Název: Výskyt rezistence ke kolistinu u izolátů klinicky významných enterobakterií
Překlad názvu: Colistin resistance in clinically important Enterobacteriaceae
Autoři: Smělíková, Eva ; Tkadlec, Jan (vedoucí práce) ; Ježek, Petr (oponent)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2020
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Kolistin je rezervním antibiotikem pro léčbu závažných infekcí způsobených bakteriemi z čeledi Enterobacteriaceae a jinými gramnegativními bakteriemi vykazujícími mnohočetnou rezistenci k antibiotikům. Nedávno objevená plazmidově vázaná rezistence ke kolistinu mediovaná geny mcr však představuje vážné riziko omezení jeho použití. V předkládané diplomové práci byl kombinací selektivní kultivace a qPCR mapován výskyt Enterobacteriaceae nesoucích geny mcr-1-8 u hospitalizovaných pacientů, cestovatelů, klinických izolátů rezistentních ke kolistinu a v retrospektivní sbírce klinických izolátů enterobakterií. Izoláty nesoucí geny mcr byly charakterizovány celogenomovým sekvenováním. Byla určena lokalizace genů mcr, identifikovány další geny rezistence a přítomné plazmidy. Byl charakterizován fyziologický profil vybraných izolátů Escherichia coli a bylo zjištěno, že za přítomnosti subinhibičního množství kolistinu může být favorizován kmen nesoucí gen mcr-1. V průběhu řešení diplomové práce byl popsán také gen mcr-9, jehož výskyt byl následně retrospektivně otestován. Izoláty Enterobacter spp. s detekovaným genem mcr-9 byly většinou ke kolistinu citlivé, avšak v několika případech bylo možné rezistenci indukovat expozicí subinhibičním dávkám kolistinu. Výsledky diplomové práce ukazují, že výskyt plazmidově vázané... Colistin is a last-resort antibiotic used to treat serious infections caused by Enterobacteriaceae and other multidrug resistant gram-negative bacteria. Recently discovered plasmid-borne colistin resistance, mediated by the mcr genes, poses a serious risk to colistin therapy. The aim of this diploma thesis was to map the occurrence of Enterobacteriaceae carrying the mcr-1 to 8 genes in hospitalized patients, travellers, prospective colistin-resistant clinical isolates and in a retrospective collection of Enterobacteriaceae using a combination of selective cultivation and qPCR. Isolates with a detected mcr gene were characterized by Whole-Genome Sequencing. The localization of mcr genes was determined and other resistance genes and plasmids were identified. Furthermore, the physiological profile of selected colistin- resistant Escherichia coli isolates was characterized. In the presence of a subinhibitory amount of colistin, a strain carrying the mcr-1 gene may be favored. Later, the mcr-9 gene was described and its occurence was subsequently tested retrospectively. Enterobacter spp. isolates carrying the mcr-9 gene were mostly colistin-sensitive but, in some cases, resistance was induced after exposure to sublethal doses of colistin. The results of the study show that the incidence of plasmid-mediated...
Klíčová slova: antibiotika; enterobakterie; kolistin; mcr; plazmid; polymyxiny; rezistence; Antibiotics; Colistin; Enterobacteriaceae; mcr; Plasmid; Polymyxins; Resistance

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/123096

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-436711


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce