Název: Formování sestřihového komplexu v kontextu buněčného jádra
Překlad názvu: Formation of splicing machinery in the context of the cell nucleus
Autoři: Stejskalová, Eva ; Staněk, David (vedoucí práce) ; Vanáčová, Štěpánka (oponent) ; Malínský, Jan (oponent)
Typ dokumentu: Disertační práce
Rok: 2015
Jazyk: eng
Abstrakt: [eng] [cze]
Most of the protein coding genes of higher eukaryotes contain introns which have to be removed from primary transcripts to make mRNA which can be used as a template for protein synthesis. This crucial step in the pre-mRNA processing is carried out by the spliceosome, a complex ribonucleoprotein machine formed from small ribonucleoprotein particles (snRNPs). snRNPs biogenesis is a complex process composed of several steps which take place in both the cytoplasm and the nucleus. Spliceosome assembly is highly dynamic and tightly regulated and pre-mRNA splicing depends not only on the sequence of the pre-mRNA itself but also on the nuclear context, such as the chromatin modifications. How do cells regulate where and when the spliceosome would be assembled? What determines which introns will be spliced? These are fundamental, yet unanswered, biological questions. In this work we analyzed the formation of splicing machinery in the context of the cell nucleus from several different points of view. First, we investigated the unexpected connection between splicing factor U1-70K and the survival of motor neurons (SMN) complex which is a major player in the snRNP biogenesis pathway. We revealed that U1-70K interacts with the SMN complex and that this interaction is crucial for the stability of nuclear gems, small... Většina genů kódujících proteiny vyšších eukaryot obsahuje introny, které musí být odstraněny z primárních transkriptů. Vznikající mRNA může být poté použita jako templát pro syntézu proteinů. Sestřih intronů probíhá za pomoci složitého sestřihového komplexu, který se skládá z malých jaderných ribonukleoproteinových částic. Tyto částice vznikají během několika postupných kroků, které se odehrávají jak v jádře, tak v cytoplazmě. Sestřihový komplex se poté postupně skládá na molekule pre- mRNA. Jedná se o velmi dynamický a přesně regulovaný proces, který závisí nejen na sekvenci samotné pre-mRNA, ale záleží i na stavu celého jádra, např. na modifikacích chromatinu. Mezi základní nezodpovězené biologické otázky patří například: Jak buňky řídí, kdy a kde se sestřihový komplex poskládá? Co předurčuje, které introny budou vystřiženy? V této práci zkoumáme sestřihový komplex a jeho skládání v kontextu buněčného jádra z několika různých úhlů pohledu. Za prvé se věnujeme neočekávané souvislosti mezi sestřihovým faktorem U1-70K a komplexem SMN (z angl. survival of motor neurons), který je hlavním účastníkem biosyntetické dráhy malých jaderných ribonukleoproteinových částic. Podařilo se nám odhalit, že protein U1-70K interaguje s komplexem SMN a že tato interakce je klíčová pro stabilitu gems, malých nemembránových...
Klíčová slova: buněčné jádro; fluorescenční mikroskopie; pre-mRNA sestřih; sestřihový komplex; cell nucleus; fluorescence microscopy; pre-mRNA splicing; spliceosome

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/67001

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-336136


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Disertační práce