Název:
Vyhledávání LTR retrotranspozonů v lidském genomu
Překlad názvu:
Identification of LTR retrotransposons in human genome
Autoři:
Trott, Eduard ; Maděránková, Denisa (oponent) ; Sedlář, Karel (vedoucí práce) Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2016
Jazyk:
eng
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [eng][cze]
Cílem této práce je zpracování literární rešerše na téma vyhledávání LTR retrotranspozonů v lidském genomu. Práce popisuje možné problémy spojedné s danou tématikou a obsahuje implementaci nového vhodného algoritmu pro vyhledávání. Výsledky tohoto algoritmu, obsahující všechny nalezené LTRs byly statisticky porovnány s existujícími algoritmy pro vyhledávání nových retroelementů.
The goal of this thesis is to provide a literature review on methods for searching of LTR retrotransposons in the human genome. The thesis characterizes the potential problems related to a given topic and provides implementation of novel suitable searching algorithm. The result of algorithms containing all found LTRs were statistically compared with several existing tools for de novo identification of retroelements.
Klíčová slova:
de novo; long terminal repeat; LTR; retrotransposon; LTR; retrotranspozony
Instituce: Vysoké učení technické v Brně
(web)
Informace o dostupnosti dokumentu:
Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT. Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/61691