zaměřena na řešení prutových soustav a to především staticky neurčitých. Nejprve je uveden teoretický základ prutových soustav, dále popis vybraných metod pro řešení staticky určitých prutových soustav a následně popis metod pro řešení staticky neurčitých prutových soustav, které jsou demonstrovány na vzorových příkladech. Účelem práce je posoudit možnosti využití metod řešení staticky neurčitých prutových soustav v dnešní době, čemuž je věnován závěr.
|
|
Návrh a implementace komunikačního serveru
Sedláček, Robert ; Kenyeres, Martin (oponent) ; Škorpil, Vladislav (vedoucí práce)
Tato práce se v první části zabývá analýzou proprietárního průmyslového protokolu S7 firmy Siemens. Analýza je provedena za pomoci programu Wireshark mezi programovatelným automatem S7-1200 a OPC serverem Simatic NET. Tento protokol je založen na dalších protokolech, jejichž návrhy a řešení jsou v této práci zcela nebo alespoň částečně popsány. Na základě zjištěných informací je vytvořena komunikační knihovna v jazyce C++, jež umožňuje přenos proměnných. Tato knihovna je následně využita při implementaci komunikačního serveru s jehož pomocí je možné pohodlně přistupovat k proměnným v programovatelném automatu za pomoci textového protokolu.
|
|
Novostavba rodinného domu
Sedláček, Radek ; Pospíšil, Jaroslav (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Předmětem této bakalářské práce je návrh novostavby jednopodlažního rodinného domu s podkrovím v obci Velké Karlovice. Objekt má tři bytové jednotky a je navržen pro trvalé bydlení 10 – 12 osob. Rodinný dům je umístěn na mírně svažitém pozemku na okraji obce Velké Karlovice. Součástí objektu je i garáž pro tři osobní vozidla. Hlavní vstup a vjezd je orientován k hlavní silnici. Dům má půdorysné rozměry 9,5 × 25 m. Svislé nosné konstrukce jsou navrženy z keramických tvárnic systému Porotherm. Strop nad 1. NP je navržen ze systému Spiroll. Schodiště je řešeno jako prefabrikovaná železobetonová konstrukce. Objekt je zastřešen sedlovou střechou tvořenou vaznicovou soustavou. Součástí bakalářské práce je výkresová dokumentace pro provedení stavby, výkresy konstrukčních detailů, požární, tepelně technické a akustické posouzení objektu. Výkresová část byla zpracována v programu AutoCAD.
|
|
Novostavba penzionu ve Velkých Karlovicích
Sedláček, Radek ; Nováková, Eva (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Předmětem této diplomové práce je návrh novostavby dvoupodlažního penzionu s podkrovím v obci Velké Karlovice. Objekt má osm ubytovacích jednotek a je navržen pro přechodné ubytování pro maximálně 20 osob. Penzion je umístěn na rozsáhlém a téměř rovinném pozemku na parcele č. 3640/1. Penzion je samostatně stojící. Hlavní vstup a příjezd je orientován v severní části objektu. Dům má půdorysné rozměry 9,5×15 m a 10×15m. Svislé nosné konstrukce jsou navrženy z keramických tvárnic systému Porotherm. Strop nad 1. NP je navržen ze systému Spiroll. Schodiště je řešeno jako prefabrikovaná železobetonová konstrukce. Objekt je zastřešen sedlovou střechou tvořenou vaznicovou soustavou.
|
|
Tvorba výpočtového modelu pro deformačně napěťovou analýzu prvků generátoru
Sedláček, Radek ; Fučík, Karel (oponent) ; Návrat, Tomáš (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá tvorbou výpočtového modelu pro deformačně napěťovou analýzu prvků generátoru. Výpočtový model je parametrický a umožňuje použití různých variant geometrie hřídele i rotorových plechů. Parametrický výpočtový model v APDL jazyce se sestaví v přiloženém sešitu softwaru MS Excel po zadání vstupních hodnot. Po výpočtu v programu ANSYS 14.5 jsou výsledky importovány do sešitu Excelu k dalšímu zpracování a následnému vyhodnocení úlohy.
|
| |
|
Functional analysis of posttranscriptional gene regulation by TENT5A in biomineralization and metabolism
Aranaz Novaliches, Goretti ; Sedláček, Radislav (vedoucí práce) ; Hovořáková, Mária (oponent) ; Tencerová, Michaela (oponent)
Nekanonické poly-A polymerázy, jako je TENT5A, patří do rodiny terminálních nukleotidyltransferáz (TENT) a mají zásadní význam pro ochranu, stabilitu a translaci mRNA. V naší laboratoři byl vytvořen knock-out (KO) model myši Tent5a, který vykazoval fenotyp v oblasti zubů, struktury kostry a metabolismu. Ve svém doktorském projektu jsem se zaměřila na charakterizaci molekulárního mechanismu, který je základem těchto fenotypů, a na zkoumání jejich potenciální souvislosti se vzácnými lidskými chorobami. Zaměřila jsem se na biologickou funkci genu Tent5a při vývoji skloviny (amelogenezi) a stabilizaci mRNA. Mikrotomografie (μCT) a skenovací elektronová mikroskopie odhalily, že Tent5a KO jedinci vykazují tenkou hypomineralizovanou sklovinu s narušenou mikrostrukturou, což je stav známý jako Amelogenesis imperfecta. Přímé sekvenování mRNA prokázalo, že TENT5A je zodpovědný za polyadenylaci amelogeninu (AmelX) a dalších vylučovaných proteinů, což vede ke zkrácení poly-A konce u ameloblastů Tent5a KO myší. U Tent5a KO jedinců byla navíc zjištěna porucha samo sestavování proteinů sklovinné matrix (EMP), jako je AMELX a ameloblastin (AMBN), což vedlo ke zhoršenému ukládání hydroxyapatitu a ovlivnění tvorby skloviny. Kromě úlohy v zubech jsem zkoumala fyziologické funkce EMP v jiných tkáních vzhledem k tomu,...
|
|
4th CCP Phenogenomics Conference abstract book
Sedláček, Radislav
The fourth CCP Phenogenomics Conference was held as a hybrid meeting. The scientific committee selected the topic of rare diseases: experimental models & delivery of therapies as the main thematic focus of the 2022 Conference. The Conference provided again an excellent opportunity to support networking and interactions among the researchers, CCP staff, users and experts from the commercial sector.
|
|
Mouse models for Angelman syndrome: generation and characterization
Syding, Linn Amanda ; Sedláček, Radislav (vedoucí práce) ; Vyklický, Ladislav (oponent) ; Valeš, Karel (oponent)
Angelmanův syndrom (AS) je neurovývojové onemocnění s celosvětovou incidencí 1:10 000, vyskytuje se tedy u 40 000 porodů ročně, poměr mezi pohlavími je stejný. Mezi klíčové charakteristiky onemocnění patří ataktická chůze s třesem, těžká mentální retardace, těžké poruchy řeči a záchvaty. U postižených jedinců se také vyskytují behaviorální deficity, jako je zvýšená úzkost a poruchy autistického spektra. Onemocnění pochází z imprintované oblasti 15q11.2-13q, kde jsou geny exprimovány buď maternálně, nebo paternálně jako výsledek exprese alel specifické pro rodiče. Existují čtyři hlavní genetické mutace způsobující AS, a to i) velká delece v rozsahu 4- 6 Mb na alele zděděné maternálně včetně imprintovaných a bialelicky exprimovaných genů, ii) delece maternálního původu v genu Ubitiquin ligázy E3 (UBE3A), iii) paternální uniparentální disomie a iv) defekt imprintingu vedoucí k nevhodné metylaci lokusu. Dosud neexistuje žádný lék na AS, spíše se symptomy zmírňují pomocí multidisciplinárního přístupu. Cílem doktorského studia bylo dále dešifrovat roli UBE 3A a GABRA5 pomocí dvou myších modelů s cílem získat více znalostí o zapojení těchto dvou genů do generování modelů pro budoucí terapeutické intervence. Jedním vytvořeným modelem byla úplná genová delece Ube3a z 5'UTR do 3'UTR zahrnující přibližně 76...
|