Název:
Molekulární charakterizace a hodnocení genetické diverzity genových zdrojů máku
Překlad názvu:
Molecular characterization and evaluation of genetic diversity of genetic resources of poppy seeds
Autoři:
STARÁ, Martina Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2019
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Tato diplomová práce se zabývá studiem genových zdrojů máku setého (Papaver somniferum L.) pomocí SSR analýzy. Celkem bylo hodnoceno 85 vzorků. DNA byla izolována ze sušeného, směsného vzorku vypěstovaného z osiva, poskytnutého VÚO Opava, pomocí modifikované metody CTAB podle Doyle and Doyle (1990). Pro analýzu bylo vybráno šest SSR primerů, vizualizace probíhala pomocí čipové elektroforézy. Byla provedena optimalizace PCR reakce s fluorescenčně značeným primerem pro fragmentační analýzu. Data z čipové elektroforézy byla vyhodnocena v programu MVSP za použití PCO analýzy. Nadále byla vypočtena matice podobnosti, ze které bylo zřejmé, že vzorky vykazují vysokou genetickou variabilitu. Výsledky matice podobnosti byly poskytnuty šlechtitelům jako podklad pro další šlechtění.The thesis deals with the study genetic diversity of poppies (Papaver somniferum L.) by SSR analysis. Altogether, 85 samples of poppies were evaluated. DNA was isolated from dried, mixed samples grown from seed using a modified CTAB method by Doyle and Doyle (1990). The seeds were provided by VÚO Opava. Six SSR primers were selected for the analysis and visualization was performed using chip electrophoresis. The PCR reaction was optimized with fluorescently labeled primer for fragmentation analysis. Chip electrophoresis was evaluated in MVSP using PCO analysis. The similarity matrix was further calculated and the samples showed hight genetic variability. The results of similarity matrix were provided to breeders as a basis for further breeding.
Klíčová slova:
mikrosatelity; molekulární markery; mák setý (Papaver somniferum L.); microsatellites; molecular markers; poppy (Papaver somniferum L.) Citace: STARÁ, Martina. Molekulární charakterizace a hodnocení genetické diverzity genových zdrojů máku. České Budějovice, 2019. diplomová práce (Ing.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Fakulta zemědělská a technologická
Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
(web)
Informace o dostupnosti dokumentu:
Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU. Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/53846